TkA06G131790 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G131790

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 34445618-34447546 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1737 bp · TkA06G131790|TK1151|cDNA

AAACTTGAAACATGGAGGAAGGAAAAGGAAAAGAAGATGAAAAAATTAAAATCAACTCGTATTCATGTGCTTGTGCCATTGTTGCTTCCATGATCTCCATCATCTTTGGTTATGAGACGGGTGTTATGAGTGGAGCGTTGATCTTTATCGAAGAAGACCTTAAAATCAACGACGTACAAGTCCAAGTCCTTGCCGGAATTATCAATTTTTGCGCTCTAGTTGGTGCACTGACCGCCGGCAGAACCTCCGACTACATAGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1494 bp · TkA06G131790|TK1151|CDS

ATGGAGGAAGGAAAAGGAAAAGAAGATGAAAAAATTAAAATCAACTCGTATTCATGTGCTTGTGCCATTGTTGCTTCCATGATCTCCATCATCTTTGGTTATGAGACGGGTGTTATGAGTGGAGCGTTGATCTTTATCGAAGAAGACCTTAAAATCAACGACGTACAAGTCCAAGTCCTTGCCGGAATTATCAATTTTTGCGCTCTAGTTGGTGCACTGACCGCCGGCAGAACCTCCGACTACATAGGCCGCCGATACAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

497 aa · TkA06G131790|TK1151|PROTEIN

MEEGKGKEDEKIKINSYSCACAIVASMISIIFGYETGVMSGALIFIEEDLKINDVQVQVLAGIINFCALVGALTAGRTSDYIGRRYTISAASIIFLVGSLLMGFAPTYALLLTGRCVAGIGVGFALVIAPVYSAEISAANSRGILSSLPELGISIGILSGYISNYFLASLPLNIGWRVMFAIAAIPSLGLAIGILGMPESPRWLVMQGRLRDAKQVLSKVSNTKDEAESRLQDIKLAAGIDPNCKDDFVSLKHSTRGQGV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G131790`
TK1151 ID	TkA06G131790
OH-1004 ID	LXL04_024552
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G131790

位置 Chr06:34445618-34447546 (-)

描述 Similar to PLT6: Probable polyol transporter 6

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g36670`	质膜糖／质子同向转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`At2g18480`	质膜糖／质子同向转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`At3g18830`	质膜广谱糖质子同向转运蛋白。	Analysis of transport activity of Arabidopsis sugar alcohol permease homolog AtPLT5.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m410831200 Arabidopsis POLYOL TRANSPORTER5, a new member of the monosaccharide transporter-like superfamily, mediates H+-Symport of numerous substrates, including myo-inositol, glycerol, and ribose.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.026641
`At2g16120`	质膜糖／质子同向转运蛋白。	暂无已核实直接文献
`At2g16130`	质膜糖／质子同向转运蛋白。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024552 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0010311 lateral root formation 生物过程

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0090406 pollen tube 细胞组分

GO:0005351 carbohydrate:proton symporter activity 分子功能

GO:0005354 galactose transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0005365 myo-inositol transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015145 monosaccharide transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015148 D-xylose transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015168 glycerol transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015575 mannitol transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G16120

ath:AT2G16130

ath:AT2G18480

ath:AT3G18830

ath:AT4G36670

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.591

排名 1 · TkA06G131790 · TK1151

溶酶体／液泡0.151

排名 2 · TkA06G131790 · TK1151

细胞质0.112

排名 3 · TkA06G131790 · TK1151

内质网0.089

排名 4 · TkA06G131790 · TK1151

线粒体0.060

排名 5 · TkA06G131790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00083Sugar_tr21-480 aa

PF07690MFS_127-421 aa

PF06609TRI1261-208 aa

PF07690MFS_1318-475 aa

PF06609TRI12363-381 aa

PF20258tRNA_Me_trans_C407-456 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G131790	`PF00083`	Sugar_tr	21	480	3.3e-108	363.2
TkA06G131790	`PF07690`	MFS_1	27	421	3.4e-33	115.7
TkA06G131790	`PF06609`	TRI12	61	208	0.00061	19.1
TkA06G131790	`PF07690`	MFS_1	318	475	3.4e-33	115.7
TkA06G131790	`PF06609`	TRI12	363	381	0.00061	19.1
TkA06G131790	`PF20258`	tRNA_Me_trans_C	407	456	0.018	16.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GXR2`	拟南芥	sp\|Q8GXR2\|PLT6_ARATH Probable polyol transporter 6	67.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q9ZNS0`	拟南芥	sp\|Q9ZNS0\|PLT3_ARATH Probable polyol transporter 3	64.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q8VZ80`	拟南芥	sp\|Q8VZ80\|PLT5_ARATH Polyol transporter 5	58.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9XIH7`	拟南芥	sp\|Q9XIH7\|PLT1_ARATH Putative polyol transporter 1	57.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9XIH6`	拟南芥	sp\|Q9XIH6\|PLT2_ARATH Putative polyol transporter 2	58.300%	Swiss-Prot	高置信

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