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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G373750
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 92538827-92543642 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2528 bp · TkA06G373750|TK1151|cDNA

GTTTATGGAATTTGCGAAGAAATAACAGGAACTTGCGTGCAAAAGGGGAACTCGAGATTCTCGGGGTCTCCTTGATTAATTAATAAACCGAATCGCACGTCTCAATTTTCAAACCCTAAAAATTCAGAGCATCTGGAAAGAGACAAGACGGAAGAATGACGAAAGTGAGATTGGAAAGAGAAAAGTCTCTGGAAAATAGATTGTTGACTCTCTTTCCCTCAACCTCCTTATGTAATCCATGGCGTATTCATCCAACACCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1587 bp · TkA06G373750|TK1151|CDS

ATGGGAAACTGCTGTATCACCCCCAATAAACCCACCGCCGCCAAAAACAAAAAACCAAACGCGTTTTCAGAATCCTACAGCACCAAACCCCGACCCGAACCCGAACCCAAAATCCACGTCTTAAAAAGCCCAACGGGCCACAACATATCACAAAAATACAATCTCGGACGCGAATTAGGAAGGGGCGAATTCGGAACAACGTATTTATGCACCGATTTGGAAACGGGCGAAAGATTTGCGTGCAAATCGATCTTGAAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

528 aa · TkA06G373750|TK1151|PROTEIN

MGNCCITPNKPTAAKNKKPNAFSESYSTKPRPEPEPKIHVLKSPTGHNISQKYNLGRELGRGEFGTTYLCTDLETGERFACKSILKKKLRTSIDVEDVRREVEIMKHLPKHDNIVTLKDSYEDENAVHIVMELCEGGELFDRIVARGHYTERAAAAIMKTIVEVVQICHTHGVMHRDLKPENFLFANKKETAALKTIDFGLSIFFKPGEVFKEIVGSPWYMAPEVLKRNYGPEIDVWSAGVILYILLCGVPPFWAETEQG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G373750
TK1151 IDTkA06G373750
OH-1004 IDLXL04_023241
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G373750
位置Chr06:92538827-92543642 (+)
描述Similar to CPK7: Calcium-dependent protein kinase 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g12480 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g19450 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g57530 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Arabidopsis calcium-dependent protein kinase AtCPK32 interacts with ABF4, a transcriptional regulator of abscisic acid-responsive gene expression, and modulates its activity.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.069757
At2g41860 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0568600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023241 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0004698 calcium,diacylglycerol-dependent serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G41860
ath:AT3G57530
ath:AT5G12480
ath:AT5G19450
dosa:Os07g0568600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.533
排名 1 · TkA06G373750 · TK1151
细胞质0.383
排名 2 · TkA06G373750 · TK1151
细胞核0.225
排名 3 · TkA06G373750 · TK1151
高尔基体0.060
排名 4 · TkA06G373750 · TK1151
内质网0.053
排名 5 · TkA06G373750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like50-108 aa
PF00069Pkinase53-311 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr55-307 aa
PF01636APH67-112 aa
PF06293Kdo82-199 aa
PF01163RIO193-189 aa
PF25578EF-hand_STIM1105-119 aa
PF03109ABC1129-206 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G373750PF14531Kinase-like501083.1e-0627.4
TkA06G373750PF00069Pkinase533116.8e-81272.2
TkA06G373750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr553076.2e-2795.2
TkA06G373750PF01636APH671120.1412.6
TkA06G373750PF06293Kdo821994.7e-0626.9
TkA06G373750PF01163RIO1931890.09813.0
TkA06G373750PF25578EF-hand_STIM11051190.5111.2
TkA06G373750PF03109ABC11292060.0001222.1
TkA06G373750PF14531Kinase-like1512993.1e-0627.4
TkA06G373750PF01636APH1701890.1412.6
TkA06G373750PF29176Allatotropin-like_C2842950.1112.8
TkA06G373750PF24548EF_EFCAB10_C2903041.7e-0731.5
TkA06G373750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3233716.2e-2795.2
TkA06G373750PF13833EF-hand_83563819.3e-1554.8
TkA06G373750PF25825SAPC2_N3564183.6e-0937.1
TkA06G373750PF30551CFAP251_C3574000.0813.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38873拟南芥sp|Q38873|CDPK7_ARATH Calcium-dependent protein kinase 776.400%Swiss-Prot高置信
Q42438拟南芥sp|Q42438|CDPK8_ARATH Calcium-dependent protein kinase 876.000%Swiss-Prot高置信
Q6NLQ6拟南芥sp|Q6NLQ6|CDPKW_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3272.200%Swiss-Prot高置信
P93759拟南芥sp|P93759|CDPKE_ARATH Calcium-dependent protein kinase 1472.300%Swiss-Prot高置信
Q84SL0水稻sp|Q84SL0|CDPKK_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2071.400%Swiss-Prot高置信

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