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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G390040
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 96638635-96642578 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1914 bp · TkA06G390040|TK1151|cDNA

AAACAGTGTACCACCGCATCTGTACTTTTGCTATGTCTGGACTGAAAGGCAGAAAGGCCACGCTTCACATGCCTCAGAAATGGTAACTTATTGATTAATGAAGTAAATTAGATGCACAAATTGAAGAAAACTCCCACAAAAAATCTTCTTCGTCTTCCTCTGCAATCCACCATCTCGCCACACCAATCGGAAGCAAGTAACGGCATTCAACCGCATAAATCCATTCCATGATTGGTGTTCGTTGACGGTGTTTTTGATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1056 bp · TkA06G390040|TK1151|CDS

ATGGGCGTTTCTGGAAAGTGGATTAGAGCACTCATTGGTTTGAAGAAACAAGAAAAATCACAACGTTCAGGAGAAGATGGACATAGGGGCAAAACCGGAAAGTTTGGCCACCGCAGAAGAAGTTCTACAGAGATAAAGAGTGGCATTTTTGTAAATAAGTTGAATGAAGATGGCAATAGCAGTGCAGTTCAAGATGTTACCGACTCAGTGTCTGACTCACCTCAGATGGAACAGCGTATGAGAGAAGAGTGGGCAGCTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

351 aa · TkA06G390040|TK1151|PROTEIN

MGVSGKWIRALIGLKKQEKSQRSGEDGHRGKTGKFGHRRRSSTEIKSGIFVNKLNEDGNSSAVQDVTDSVSDSPQMEQRMREEWAATYIQTAFRGFLARRALRALKGLVRLQALVRGHAVRKQAATTLRCMQALVRVQARVRARRVRVALEEGQSHQPKLQHQLQHEAHVREIEQGWCDSVGSVEEIQAKLIKRQEAAAKRERAMAYALAHQWQAGSKQPVVPSGSGFEPDKSNWGWNWLERWMAVRPWENRFLDEVKIQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G390040
TK1151 IDTkA06G390040
OH-1004 IDLXL04_023171
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.715 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G390040
位置Chr06:96638635-96642578 (-)
描述Similar to IQD1: Protein IQ-DOMAIN 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g22190 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。
The Microtubule-Associated Protein IQ67 DOMAIN5 Modulates Microtubule Dynamics and Pavement Cell Shape.2018 · DOI: 10.1104/pp.18.00558
Microtubule-associated protein IQ67 DOMAIN5 regulates morphogenesis of leaf pavement cells in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1093/jxb/ery395
At2g26180 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At1g72670 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At3g52290 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献
At5g03040 可能参与与钙调蛋白或类钙调蛋白的协同作用（通过相似性推测）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023171 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0051211 anisotropic cell growth 生物过程
GO:0070507 regulation of microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0072699 protein localization to cortical microtubule cytoskeleton 生物过程
GO:0090436 leaf pavement cell development 生物过程
GO:2001006 regulation of cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G72670
ath:AT2G26180
ath:AT3G22190
ath:AT3G52290
ath:AT5G03040
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.417
排名 1 · TkA06G390040 · TK1151
细胞膜0.393
排名 2 · TkA06G390040 · TK1151
细胞核0.340
排名 3 · TkA06G390040 · TK1151
内质网0.055
排名 4 · TkA06G390040 · TK1151
质体0.042
排名 5 · TkA06G390040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24609IQ_SCN5A_C79-106 aa
PF00612IQ84-103 aa
PF00612IQ109-123 aa
PF21627BTH_I2711-like115-148 aa
PF00612IQ133-148 aa
PF27823SCD2_helical_N138-138 aa
PF00435Spectrin161-215 aa
PF27823SCD2_helical_N165-215 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G390040PF24609IQ_SCN5A_C791060.0005620.1
TkA06G390040PF00612IQ841031.6e-0628.1
TkA06G390040PF00612IQ1091231.6e-0628.1
TkA06G390040PF21627BTH_I2711-like1151480.07514.1
TkA06G390040PF00612IQ1331481.6e-0628.1
TkA06G390040PF27823SCD2_helical_N1381380.3811.7
TkA06G390040PF00435Spectrin1612150.05214.7
TkA06G390040PF27823SCD2_helical_N1652150.3811.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4J061拟南芥sp|F4J061|IQD5_ARATH Protein IQ-DOMAIN 553.300%Swiss-Prot高置信
O64852拟南芥sp|O64852|IQD6_ARATH Protein IQ-DOMAIN 651.700%Swiss-Prot高置信
Q9CAI2拟南芥sp|Q9CAI2|IQD8_ARATH Protein IQ-DOMAIN 840.700%Swiss-Prot中等置信
Q9FT53拟南芥sp|Q9FT53|IQD3_ARATH Protein IQ-DOMAIN 338.900%Swiss-Prot中等置信
Q93ZH7拟南芥sp|Q93ZH7|IQD2_ARATH Protein IQ-DOMAIN 242.300%Swiss-Prot中等置信

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