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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G441070
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 108976347-108989731 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3189 bp · TkA06G441070|TK1151|cDNA

ATTTCTGTCATGTTCAGGCTTTTAACACTGTTTAGACTCTATTTCTGTCATCTTTATTAAACAAGATCATCCCCTCCCAGCCTCTATCGCTGTCGCTGACGTTCTTTTCGGTTCTCTCTCGTTTGCCTTCTTCAGAAAATCATAAATCACCCCCACATCGCCGCCCCTAAAACCTCTTCTCACCGGAACCTTCATTGGGGAATCATAAACCACCGCCGTCGGAAAAACACCTCCCCGTCGGAGATACCAAAACCCAGCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1608 bp · TkA06G441070|TK1151|CDS

ATGGCATTGCGTTTTATGCAATCTCGCAGTATGTTCAGCTTGCTCCATTTCCGCTCAATATCTTCATTCTCTTCTTCAACCTCTGAACCCAAAGAATTTATATCCGAAAGTGTGTCAAAACCTTTACTTCTTTCACTTGAACCATCAAACGATGCCGATTTAATTTCCCAGATGCTTATCCAACACCATAACCCATTCCACACAATGGAATCCTCTCTGCAACTCAACGGAATCAAAATCTCCCCAAATCTCGTCCACCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

535 aa · TkA06G441070|TK1151|PROTEIN

MALRFMQSRSMFSLLHFRSISSFSSSTSEPKEFISESVSKPLLLSLEPSNDADLISQMLIQHHNPFHTMESSLQLNGIKISPNLVHQTLLRLKNISKVALAFFSWAKEQSHYSHDSHSYNLMIDILGKVRQFDVAWQLIIEMDQNGVNPTSTTFYVLIRRLISAGLTRQAIRAFDDMGCFVVNDSDLQHQQEQQQPVHDFYFLFDTLCKYGYPKVAAEMFNKWKSWRFEPDAKIYTILIYGWCKINKPKMAERFFQEMVN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G441070
TK1151 IDTkA06G441070
OH-1004 IDLXL04_022839
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.131 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G441070
位置Chr06:108976347-108989731 (-)
描述Similar to At2g13420: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13420, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g13420 含五聚肽重复结构的蛋白 At2g13420，线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g20300 含五肽重复的蛋白 At1g20300，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g22670 含五节重复序列蛋白At3g22670，线粒体。 暂无已核实直接文献
At5g14820 含五肽重复序列的蛋白At5g14820，线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g62470 含五肽重复的蛋白 At3g62470，线粒体。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022839 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20300
ath:AT1G52640
ath:AT1G71060
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.765
排名 1 · TkA06G441070 · TK1151
质体0.130
排名 2 · TkA06G441070 · TK1151
细胞核0.064
排名 3 · TkA06G441070 · TK1151
细胞质0.032
排名 4 · TkA06G441070 · TK1151
细胞膜0.010
排名 5 · TkA06G441070 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08579RPM261-89 aa
PF29070MSC6_N66-168 aa
PF23860Ribophorin_II_3rd83-133 aa
PF19189Mtf296-157 aa
PF23276TPR_24111-163 aa
PF13041PPR_2115-161 aa
PF12854PPR_1115-142 aa
PF17177PPR_long116-179 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G441070PF08579RPM261890.003218.6
TkA06G441070PF29070MSC6_N661684.8e-1969.4
TkA06G441070PF23860Ribophorin_II_3rd831330.2312.2
TkA06G441070PF19189Mtf2961572.3e-0731.4
TkA06G441070PF23276TPR_241111635.1e-1969.2
TkA06G441070PF13041PPR_21151613.4e-73242.3
TkA06G441070PF12854PPR_11151425.8e-44148.2
TkA06G441070PF17177PPR_long1161798.5e-2278.3
TkA06G441070PF01535PPR1181477e-45148.9
TkA06G441070PF13812PPR_31181582.1e-37127.7
TkA06G441070PF08579RPM21321640.003218.6
TkA06G441070PF12854PPR_11451775.8e-44148.2
TkA06G441070PF01535PPR1531777e-45148.9
TkA06G441070PF13041PPR_21571773.4e-73242.3
TkA06G441070PF13041PPR_22032443.4e-73242.3
TkA06G441070PF01535PPR2052267e-45148.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WP85拟南芥sp|Q0WP85|PP150_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g13420, mitochondrial48.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LN22拟南芥sp|Q9LN22|PPR54_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g20300, mitochondrial35.400%Swiss-Prot低置信
Q9LUJ4拟南芥sp|Q9LUJ4|PP248_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g22670, mitochondrial30.200%Swiss-Prot低置信
Q9LEQ7拟南芥sp|Q9LEQ7|PP382_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g14820, mitochondrial30.500%Swiss-Prot低置信
Q9LZP3拟南芥sp|Q9LZP3|PP293_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g62470, mitochondrial30.500%Swiss-Prot低置信

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