TkA06G442690 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G442690

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 109383272-109387259 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2075 bp · TkA06G442690|TK1151|cDNA

AAAAAAAGAAATCCCCAAACCCGGCACACACAGGTGACCAGCGGATGAAGGTGTAGAATAAGGGGGTTTTGAAGATGCGGCAGCATCATTAGCGGTGTTGGCGACGGGTATAAGCAGCTCCCGATCTCTGCTAATCGACACCCACATATAGACTGGAATCACACTAAAACGGTGAATCCAGTAGTCGCGAAGAGTCGGGGGATTTGTTGTTTCTCAGGAATCAAGGAGTAGATTAAAAATCGTTAAGCCCTAAGATAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

585 bp · TkA06G442690|TK1151|CDS

ATGAGATCTGGTGGATCAAATACTTCTAGGCGACCTTGGCAGGCTGTCAATGATTATAATCAAAGGCATCATGATCAAGAGGAAAACAACGATGGATGGGAGACGGTTGGAAAGAAGCCTAAAAGAAAGCACAAACAGGTTGTTGACTATCACATTAAGCTTAGAAATGGAAGAAATGGAAGGTACCCTACAATGGGGAAACCACGGGGACCCGGTGGTAATGGCGGCTCACCATTCGAGGAGGCATTAATTGCCAACTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

194 aa · TkA06G442690|TK1151|PROTEIN

MRSGGSNTSRRPWQAVNDYNQRHHDQEENNDGWETVGKKPKRKHKQVVDYHIKLRNGRNGRYPTMGKPRGPGGNGGSPFEEALIANFYHKIAKVMSKIGRITSQLYFPRYLEMRGAGGPWRRLCALPAFWIKEYSVVAFDYTKKRCTWSSSPPPSNNTVAASILSLHIFSQDLRRQEQNRLGRNPTAMDEQRQF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G442690`
TK1151 ID	TkA06G442690
OH-1004 ID	LXL04_033218
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	89.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 64.433 / OH-1004 77.714 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G442690

位置 Chr06:109383272-109387259 (+)

描述 Similar to GSH1: Glutamate--cysteine ligase, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g23100`	似乎在控制抗性反应的表达方面发挥着重要作用，例如调节水杨酸和植物抗毒素的产生。	The ROOT MERISTEMLESS1/CADMIUM SENSITIVE2 gene defines a glutathione-dependent pathway involved in initiation and maintenance of cell division during postembryonic root development.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.1.97 The biological functions of glutathione revisited in arabidopsis transgenic plants with altered glutathione levels.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.564 Level of glutathione is regulated by ATP-dependent ligation of glutamate and cysteine through photosynthesis in Arabidopsis thaliana: mechanism of strong interaction of light intensity with flowering.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch008 Evidence for a direct link between glutathione biosynthesis and stress defense gene expression in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.022608 Maturation of arabidopsis seeds is dependent on glutathione biosynthesis within the embryo.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.077982 Identification of PAD2 as a gamma-glutamylcysteine synthetase highlights the importance of glutathione in disease resistance of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02938.x RML1 and RML2, Arabidopsis genes required for cell proliferation at the root tip.1995 · DOI: 10.1104/pp.107.2.365

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q8GU95`	谷氨酸-半胱氨酸合成酶A，叶绿体型。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2YL07`	谷氨酸-半胱氨酸连接酶 B，叶绿体型。	暂无已核实直接文献
`Os07g0462000`	谷氨酸-半胱氨酸连接酶 B，叶绿体型。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033218 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006750 glutathione biosynthetic process 生物过程

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004357 glutamate-cysteine ligase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os07g0462000

mtr:11441054

nta:107799938

sly:543536

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.386

排名 1 · TkA06G442690 · TK1151

细胞质0.348

排名 2 · TkA06G442690 · TK1151

细胞膜0.146

排名 3 · TkA06G442690 · TK1151

线粒体0.132

排名 4 · TkA06G442690 · TK1151

内质网0.074

排名 5 · TkA06G442690 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P46309`	拟南芥	sp\|P46309\|GSH1_ARATH Glutamate--cysteine ligase, chloroplastic	71.900%	Swiss-Prot	低置信
`Q8GU95`	水稻	sp\|Q8GU95\|GSH1A_ORYSI Glutamate--cysteine ligase A, chloroplastic	71.900%	Swiss-Prot	低置信
`A2YL07`	水稻	sp\|A2YL07\|GSH1B_ORYSI Glutamate--cysteine ligase B, chloroplastic	71.900%	Swiss-Prot	低置信
`Q6Z3A3`	水稻	sp\|Q6Z3A3\|GSH1B_ORYSJ Glutamate--cysteine ligase B, chloroplastic	71.900%	Swiss-Prot	低置信

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