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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G187660
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 48981032-48984910 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2662 bp · TkA06G187660|TK1151|cDNA

AAAACACCGAGTTGACCAAAATTTGATGCCATCTTCGTCTGTCACATCTTTCTTATACTATTATTAATACACACTTCCACGATTAAGCTCGCAGGCCTCACTAACCCTTCAATTCCTCTCTCAGAAAACGAATTTCTCTTTTCCAAATTCCTCTTCCAAGATCCAATTCATCACGCGAAGCTTCATTAATGAGTTCCCAATTTCCTTAGCCCTAAACCCCTTTTCGACTTTTCATTTCTTGGGGTTCTGATCAATTTTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1614 bp · TkA06G187660|TK1151|CDS

ATGGGACTGTTTCATTGGTCTTACATGGGTTGGGTATCATTCAGAGCTGATTATATTGCTCCATCGATCATGATGTTATCGCAATTCTGTGTTGTTCTTTTCATGATTCAATCGCTTGATCGATTTATACTAGGAATGGGATGTTTTTGGATCAAGTTCAGGAACATAAAACCGACAATTGATGGCGACGCTTATGACATTGAAGATGCTTCCAGTTTCCCCATGGTCCTTGTTCAGATCCCCATGTGCAATGAAAGAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

537 aa · TkA06G187660|TK1151|PROTEIN

MGLFHWSYMGWVSFRADYIAPSIMMLSQFCVVLFMIQSLDRFILGMGCFWIKFRNIKPTIDGDAYDIEDASSFPMVLVQIPMCNEREVYQQSIASACQLDWPKDRILIQVLDDSSDELLQMLIRNEVNLWSQKGVNIIYRHRFIRTGYKAGNLHSAMSCDYVKNYEFVAILDADFQPNPDFLQLTVPHFQGKPDVGLVQARWSFVNKDENLLTRLQNINLCFHFEVEQQVNSHFLSFFGFNGTAGVWRIKALEESGGWLE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G187660
TK1151 IDTkA06G187660
OH-1004 IDLXL04_006169
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.814 / OH-1004 80.514
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G187660
位置Chr06:48981032-48984910 (+)
描述Similar to CSLC4: Xyloglucan glycosyltransferase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28180 Beta-1,4-葡聚糖合酶比纤维素更参与木葡聚糖主链的合成。
A gene from the cellulose synthase-like C family encodes a beta-1,4 glucan synthase.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0703133104
Protein-protein interactions among xyloglucan-synthesizing enzymes and formation of Golgi-localized multiprotein complexes.2015 · DOI: 10.1093/pcp/pcu161
At2g24630 可能的β-1,4-葡聚糖合酶，更可能参与木葡聚糖骨架而非纤维素的合成。 暂无已核实直接文献
At4g31590 可能的β-1,4-葡聚糖合酶，更可能参与木葡聚糖骨架而非纤维素的合成。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0428000 可能的β-1,4-葡聚糖合酶，更可能参与木葡聚糖骨架而非纤维素的合成。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q7PC70 可能的β-1,4-葡聚糖合酶，更可能参与木葡聚糖骨架而非纤维素的合成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006169 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0048868 pollen tube development 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0099402 plant organ development 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0016757 glycosyltransferase activity 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24630
ath:AT3G28180
ath:AT4G31590
dosa:Os09g0428000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.466
排名 1 · TkA06G187660 · TK1151
高尔基体0.272
排名 2 · TkA06G187660 · TK1151
细胞膜0.128
排名 3 · TkA06G187660 · TK1151
细胞质0.115
排名 4 · TkA06G187660 · TK1151
细胞核0.108
排名 5 · TkA06G187660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03142Chitin_synth_258-113 aa
PF13506Glyco_transf_2173-326 aa
PF13641Glyco_tranf_2_374-307 aa
PF00535Glycos_transf_279-226 aa
PF03142Chitin_synth_2161-257 aa
PF13632Glyco_trans_2_3168-362 aa
PF03142Chitin_synth_2278-433 aa
PF20967MASE7404-428 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G187660PF03142Chitin_synth_2581130.001118.5
TkA06G187660PF13506Glyco_transf_21733262e-1247.4
TkA06G187660PF13641Glyco_tranf_2_3743071e-1352.3
TkA06G187660PF00535Glycos_transf_2792269.2e-1142.7
TkA06G187660PF03142Chitin_synth_21612570.001118.5
TkA06G187660PF13632Glyco_trans_2_31683629.2e-2381.8
TkA06G187660PF03142Chitin_synth_22784330.001118.5
TkA06G187660PF20967MASE74044281.49.3
TkA06G187660PF20967MASE74935311.49.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJP4拟南芥sp|Q9LJP4|CSLC4_ARATH Xyloglucan glycosyltransferase 477.800%Swiss-Prot高置信
Q9SJA2拟南芥sp|Q9SJA2|CSLC8_ARATH Probable xyloglucan glycosyltransferase 877.200%Swiss-Prot高置信
Q9SB75拟南芥sp|Q9SB75|CSLC5_ARATH Probable xyloglucan glycosyltransferase 576.000%Swiss-Prot高置信
Q69L19水稻sp|Q69L19|CSLC2_ORYSJ Probable xyloglucan glycosyltransferase 275.600%Swiss-Prot高置信
Q7PC70水稻sp|Q7PC70|CSLC2_ORYSI Probable xyloglucan glycosyltransferase 275.400%Swiss-Prot高置信

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