TkA06G458170 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G458170

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 113317764-113322087 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1941 bp · TkA06G458170|TK1151|cDNA

CCTCATTTTAGTGAATGTCTCGTTAGTTATTCCATATCTTAAAAGTTCACTCATGGTATTGGCTTCATACATCAAATATTCGGTTCTTGAGAGTCAACATTCAGTTCTTCAAGCAACGCGTGAGGAATTAAATGCAAATTTCTGTAAAAATCATCAAGAATATGTTCAATAATGATCAAGAGTCCCTTCAGATATGAGTTTCTTCAGAGAATTAATCGACAATTTCAGCTCCGTTTTTTCTGATTCCGGTTCGCCATCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1464 bp · TkA06G458170|TK1151|CDS

ATGAGTTTCTTCAGAGAATTAATCGACAATTTCAGCTCCGTTTTTTCTGATTCCGGTTCGCCATCAAACACATCAAATCAAAACCCCAGTTCATCGAACAATTATCAAAATCGAGCAGCCATGGATGGAGTGGAGAATGAACGCGCTGCGTATAAGCTTAAAGGATACTTTGATCTGGCAAAAGAAGAGATCGATAAAGCGGTTAGGGCAGAAGAGTGGGGTTTGATTGAGGATGCTATCTTACATTATCAAAACGCTCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

487 aa · TkA06G458170|TK1151|PROTEIN

MSFFRELIDNFSSVFSDSGSPSNTSNQNPSSSNNYQNRAAMDGVENERAAYKLKGYFDLAKEEIDKAVRAEEWGLIEDAILHYQNAQRILGEAIATPVPSYISSREQEKVKSYRQKISKWQGQVSERLRTLNNRSGGTSIIKTTSPRLQSAPVSPSKPNSIKTASQKSAPNLRGSMSNKTINSKPVVQESNGGLDPKLVEMINSVIVDRSQSVKWEDIAGLEKAKQALLEMVILPTKRKDLFTGLRRPAKGLLLFGPPGT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G458170`
TK1151 ID	TkA06G458170
OH-1004 ID	LXL04_022720
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G458170`
位置	Chr06:113317764-113322087 (-)
描述	Similar to FIGNL1: Fidgetin-like protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_022720` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程 GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程 GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0007140 male meiotic nuclear division 生物过程 GO:0010458 exit from mitosis 生物过程 GO:0010569 regulation of double-strand break repair via homologous recombination 生物过程 GO:0031117 positive regulation of microtubule depolymerization 生物过程 GO:0031468 nuclear membrane reassembly 生物过程 GO:0032467 positive regulation of cytokinesis 生物过程 GO:0032506 cytokinetic process 生物过程 GO:0033687 osteoblast proliferation 生物过程 GO:0034214 protein hexamerization 生物过程
KEGG 基因交叉引用	gga:421481 hsa:63979 xla:446560 xla:446598 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.626

排名 1 · TkA06G458170 · TK1151

细胞核0.229

排名 2 · TkA06G458170 · TK1151

细胞膜0.109

排名 3 · TkA06G458170 · TK1151

高尔基体0.105

排名 4 · TkA06G458170 · TK1151

过氧化物酶体0.093

排名 5 · TkA06G458170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04212MIT59-119 aa

PF01078Mg_chelatase105-119 aa

PF13245AAA_19160-216 aa

PF05673DUF815207-316 aa

PF00493MCM215-324 aa

PF13481AAA_25235-270 aa

PF13191AAA_16241-377 aa

PF12775AAA_7247-281 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G458170	`PF04212`	MIT	59	119	0.0031	18.3
TkA06G458170	`PF01078`	Mg_chelatase	105	119	0.0017	18.5
TkA06G458170	`PF13245`	AAA_19	160	216	0.093	13.6
TkA06G458170	`PF05673`	DUF815	207	316	0.00066	19.6
TkA06G458170	`PF00493`	MCM	215	324	0.002	18.0
TkA06G458170	`PF13481`	AAA_25	235	270	0.00043	20.7
TkA06G458170	`PF13191`	AAA_16	241	377	2.5e-05	25.6
TkA06G458170	`PF12775`	AAA_7	247	281	0.027	14.7
TkA06G458170	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	247	323	0.13	12.8
TkA06G458170	`PF05496`	RuvB_N	248	322	1.6e-05	25.4
TkA06G458170	`PF06068`	TIP49	248	300	0.00025	21.0
TkA06G458170	`PF13401`	AAA_22	249	291	3.1e-05	25.0
TkA06G458170	`PF01695`	IstB_IS21	249	274	0.014	15.6
TkA06G458170	`PF13245`	AAA_19	249	287	0.093	13.6
TkA06G458170	`PF00625`	Guanylate_kin	250	287	0.049	14.0
TkA06G458170	`PF24883`	NPHP3_N	251	365	0.00014	22.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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