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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G437800
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 108230868-108232199 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1302 bp · TkA06G437800|TK1151|cDNA

ATGGCGCCAAAATCAAGTCCACCATCGCCGCCCACTACCACCATCAACAGAAGCACTAGCGACGGCGGCACCATCATACTAAACAAGTACCAACTCACCCGCCTCTTGGGTCGTGGCAGTTTTGCAAAAGTCTACCATGGCCGCTCTCTCACCGACAATTCCTCCGTGGCCGTCAAGGTCATCGAGAAACCCGCCACCGCAGATCCCGCTATGGAGCCAAGGCTTGTCCGTGAAGTCGCAGCTATGCGGCGGCTGAACCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1302 bp · TkA06G437800|TK1151|CDS

ATGGCGCCAAAATCAAGTCCACCATCGCCGCCCACTACCACCATCAACAGAAGCACTAGCGACGGCGGCACCATCATACTAAACAAGTACCAACTCACCCGCCTCTTGGGTCGTGGCAGTTTTGCAAAAGTCTACCATGGCCGCTCTCTCACCGACAATTCCTCCGTGGCCGTCAAGGTCATCGAGAAACCCGCCACCGCAGATCCCGCTATGGAGCCAAGGCTTGTCCGTGAAGTCGCAGCTATGCGGCGGCTGAACCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

433 aa · TkA06G437800|TK1151|PROTEIN

MAPKSSPPSPPTTTINRSTSDGGTIILNKYQLTRLLGRGSFAKVYHGRSLTDNSSVAVKVIEKPATADPAMEPRLVREVAAMRRLNHPNILKLHEVLATKTKIYLVMELAAGGELFTQLTRRGRMKEATARLYFQQLVSTLHFCHQNGVAHRDLKPQNLLLDKNGNLKISDFGLSALPESKKDGLLHTACGTPAFTAPEIVRGKGYDGAKADAWSCGIILFNFLSGYLPFDDSNLANMYRKIHQREILFPDWIPKQPRII...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G437800
TK1151 IDTkA06G437800
OH-1004 IDLXL04_003429
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)79.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.457 / OH-1004 59.207
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G437800
位置Chr06:108230868-108232199 (+)
描述Similar to CIPK7: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14580 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
At3g23000 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。
CIPK7 is involved in cold response by interacting with CBL1 in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1016/j.plantsci.2011.03.011
At5g01810 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0634400 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os12g0603700 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009413 response to flooding 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G23000
ath:AT4G14580
ath:AT5G01810
dosa:Os01g0206700
dosa:Os03g0634400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.531
排名 1 · TkA06G437800 · TK1151
细胞质0.431
排名 2 · TkA06G437800 · TK1151
细胞膜0.136
排名 3 · TkA06G437800 · TK1151
内质网0.053
排名 4 · TkA06G437800 · TK1151
溶酶体／液泡0.029
排名 5 · TkA06G437800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase30-284 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr31-278 aa
PF03109ABC137-63 aa
PF01163RIO143-100 aa
PF06293Kdo69-166 aa
PF01163RIO177-173 aa
PF12330Haspin_kinase98-188 aa
PF03109ABC1100-178 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G437800PF00069Pkinase302841.7e-69234.8
TkA06G437800PF07714PK_Tyr_Ser-Thr312788.5e-39134.1
TkA06G437800PF03109ABC137638e-0832.4
TkA06G437800PF01163RIO1431000.004817.3
TkA06G437800PF06293Kdo691660.0004320.5
TkA06G437800PF01163RIO1771730.004817.3
TkA06G437800PF12330Haspin_kinase981880.0004120.2
TkA06G437800PF03109ABC11001788e-0832.4
TkA06G437800PF14531Kinase-like1172331.1e-0525.6
TkA06G437800PF01636APH1221660.1113.0
TkA06G437800PF07387Seadorna_VP71401710.003517.1
TkA06G437800PF07387Seadorna_VP73053370.003517.1
TkA06G437800PF03822NAF3123692.5e-1969.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUL7拟南芥sp|Q9SUL7|CIPK4_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 455.800%Swiss-Prot高置信
Q9XIW0拟南芥sp|Q9XIW0|CIPK7_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 754.800%Swiss-Prot高置信
P92937拟南芥sp|P92937|CIPKF_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1545.800%Swiss-Prot中等置信
Q75GK4水稻sp|Q75GK4|CIPK7_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 750.100%Swiss-Prot高置信
Q2QMI0水稻sp|Q2QMI0|CIPK4_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 449.700%Swiss-Prot中等置信

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