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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G283200
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 71518437-71521071 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2227 bp · TkA06G283200|TK1151|cDNA

ACATAAGATATTTTTAAAAGTGGGATATTTTGGTGGATTTTGAGAAGTTGAATAAATATCTCACCTTCCATTAACCCTTGCATCTTTCCTTGCTGAGTTGCCATGGGGATGCCAATAGACGATGAAACAGAGGATGTTCAGAGGAGCAAGAGGCTTAAAAGCGGTACCGATGAAGACGAAGACTATTACTACGACGATATAGACGAGGAAGATAGTGGTGGTGGATTTTCGTTAAGGTTAGGCGAGTTTTTCAATCCGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1887 bp · TkA06G283200|TK1151|CDS

ATGGGGATGCCAATAGACGATGAAACAGAGGATGTTCAGAGGAGCAAGAGGCTTAAAAGCGGTACCGATGAAGACGAAGACTATTACTACGACGATATAGACGAGGAAGATAGTGGTGGTGGATTTTCGTTAAGGTTAGGCGAGTTTTTCAATCCGTTGATTCCGTCTTCAATTGTGGTTTCGGATGCCATGGAACCGGAATTTCCTATAATTTACGTTAATAAGGTCTTTGAATCCACCACCGGTTATCGCGCTGATGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

628 aa · TkA06G283200|TK1151|PROTEIN

MGMPIDDETEDVQRSKRLKSGTDEDEDYYYDDIDEEDSGGGFSLRLGEFFNPLIPSSIVVSDAMEPEFPIIYVNKVFESTTGYRADEVLGRNCRFLQYRDPRAQRRHPLVDPVCVSEMRRCLEEGIDFQGELLNFRKDGTPLVNRLRLTPIHGDDGTVTHVIGIQVFTEAKLDLNTISYPVFKIQSDHHQLTTRLEESSSSPIRQTKETECGILQLSDEVMAQNILSRLTPRDVASIGSVCRRIRQLTKNEHVRKMVCQN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G283200
TK1151 IDTkA06G283200
OH-1004 IDLXL04_028378
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)65.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.605 / OH-1004 93.760
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G283200
位置Chr06:71518437-71521071 (-)
描述Similar to ADO1: Adagio protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g68050 E3 泛素连接酶复合物的组成部分，在蓝光依赖性昼夜节律周期中发挥核心作用。
FKF1, a clock-controlled gene that regulates the transition to flowering in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1016/s0092-8674(00)80842-9
Functional conservation of light, oxygen, or voltage domains in light sensing.2003 · DOI: 10.1073/pnas.1031791100
FKF1 is essential for photoperiodic-specific light signalling in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1038/nature02090
FKF1 F-box protein mediates cyclic degradation of a repressor of CONSTANS in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1126/science.1110586
FKF1 and GIGANTEA complex formation is required for day-length measurement in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1126/science.1146994
Arabidopsis DOF transcription factors act redundantly to reduce CONSTANS expression and are essential for a photoperiodic flowering response.2009 · DOI: 10.1016/j.devcel.2009.06.015
LOV KELCH PROTEIN2 and ZEITLUPE repress Arabidopsis photoperiodic flowering under non-inductive conditions, dependent on FLAVIN-BINDING KELCH REPEAT F-BOX1.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04618.x
FKF1 conveys timing information for CONSTANS stabilization in photoperiodic flowering.2012 · DOI: 10.1126/science.1219644
At5g57360 E3 泛素连接酶复合物的组成部分，在蓝光依赖性昼夜节律周期中发挥核心作用。
LKP1 (LOV kelch protein 1): a factor involved in the regulation of flowering time in arabidopsis.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00850.x
An Arabidopsis circadian clock component interacts with both CRY1 and phyB.2001 · DOI: 10.1038/35068589
LOV KELCH PROTEIN2 and ZEITLUPE repress Arabidopsis photoperiodic flowering under non-inductive conditions, dependent on FLAVIN-BINDING KELCH REPEAT F-BOX1.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04618.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0547000 E3 泛素连接酶复合物的组成部分，在蓝光依赖性昼夜节律周期中发挥核心作用。 暂无已核实直接文献
Os06g0694000 E3 泛素连接酶复合物的组成部分，在蓝光依赖性昼夜节律周期中发挥核心作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0150800 E3 泛素连接酶复合物的组成部分，在蓝光依赖性昼夜节律周期中发挥核心作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028378 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程
GO:0043153 entrainment of circadian clock by photoperiod 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G18915
ath:AT5G57360
dosa:Os06g0694000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.391
排名 1 · TkA06G283200 · TK1151
细胞核0.330
排名 2 · TkA06G283200 · TK1151
质体0.118
排名 3 · TkA06G283200 · TK1151
线粒体0.113
排名 4 · TkA06G283200 · TK1151
细胞膜0.112
排名 5 · TkA06G283200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13188PAS_854-103 aa
PF13426PAS_965-165 aa
PF08448PAS_465-164 aa
PF08447PAS_370-164 aa
PF00989PAS70-164 aa
PF00989PAS218-249 aa
PF00646F-box218-253 aa
PF12937F-box-like223-259 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G283200PF13188PAS_8541030.03114.9
TkA06G283200PF13426PAS_9651655e-1762.8
TkA06G283200PF08448PAS_4651640.0003421.5
TkA06G283200PF08447PAS_3701642.4e-0731.6
TkA06G283200PF00989PAS701641.1e-0526.1
TkA06G283200PF00989PAS2182491.1e-0526.1
TkA06G283200PF00646F-box2182530.0001322.4
TkA06G283200PF12937F-box-like2232591.5e-0525.4
TkA06G283200PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC72884847e-56189.7
TkA06G283200PF13415Beta-prop_FBX422894492.9e-57194.3
TkA06G283200PF13854Kelch_HCF2893242.9e-1970.3
TkA06G283200PF24981Beta-prop_ATRN-LZTR12904325.4e-2485.7
TkA06G283200PF13418Beta-prop_TYW43065514.5e-1350.4
TkA06G283200PF07646Kelch_23073522e-2381.8
TkA06G283200PF01344Kelch_13073503.7e-1555.8
TkA06G283200PF13854Kelch_HCF3456052.9e-1970.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C9W9拟南芥sp|Q9C9W9|ADO3_ARATH Adagio protein 375.500%Swiss-Prot高置信
Q94BT6拟南芥sp|Q94BT6|ADO1_ARATH Adagio protein 165.500%Swiss-Prot高置信
Q2R2W1水稻sp|Q2R2W1|ADO3_ORYSJ Adagio-like protein 374.300%Swiss-Prot高置信
Q5Z8K3水稻sp|Q5Z8K3|ADO1_ORYSJ Adagio-like protein 164.500%Swiss-Prot高置信
Q67UX0水稻sp|Q67UX0|ADO2_ORYSJ Putative adagio-like protein 264.900%Swiss-Prot高置信

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