TkA06G447200 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G447200

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 110498470-110502528 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2149 bp · TkA06G447200|TK1151|cDNA

AAATAGCACCCTGCTCATAGTCACAGGTCGACCGGTAAAAGTGGAAGAAATTGCAGCAAAATTGAACCCGAAGACCGGTTTTCCATATACCCATCGTCGGTGTTACACCTGCTGCGGTGCCGGAAACCACCGTTCTACCAATTCCGCCTCATTCTCTGCCGTACATTTGACCACCGCATCCAGTTTGATCTGTGAATTGGATAGAGGAACCATAAAAGCTCGGGACTGATACCGAGGATTTTGTTCGATCTACAATGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1758 bp · TkA06G447200|TK1151|CDS

ATGGCTTCAGACTCCAACTCATCATCATCTCAACCTCCAACTGAAGCTACTGATGTTGAAACTTGTGCATCCACCATCTCTGACCAGACTAACAATTCTACAATTGACCCTTCCCCTTCCCCTTCCCTTGCCCCTGCCCCCATGGAAACTCCACCACCTGTTATATCATCATCAGATGGAGTTCCAAATTTCCCCAAACCTACATCACCAAGACAAACCCCTTCACAATCTGAAACCATCGGAAAGTGGACGATTGCACA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

585 aa · TkA06G447200|TK1151|PROTEIN

MASDSNSSSSQPPTEATDVETCASTISDQTNNSTIDPSPSPSLAPAPMETPPPVISSSDGVPNFPKPTSPRQTPSQSETIGKWTIAQRIVSGFGLNVTHKNDNSTPSPSSSSPSAVLQSVGKGLVDTSMGAVKAVQIRARHMVSQNKRRYQEGEFDLDLTYITDNVIAMGFPAGDMSSGLFGYFEGFYRNHMEEVIKFFETHHKDRYKVYNLCSERLYDASLFAGKVASFPFNDHNCPPIHLIPSFCQSAYSWLKEDIQN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G447200`
TK1151 ID	TkA06G447200
OH-1004 ID	LXL04_017388
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	60.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.034 / OH-1004 88.927 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G447200

位置 Chr06:110498470-110502528 (-)

描述 Similar to PTEN2A: Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and protein-tyrosine-phosphatase PTEN2A

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g19420`	结合磷脂酸。	A novel class of PTEN protein in Arabidopsis displays unusual phosphoinositide phosphatase activity and efficiently binds phosphatidic acid.2012 · DOI: 10.1042/bj20110776
`At3g50110`	蛋白酪氨酸磷酸酶，同时对 PtdIns(3)P 表现出弱的脂质磷酸酶活性。	A novel class of PTEN protein in Arabidopsis displays unusual phosphoinositide phosphatase activity and efficiently binds phosphatidic acid.2012 · DOI: 10.1042/bj20110776

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017388 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程

GO:0006470 protein dephosphorylation 生物过程

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0006935 chemotaxis 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0007056 spindle assembly involved in female meiosis 生物过程

GO:0007188 adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程

GO:0007584 response to nutrient 生物过程

GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程

GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程

GO:0009410 response to xenobiotic stimulus 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G19420

ath:AT3G50110

ddi:DDB_G0286557

mmu:19211

rno:50557

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.504

排名 1 · TkA06G447200 · TK1151

高尔基体0.194

排名 2 · TkA06G447200 · TK1151

内质网0.192

排名 3 · TkA06G447200 · TK1151

细胞膜0.168

排名 4 · TkA06G447200 · TK1151

细胞核0.160

排名 5 · TkA06G447200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00782DSPc190-210 aa

PF22785Tc-R-P227-282 aa

PF22741PTP-NADK228-278 aa

PF22784PTP-SAK229-291 aa

PF14566PTPlike_phytase230-282 aa

PF00102Y_phosphatase245-283 aa

PF13350Y_phosphatase3254-284 aa

PF00782DSPc259-301 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G447200	`PF00782`	DSPc	190	210	0.00031	21.3
TkA06G447200	`PF22785`	Tc-R-P	227	282	7.5e-06	27.2
TkA06G447200	`PF22741`	PTP-NADK	228	278	0.049	13.8
TkA06G447200	`PF22784`	PTP-SAK	229	291	0.00042	21.1
TkA06G447200	`PF14566`	PTPlike_phytase	230	282	0.071	13.9
TkA06G447200	`PF00102`	Y_phosphatase	245	283	0.03	14.7
TkA06G447200	`PF13350`	Y_phosphatase3	254	284	0.00035	21.3
TkA06G447200	`PF00782`	DSPc	259	301	0.00031	21.3
TkA06G447200	`PF22918`	PTEN2_C2	334	462	1.2e-68	229.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LT75`	拟南芥	sp\|Q9LT75\|PTN2A_ARATH Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and protein-tyrosine-phosphatase PTEN2A	62.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q8H106`	拟南芥	sp\|Q8H106\|PTN2B_ARATH Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and protein-tyrosine-phosphatase PTEN2B	58.900%	Swiss-Prot	高置信

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