TkA07G021470 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G021470

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 5830344-5831273 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

900 bp · TkA07G021470|TK1151|cDNA

ATGTTGGAGAGATGTGGGTTAGGGGGAAGTGGGTATAATGTGACTAAAAGCTTGCACGCCACGTGTGGGGTTCAGCTGCCGGTGCCAGTGCCGGCGGCGACCGCCGTGAACTCCAGTTGGATCGGTTACGTCGCGGTTTGCAACGACGAAGAAGAGATCGCGAGATTAGGCCGGAGAGACGTAGTGATTGCGTACAGGGGAACCGCCACGTGTCTTGAGTGGGTCGAGAATCTACGAGCCACGTTAACATCGTTGCCGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

900 bp · TkA07G021470|TK1151|CDS

ATGTTGGAGAGATGTGGGTTAGGGGGAAGTGGGTATAATGTGACTAAAAGCTTGCACGCCACGTGTGGGGTTCAGCTGCCGGTGCCAGTGCCGGCGGCGACCGCCGTGAACTCCAGTTGGATCGGTTACGTCGCGGTTTGCAACGACGAAGAAGAGATCGCGAGATTAGGCCGGAGAGACGTAGTGATTGCGTACAGGGGAACCGCCACGTGTCTTGAGTGGGTCGAGAATCTACGAGCCACGTTAACATCGTTGCCGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

299 aa · TkA07G021470|TK1151|PROTEIN

MLERCGLGGSGYNVTKSLHATCGVQLPVPVPAATAVNSSWIGYVAVCNDEEEIARLGRRDVVIAYRGTATCLEWVENLRATLTSLPNDVAGERKKAMVQKGFLSMYTTATPTCPSLRDMVREEIARIIGKYGDEPLSVTITGHSLGAALATLTAYDITSKFKQSPMVTVVSFGGPRVGNRNFRSQLENSGTRILRIVNSTDVITKVPGFLVDDSSGISASKVHRVEESDWFRYADVGKELRLCSNASPYLTRSDFATCHD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G021470`
TK1151 ID	TkA07G021470
OH-1004 ID	LXL04_026964
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	95.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 70.872 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G021470

位置 Chr07:5830344-5831273 (-)

描述 Similar to DAD1: Phospholipase A(1) DAD1, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g44810`	Sn-1 特异性磷脂酶，可从磷脂中释放游离脂肪酸。	暂无已核实直接文献
`At4g16820`	酰基水解酶，催化磷脂酰胆碱在 sn-1 位的水解。	暂无已核实直接文献
`At2g30550`	广谱脂酰水解酶。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: A2WY00`	磷脂酶，从磷脂中释放游离脂肪酸。	暂无已核实直接文献
`Os01g0900400`	磷脂酶，从磷脂中释放游离脂肪酸。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026964 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0009901 anther dehiscence 生物过程

GO:0010152 pollen maturation 生物过程

GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程

GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004620 glycerophospholipase activity 分子功能

GO:0004806 triacylglycerol lipase activity 分子功能

GO:0008970 glycerophospholipid phospholipase A1 activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G06800

ath:AT1G51440

ath:AT2G30550

ath:AT2G44810

ath:AT4G16820

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.430

排名 1 · TkA07G021470 · TK1151

细胞质0.275

排名 2 · TkA07G021470 · TK1151

细胞核0.110

排名 3 · TkA07G021470 · TK1151

溶酶体／液泡0.094

排名 4 · TkA07G021470 · TK1151

细胞膜0.091

排名 5 · TkA07G021470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11187Mbeg1-like57-198 aa

PF26363Phospholipase-like60-83 aa

PF01764Lipase_362-209 aa

PF00756Esterase106-163 aa

PF00975Thioesterase109-160 aa

PF02230Abhydrolase_2115-203 aa

PF12697Abhydrolase_6117-195 aa

PF07819PGAP1118-175 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G021470	`PF11187`	Mbeg1-like	57	198	0.0084	16.2
TkA07G021470	`PF26363`	Phospholipase-like	60	83	0.00032	20.7
TkA07G021470	`PF01764`	Lipase_3	62	209	2.7e-36	125.2
TkA07G021470	`PF00756`	Esterase	106	163	0.21	12.0
TkA07G021470	`PF00975`	Thioesterase	109	160	0.04	14.8
TkA07G021470	`PF02230`	Abhydrolase_2	115	203	0.14	12.7
TkA07G021470	`PF12697`	Abhydrolase_6	117	195	0.0045	18.4
TkA07G021470	`PF07819`	PGAP1	118	175	0.08	13.4
TkA07G021470	`PF05057`	DUF676	120	201	0.1	12.8
TkA07G021470	`PF26363`	Phospholipase-like	124	155	0.00032	20.7
TkA07G021470	`PF00135`	COesterase	124	158	0.066	12.9
TkA07G021470	`PF03959`	FSH1	135	203	0.023	15.1
TkA07G021470	`PF01764`	Lipase_3	238	260	2.7e-36	125.2
TkA07G021470	`PF05057`	DUF676	267	296	0.1	12.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q948R1`	拟南芥	sp\|Q948R1\|PLA11_ARATH Phospholipase A(1) DAD1, chloroplastic	62.700%	Swiss-Prot	高置信
`O23522`	拟南芥	sp\|O23522\|PLA14_ARATH Phospholipase A1-Ibeta2, chloroplastic	47.500%	Swiss-Prot	中等置信
`Q3EBR6`	拟南芥	sp\|Q3EBR6\|PLA16_ARATH Phospholipase A1-Igamma2, chloroplastic	40.000%	Swiss-Prot	中等置信
`A2WY00`	水稻	sp\|A2WY00\|EG1_ORYSI Phospholipase A1 EG1, chloroplastic/mitochondrial	41.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8S1D9`	水稻	sp\|Q8S1D9\|EG1_ORYSJ Phospholipase A1 EG1, chloroplastic/mitochondrial	41.200%	Swiss-Prot	中等置信

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