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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G474000
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 117244793-117248795 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1554 bp · TkA06G474000|TK1151|cDNA

TCTAACTCAAGAAAAAAGCCAACAAAACTACACCTTCTCCCACTTGGAAACTAGGGTTTTCTAATTACTCTTCACCAGATCCTCACTTCTCAATGAAATCCTCTGTTTCCGCTAGAAAGATCGGTGCAAATCTTTGGGAAGTACAACCTCAATTCAATTTTAACAAAAACGACGGTGATCATGGCGGTGATCATGAAGGTGATGACGGTGTCGATCGTGTTAGTCTGATTCACCACCATCGCCGGCGCCACCATCAGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1023 bp · TkA06G474000|TK1151|CDS

ATGAAATCCTCTGTTTCCGCTAGAAAGATCGGTGCAAATCTTTGGGAAGTACAACCTCAATTCAATTTTAACAAAAACGACGGTGATCATGGCGGTGATCATGAAGGTGATGACGGTGTCGATCGTGTTAGTCTGATTCACCACCATCGCCGGCGCCACCATCAGAAAGAGGAATTTGATGTTTCTGGTCAATTGCATGAACAACCTTATGATAGCGATCCACATACTCCAGAAATCAAGACTAGTTTGAGAAGAAATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

340 aa · TkA06G474000|TK1151|PROTEIN

MKSSVSARKIGANLWEVQPQFNFNKNDGDHGGDHEGDDGVDRVSLIHHHRRRHHQKEEFDVSGQLHEQPYDSDPHTPEIKTSLRRNIRKLPSLRHLSIEKNEDLQHVSSASCCSSMQVTPYACAITPTSYTLKTSTHLLKVLNRIWNLEEQHSSNVASIQALKHELDISRAQIKTLIEERKNDHKEISELKKSTHEKKKKAVQSTKDEVSDAKSSLMRERKARILLESLCDEFAKGIRDYEEKVRSLQQNRGRKDVTEPD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G474000
TK1151 IDTkA06G474000
OH-1004 IDLXL04_022599
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.235 / OH-1004 84.759
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G474000
位置Chr06:117244793-117248795 (+)
描述Similar to At5g41620: Uncharacterized protein At5g41620
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g41620 未经表征的蛋白质 At5g41620。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022599 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G41620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.500
排名 1 · TkA06G474000 · TK1151
细胞核0.352
排名 2 · TkA06G474000 · TK1151
细胞膜0.312
排名 3 · TkA06G474000 · TK1151
内质网0.040
排名 4 · TkA06G474000 · TK1151
高尔基体0.030
排名 5 · TkA06G474000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07200Mod_r80-106 aa
PF28231STB2_C128-249 aa
PF07200Mod_r134-250 aa
PF25014NET2A142-219 aa
PF24161CCDC39144-249 aa
PF22905Hydro_N_hd147-214 aa
PF07926TPR_MLP1_2151-205 aa
PF16678UBA_HOIP153-253 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G474000PF07200Mod_r801065.47.7
TkA06G474000PF28231STB2_C1282490.1313.5
TkA06G474000PF07200Mod_r1342505.47.7
TkA06G474000PF25014NET2A1422190.3911.3
TkA06G474000PF24161CCDC391442490.00316.2
TkA06G474000PF22905Hydro_N_hd1472140.02715.1
TkA06G474000PF07926TPR_MLP1_21512050.1912.5
TkA06G474000PF16678UBA_HOIP1532530.04914.3
TkA06G474000PF12325TMF_TATA_bd1572120.6610.8
TkA06G474000PF12325TMF_TATA_bd1892490.6610.8
TkA06G474000PF07926TPR_MLP1_22362490.1912.5
TkA06G474000PF25014NET2A2363060.3911.3
TkA06G474000PF07200Mod_r2932985.47.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q66GQ2拟南芥sp|Q66GQ2|Y5162_ARATH Uncharacterized protein At5g4162039.400%Swiss-Prot中等置信

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