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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G147240
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 38651391-38653364 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1363 bp · TkA06G147240|TK1151|cDNA

GTTTTTATCACAGTACTTGTCATAAGACAAGAGGAAAAATACAAACTTTGTTATAAAATTTGAAGGAGCGGTGGCAGCCATATGAGCTGCGACAGACAGGGAACTCTGATGTGAAAACAATGGAGATCCTCCTCTTCTTTTGAACCACCAACTTCGTCTTCTAATTTCTCTGTCTCCTATTTGCTACGATTCGAATTTGATGCTGTGTGTACTGTTTATCGCTCTAAACCAATGCGATGATTGCGGTAGGAAATGGGTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

903 bp · TkA06G147240|TK1151|CDS

ATGATTGCGGTAGGAAATGGGTCGCTGATTTTCAGTTCCCCCCTGGGGTGTAATCTCTTCGAAGCCCAATCAACGAAGGTAGGGTTCGTGAACTTCCCGGCAACGACGCTCAATTGCCGTCGGAGCTTGTCGTCAACGTTGACGAACTTAGCGCCTATCAAAGCAAATGGGGGATCGCGAATGTCTTCGTTAAAATCCGGTATTGAAGTCAATTCGAATGAAAGAGCTATCATCAACAATTCGGATGATTCGAGTGTAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

300 aa · TkA06G147240|TK1151|PROTEIN

MIAVGNGSLIFSSPLGCNLFEAQSTKVGFVNFPATTLNCRRSLSSTLTNLAPIKANGGSRMSSLKSGIEVNSNERAIINNSDDSSVGSVRHEISTKGKRSTNIVWHKCSVEKIDRQELLQQKGCVIWITGLSGSGKSTLACALTRGLHSGGKLTYVLDGDNVRHGLNRDLTFKPEDRAENIRRIGEVAKLFSDAGIICIASVISPYRSDRDAIRSMLPDGDFIEVFMDTPLGVCEARDPKGLYKLARAGKIKGFTGVDDP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G147240
TK1151 IDTkA06G147240
OH-1004 IDLXL04_024399
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G147240
位置Chr06:38651391-38653364 (-)
描述Similar to APK1: Adenylyl-sulfate kinase 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g14750 催化活性硫酸盐的合成。
Molecular and catalytic properties of Arabidopsis thaliana adenylyl sulfate (APS)-kinase.2001 · DOI: 10.1006/abbi.2001.2453
At4g39940 催化活性硫酸盐的合成。
Molecular and catalytic properties of Arabidopsis thaliana adenylyl sulfate (APS)-kinase.2001 · DOI: 10.1006/abbi.2001.2453
Disruption of adenosine-5'-phosphosulfate kinase in Arabidopsis reduces levels of sulfated secondary metabolites.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.065581
Adenosine-5'-phosphosulfate kinase is essential for Arabidopsis viability.2010 · DOI: 10.1016/j.febslet.2009.11.014
Interaction of glucosinolate content of Arabidopsis thaliana mutant lines and feeding and oviposition by generalist and specialist lepidopterans.2013 · DOI: 10.1016/j.phytochem.2012.11.006
At5g67520 催化腺苷 5'-磷酸硫酸盐磷酸化至 3'-磷酸腺苷硫酸盐，这是硫酸化反应的活化硫酸形式。
Adenosine-5'-phosphosulfate kinase is essential for Arabidopsis viability.2010 · DOI: 10.1016/j.febslet.2009.11.014
At3g03900 催化活性硫酸盐的合成，用于次级代谢产物的硫酸化，包括芥子油苷。
Adenosine-5'-phosphosulfate kinase is essential for Arabidopsis viability.2010 · DOI: 10.1016/j.febslet.2009.11.014

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024399 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000103 sulfate assimilation 生物过程
GO:0016310 phosphorylation 生物过程
GO:0019344 L-cysteine biosynthetic process 生物过程
GO:0070814 hydrogen sulfide biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0004020 adenylylsulfate kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G14750
ath:AT3G03900
ath:AT4G39940
ath:AT5G67520
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.945
排名 1 · TkA06G147240 · TK1151
线粒体0.075
排名 2 · TkA06G147240 · TK1151
细胞质0.036
排名 3 · TkA06G147240 · TK1151
细胞核0.034
排名 4 · TkA06G147240 · TK1151
过氧化物酶体0.015
排名 5 · TkA06G147240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19422Ariadne42-119 aa
PF01656CbiA45-73 aa
PF13476AAA_2378-107 aa
PF03193RsgA_GTPase107-145 aa
PF18766SWI2_SNF2111-191 aa
PF20720nSTAND3116-156 aa
PF00437T2SSE116-143 aa
PF24883NPHP3_N117-152 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G147240PF19422Ariadne421190.09813.2
TkA06G147240PF01656CbiA45730.001918.8
TkA06G147240PF13476AAA_23781070.06614.6
TkA06G147240PF03193RsgA_GTPase1071450.212.1
TkA06G147240PF18766SWI2_SNF21111910.1812.2
TkA06G147240PF20720nSTAND31161560.001119.4
TkA06G147240PF00437T2SSE1161430.1911.1
TkA06G147240PF24883NPHP3_N1171520.002219.0
TkA06G147240PF13555AAA_291201490.001119.4
TkA06G147240PF00005ABC_tran1211550.001419.9
TkA06G147240PF01583APS_kinase1222713e-69232.6
TkA06G147240PF13481AAA_251221530.1512.4
TkA06G147240PF13191AAA_161231640.03215.5
TkA06G147240PF03308MeaB1231560.05913.1
TkA06G147240PF13671AAA_331252375.8e-0627.4
TkA06G147240PF05729NACHT1251510.03114.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q43295拟南芥sp|Q43295|APK1_ARATH Adenylyl-sulfate kinase 1, chloroplastic77.100%Swiss-Prot高置信
O49196拟南芥sp|O49196|APK2_ARATH Adenylyl-sulfate kinase 2, chloroplastic61.300%Swiss-Prot高置信
Q84JF0拟南芥sp|Q84JF0|APK4_ARATH Adenylyl-sulfate kinase 4, chloroplastic65.400%Swiss-Prot高置信
Q9SRW7拟南芥sp|Q9SRW7|APK3_ARATH Adenylyl-sulfate kinase 369.900%Swiss-Prot中等置信

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