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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G363440
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 89993768-89997946 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1708 bp · TkA06G363440|TK1151|cDNA

TTTGACTTGGATTTGAAGAAACGAACTGTTGTTAGCATATTCTATAGGAGGAAAGCTGTTTAGGGTCAAATTGCAGCATTTAGGCACCACTACCTAACCTTCTTCCGTTCATCGTATCACCCTCCCCAAGCCTTCAACGCAAAAGTTCCCCGCCCCACATACAATCTCAGCTTTCATCGTATACTCTTCATCTTCAATTTGTAGTCCCACCTACCAATTTTTCATGACTTGGTTTGTGTCGCCCTCGAATTCTTTCGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1029 bp · TkA06G363440|TK1151|CDS

ATGAGTTCGTTAGTGGGTTCATCAGTTTTACCGCTCAATTCGCGGAATGTATCTTTTCTCTCCACTGGTTATTGTAAATCTCGCAACAAAATTGACACTTCATCGATCTACACAAGGAGAGTTGTCTGTTGTTGTATGGCTCCACAGAATTTAAAGCCCGCTGATGAATTTCGTCCCTCCAAATTCAACCAGGATTCGTCTTTGAATTTGTTTACAGAGGATTTGGACGAGACCGATGTTCTTCTACAGTGTAAAGATGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

342 aa · TkA06G363440|TK1151|PROTEIN

MSSLVGSSVLPLNSRNVSFLSTGYCKSRNKIDTSSIYTRRVVCCCMAPQNLKPADEFRPSKFNQDSSLNLFTEDLDETDVLLQCKDVYKSFGEKQILRGVNFKIKYGEAVGIIGPSGTGKSTILKIIAGLLTPDKGEVYIRGRKRLGLISDDDMSGLRIGLVFQSAALFDSLTVRENVGFLLYEHSRMPKDEIQELVAETLAAVGLKDVEDRMPSELSGGMKKRVALARSIIYDTTNNTIEPEVLLYDEPTAGLDPIAST...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G363440
TK1151 IDTkA06G363440
OH-1004 IDLXL04_023342
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G363440
位置Chr06:89993768-89997946 (+)
描述Similar to TGD3: Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g65410 ATP 酶转运蛋白参与从内质网 到质体的脂质转运，并且是类囊体形成所必需的。
A small ATPase protein of Arabidopsis, TGD3, involved in chloroplast lipid import.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m704063200
Disruption of Nap14, a plastid-localized non-intrinsic ABC protein in Arabidopsis thaliana results in the over-accumulation of transition metals and in aberrant chloroplast structures.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2010.02124.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023342 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0070508 cholesterol import 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65410
mbo:BQ2027_MB0674
mle:ML1892
mtc:MT0684
mtu:Rv0655
mtv:RVBD_0655
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.977
排名 1 · TkA06G363440 · TK1151
线粒体0.037
排名 2 · TkA06G363440 · TK1151
细胞质0.018
排名 3 · TkA06G363440 · TK1151
细胞核0.015
排名 4 · TkA06G363440 · TK1151
过氧化物酶体0.012
排名 5 · TkA06G363440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02224Cytidylate_kin31-72 aa
PF20703nSTAND191-132 aa
PF00005ABC_tran97-252 aa
PF13555AAA_29102-135 aa
PF13476AAA_23102-135 aa
PF03193RsgA_GTPase104-131 aa
PF25199nSTAND_NTPase5108-148 aa
PF13191AAA_16108-134 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G363440PF02224Cytidylate_kin31720.1712.3
TkA06G363440PF20703nSTAND1911320.2111.9
TkA06G363440PF00005ABC_tran972522.4e-31109.9
TkA06G363440PF13555AAA_291021359.3e-0522.8
TkA06G363440PF13476AAA_231021350.007517.6
TkA06G363440PF03193RsgA_GTPase1041310.1812.3
TkA06G363440PF25199nSTAND_NTPase51081480.005217.3
TkA06G363440PF13191AAA_161081340.08114.2
TkA06G363440PF02463SMC_N1092670.0314.5
TkA06G363440PF13238AAA_181101300.1912.9
TkA06G363440PF13304AAA_211111400.0001822.3
TkA06G363440PF13604AAA_301111380.1113.0
TkA06G363440PF13175AAA_151111340.1212.6
TkA06G363440PF02224Cytidylate_kin1111300.1712.3
TkA06G363440PF13521AAA_281111290.2912.0
TkA06G363440PF07728AAA_51121370.08313.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9AT00拟南芥sp|Q9AT00|TGD3_ARATH Protein TRIGALACTOSYLDIACYLGLYCEROL 3, chloroplastic81.200%Swiss-Prot高置信

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