TkA06G146850 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G146850

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 38486661-38490973 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1814 bp · TkA06G146850|TK1151|cDNA

CACAAGCGCTTAAAATGTAGCGAGTTACTGCAAACAGCTTTTATATATATAGTTGGTGGGATTACACAATCCCTTCGTTTTCAAACACTTAATCATATACGCCATGTGAAGTACTCGAAGAATCCTCCACAGTTCAAGAAATTAACCATTTGGGATGAGACTTCATACGAAATACTATATGTAAGCAAACACCACGAAATTAGGAGAAAGCTGCTTAACAAAATATGGACATGGGGTACGGAGCTTACGTTGATACGCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1395 bp · TkA06G146850|TK1151|CDS

ATGGACATGGGGTACGGAGCTTACGTTGATACGCAACTTGAATCGCTCGTTGATAGAATCCATCCTCCAAGGGTTTGCATCGACAATGATTCGTATTCAGATTGCACCCTTGTGAAGGTTGATAGTACGAACAAGCCTGGGGTGTTGTTGGAGATGGTGCAAGAGCTAACGGATCTTGGCCTTGTCATCTCCAAATCGTACATTTGTTCCGATGGTCCCTGGTTCATGGATGTATTCCACGTGTCCGATCAATCTAGCAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

464 aa · TkA06G146850|TK1151|PROTEIN

MDMGYGAYVDTQLESLVDRIHPPRVCIDNDSYSDCTLVKVDSTNKPGVLLEMVQELTDLGLVISKSYICSDGPWFMDVFHVSDQSSNKITDKNLIRHIQQSICASRREKTEVKPTSLGKEIRLRNLPTDHTTLEMTMVDKPGMLSEISAVLAELKCHVSAAVAWTHNNRAACIIHVQDDLKSGPIMDPHRVNRVQAYLSTVVNAHHNNNEHRSLRLTSPTTGQTHTERRLHQLMMADKDYEETSYASSSIKHYDTVVTVE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G146850`
TK1151 ID	TkA06G146850
OH-1004 ID	LXL04_025740
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	48.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 86.853 / OH-1004 86.147 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G146850

位置 Chr06:38486661-38490973 (+)

描述 Similar to ACR4: ACT domain-containing protein ACR4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g65890`	可能结合氨基酸。	暂无已核实直接文献
`At1g76990`	可能结合氨基酸。	Molecular characterization of a novel gene family encoding ACT domain repeat proteins in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.007484
`At5g25320`	可能结合氨基酸。	暂无已核实直接文献
`At1g69040`	可能结合氨基酸。	暂无已核实直接文献
`At1g12420`	可能结合氨基酸。	Molecular characterization of a novel gene family encoding ACT domain repeat proteins in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.007484

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025740 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006521 regulation of amino acid metabolic process 生物过程

GO:0009735 response to cytokinin 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016597 amino acid binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G12420

ath:AT1G69040

ath:AT1G76990

ath:AT2G03730

ath:AT3G01990

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.491

排名 1 · TkA06G146850 · TK1151

细胞核0.415

排名 2 · TkA06G146850 · TK1151

细胞膜0.135

排名 3 · TkA06G146850 · TK1151

溶酶体／液泡0.060

排名 4 · TkA06G146850 · TK1151

内质网0.040

排名 5 · TkA06G146850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24931ACT_ACR9_3rd25-99 aa

PF26956ACT_ACR_D132-108 aa

PF24914ACR10_N32-103 aa

PF13840ACT_733-60 aa

PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant36-101 aa

PF01842ACT37-87 aa

PF13291ACT_438-65 aa

PF22629ACT_AHAS_ss40-52 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G146850	`PF24931`	ACT_ACR9_3rd	25	99	1.4e-16	61.0
TkA06G146850	`PF26956`	ACT_ACR_D1	32	108	1.4e-52	176.2
TkA06G146850	`PF24914`	ACR10_N	32	103	1.9e-11	44.0
TkA06G146850	`PF13840`	ACT_7	33	60	0.087	13.4
TkA06G146850	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	36	101	1e-12	48.7
TkA06G146850	`PF01842`	ACT	37	87	2.7e-33	114.0
TkA06G146850	`PF13291`	ACT_4	38	65	3.7e-12	47.4
TkA06G146850	`PF22629`	ACT_AHAS_ss	40	52	4.8e-08	33.8
TkA06G146850	`PF24926`	ACT_ACR9_C	43	83	0.0002	21.9
TkA06G146850	`PF13740`	ACT_6	43	57	0.00077	20.0
TkA06G146850	`PF24931`	ACT_ACR9_3rd	127	195	1.4e-16	61.0
TkA06G146850	`PF24914`	ACR10_N	129	168	1.9e-11	44.0
TkA06G146850	`PF01842`	ACT	131	167	2.7e-33	114.0
TkA06G146850	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	131	167	1e-12	48.7
TkA06G146850	`PF13291`	ACT_4	131	176	3.7e-12	47.4
TkA06G146850	`PF26956`	ACT_ACR_D1	132	179	1.4e-52	176.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FHP1`	拟南芥	sp\|Q9FHP1\|ACR1_ARATH ACT domain-containing protein ACR1	48.600%	Swiss-Prot	中等置信
`O49285`	拟南芥	sp\|O49285\|ACR3_ARATH ACT domain-containing protein ACR3	50.200%	Swiss-Prot	高置信
`F4JWR0`	拟南芥	sp\|F4JWR0\|ACR2_ARATH ACT domain-containing protein ACR2	43.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8LJW3`	拟南芥	sp\|Q8LJW3\|ACR4_ARATH ACT domain-containing protein ACR4	44.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LNA5`	拟南芥	sp\|Q9LNA5\|ACR8_ARATH ACT domain-containing protein ACR8	45.600%	Swiss-Prot	中等置信

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