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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G020530
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 5545369-5554299 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1248 bp · TkA07G020530|TK1151|cDNA

ATGTCACCGAAGTTACATATCAAAGGCATGAAGAAATCCAAGAAACCAAAGGTATCAAAACGTGAAAATGGGGTCGATATGATCAGTAAGTTGCCAGATGATGTCCTTCAAATGATTATTTCACGTCTTCAAGGTACCGAAGAAGTAGTTCGAACCAGCATTTTGTCTACACGATGGAGATATTTATGGACTTCGGTTCCCTTTATAGACATAGATTTTTCCCGAAGATTGAATCGCAATGAAGAAAACTTCAAAAGGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1248 bp · TkA07G020530|TK1151|CDS

ATGTCACCGAAGTTACATATCAAAGGCATGAAGAAATCCAAGAAACCAAAGGTATCAAAACGTGAAAATGGGGTCGATATGATCAGTAAGTTGCCAGATGATGTCCTTCAAATGATTATTTCACGTCTTCAAGGTACCGAAGAAGTAGTTCGAACCAGCATTTTGTCTACACGATGGAGATATTTATGGACTTCGGTTCCCTTTATAGACATAGATTTTTCCCGAAGATTGAATCGCAATGAAGAAAACTTCAAAAGGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

415 aa · TkA07G020530|TK1151|PROTEIN

MSPKLHIKGMKKSKKPKVSKRENGVDMISKLPDDVLQMIISRLQGTEEVVRTSILSTRWRYLWTSVPFIDIDFSRRLNRNEENFKREILEGFVYRVLENNSLHLETFRLSCASYFNMSIVGQWIETAVRRNVKLLDLMFCPRNQCDDVEVPHCLVTSRFSVLRVLELNRVKLFDGGLVTGFLKCCPLLEDLKLKNLEFSRKVGNLDENFNRRIQISCPKLVFLELTESLKKAVINPSGSLSCLMGGADTICELFEGISYV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G020530
TK1151 IDTkA07G020530
OH-1004 IDLXL04_026954
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)57.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.313 / OH-1004 94.912
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G020530
位置Chr07:5545369-5554299 (-)
描述Similar to At3g58880: Putative F-box/LRR-repeat protein At3g58880
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g78750 F-box/FBD/LRR 重复蛋白 At1g78750。 暂无已核实直接文献
At5g56420 F-box/FBD/LRR 重复蛋白 At5g56420。 暂无已核实直接文献
At1g16940 推测的 F-box/FBD/LRR重复蛋白 At1g16940。 暂无已核实直接文献
At1g13570 F-box/FBD/LRR重复蛋白 At1g13570。 暂无已核实直接文献
At1g78840 假定的F-box/FBD/LRR重复蛋白 At1g78840。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026954 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G66290
ath:AT1G69630
ath:AT1G78750
ath:AT3G58880
ath:AT5G44950
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.872
排名 1 · TkA07G020530 · TK1151
细胞质0.185
排名 2 · TkA07G020530 · TK1151
细胞膜0.038
排名 3 · TkA07G020530 · TK1151
内质网0.030
排名 4 · TkA07G020530 · TK1151
质体0.014
排名 5 · TkA07G020530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23622LRR_At1g61320_AtMIF14-62 aa
PF00646F-box28-68 aa
PF12937F-box-like28-62 aa
PF07723LRR_233-42 aa
PF27290YonD_N75-95 aa
PF08387FBD101-109 aa
PF07723LRR_2101-116 aa
PF23622LRR_At1g61320_AtMIF1102-194 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G020530PF23622LRR_At1g61320_AtMIF14626.7e-0523.2
TkA07G020530PF00646F-box28681.9e-0731.4
TkA07G020530PF12937F-box-like28620.0005520.4
TkA07G020530PF07723LRR_233420.7411.3
TkA07G020530PF27290YonD_N75950.1112.9
TkA07G020530PF08387FBD1011090.02415.2
TkA07G020530PF07723LRR_21011160.7411.3
TkA07G020530PF23622LRR_At1g61320_AtMIF11021946.7e-0523.2
TkA07G020530PF00646F-box1081201.9e-0731.4
TkA07G020530PF27290YonD_N1091260.1112.9
TkA07G020530PF24758LRR_At5g563701222496.4e-0626.7
TkA07G020530PF08387FBD1491570.02415.2
TkA07G020530PF07723LRR_21621860.7411.3
TkA07G020530PF08387FBD2232340.02415.2
TkA07G020530PF00646F-box2702821.9e-0731.4
TkA07G020530PF24758LRR_At5g563702763136.4e-0626.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZV93拟南芥sp|Q9ZV93|FDL10_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g7875027.200%Swiss-Prot低置信
Q9FM89拟南芥sp|Q9FM89|FDL38_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g5642033.200%Swiss-Prot低置信
Q9FZ53拟南芥sp|Q9FZ53|FDL4_ARATH Putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g1694024.700%Swiss-Prot低置信
Q9FZ70拟南芥sp|Q9FZ70|FDL1_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g1357025.800%Swiss-Prot低置信
Q9ZVA3拟南芥sp|Q9ZVA3|FDL12_ARATH Putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g7884026.100%Swiss-Prot低置信

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