TkA06G242160 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G242160

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 61993325-61993956 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

570 bp · TkA06G242160|TK1151|cDNA

GGCGGCGTATCCCACGAAATAATCCGAAGTTTTCGATTTAATTTAGAGGAAATAGAGGCCGCCACACAGTATTTCGCCCCCGGGAATTTACTGGGCAAAAGCGTCTTTTCAGCCATTCATAAAGGAATGTTGAGAGATGGAACTATTGTTGCTATTAAGAGTATTATTAAGAGTAGCTGTAAGTCCGAAGAAGTCGAGTTTTTGAAAGGACTGAATGTTTTGAATTCTTTAAGACACGAGAATTTAGTGAGGTTGAGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

570 bp · TkA06G242160|TK1151|CDS

GGCGGCGTATCCCACGAAATAATCCGAAGTTTTCGATTTAATTTAGAGGAAATAGAGGCCGCCACACAGTATTTCGCCCCCGGGAATTTACTGGGCAAAAGCGTCTTTTCAGCCATTCATAAAGGAATGTTGAGAGATGGAACTATTGTTGCTATTAAGAGTATTATTAAGAGTAGCTGTAAGTCCGAAGAAGTCGAGTTTTTGAAAGGACTGAATGTTTTGAATTCTTTAAGACACGAGAATTTAGTGAGGTTGAGAGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

189 aa · TkA06G242160|TK1151|PROTEIN

GGVSHEIIRSFRFNLEEIEAATQYFAPGNLLGKSVFSAIHKGMLRDGTIVAIKSIIKSSCKSEEVEFLKGLNVLNSLRHENLVRLRGFCCSKGRGECFLIYDFVPNGNLLSYLDMKDDGHVLDWSTRASIINGIARGIEYLHGSKLNKPVLVHQNISVKNVLLDQRFKPLLSDSGLHQLLTKDTVFFVT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G242160`
TK1151 ID	TkA06G242160
OH-1004 ID	LXL04_012011
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	97.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.413 / OH-1004 26.458 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G242160

位置 Chr06:61993325-61993956 (+)

描述 Similar to NIK2: Protein NSP-INTERACTING KINASE 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g61460`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61460。	暂无已核实直接文献
`At4g23250`	富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶17。	暂无已核实直接文献
`At1g61420`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61420。	暂无已核实直接文献
`At1g01540`	可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g01540。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012011 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程

GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程

GO:0048638 regulation of developmental growth 生物过程

GO:0051302 regulation of cell division 生物过程

GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程

GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程

GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G25560

ath:AT4G20140

dosa:Os02g0283800

osa:4329032

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.537

排名 1 · TkA06G242160 · TK1151

细胞质0.327

排名 2 · TkA06G242160 · TK1151

细胞核0.255

排名 3 · TkA06G242160 · TK1151

内质网0.036

排名 4 · TkA06G242160 · TK1151

高尔基体0.027

排名 5 · TkA06G242160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr29-183 aa

PF00069Pkinase29-184 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G242160	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	29	183	2.1e-24	86.9
TkA06G242160	`PF00069`	Pkinase	29	184	1.4e-16	61.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O64774`	拟南芥	sp\|O64774\|Y1146_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61460	37.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8L710`	拟南芥	sp\|Q8L710\|CRK17_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 17	40.200%	Swiss-Prot	中等置信
`O64778`	拟南芥	sp\|O64778\|Y1142_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61420	38.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q3EDL4`	拟南芥	sp\|Q3EDL4\|Y1154_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g01540	37.400%	Swiss-Prot	中等置信

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