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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G131440
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 34323720-34327691 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2286 bp · TkA06G131440|TK1151|cDNA

TTAACGTTCCACTTCTATTGCAATAGGCCAATAGCCCATCCTACGCCGGACTTGAATACTCCCTTTTTCTAATTCTTGTCGTTTCCCCATTTGTGTAATTGTGTTATCCTGCACATCCTTATTCGTAATCAGGGATTACACGAATAGATACATCGATATACATATCAGCGATTATGTGGCGGTGCTTGTCGTGTGGCCTTCGCATTCCATCTCGGAGATCCATCTCCGGCAGCTCCATTTCACACAAATTCTTTTCTTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1551 bp · TkA06G131440|TK1151|CDS

ATGTGGCGGTGCTTGTCGTGTGGCCTTCGCATTCCATCTCGGAGATCCATCTCCGGCAGCTCCATTTCACACAAATTCTTTTCTTCACAATCGAATACAGGAGGGTCATCGTATACAATTGTAGATCATACATATGACGCGGTCGTCGTCGGGGCAGGCGGTGCTGGACTTCGAGCTGCAATAGGGCTATCGGAGCATGGATTCAATACTGCTTGCATTACAAAGCTTTTCCCAACACGTTCACACACCGTTGCTGCTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

516 aa · TkA06G131440|TK1151|PROTEIN

MWRCLSCGLRIPSRRSISGSSISHKFFSSQSNTGGSSYTIVDHTYDAVVVGAGGAGLRAAIGLSEHGFNTACITKLFPTRSHTVAAQGGINAALGNMSEDDWRWHMYDTVKGSDWLGDQDAIQYMCREAPKAVIELENYGLPFSRTEEGKIYQRAFGGQSLDFGKGGQAYRCACAADRTGHALLHTLYGQAMKHNTQFFVEYFALDLIMASDGSCQGVIALNMEDGTLHRFRSSSTILATGGYGRTYFSATSAHTCTGDG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G131440
TK1151 IDTkA06G131440
OH-1004 IDLXL04_024560
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.760 / OH-1004 73.291
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G131440
位置Chr06:34323720-34327691 (-)
描述Similar to SDH1-1: Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 1, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g66760 琥珀酸脱氢酶（SDH）的黄素蛋白（FP）亚基，参与线粒体电子传递链复合物II，负责将电子从琥珀酸传递给泛醌（辅酶Q）。 暂无已核实直接文献
At2g18450 琥珀酸脱氢酶（SDH）的黄素蛋白（FP）亚基，参与线粒体电子传递链复合物II，负责将电子从琥珀酸传递给泛醌（辅酶Q）。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0134800 琥珀酸脱氢酶（SDH）的黄素蛋白（FP）亚基，参与线粒体电子传递链复合物II，负责将电子从琥珀酸传递给泛醌（辅酶Q）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024560 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006099 tricarboxylic acid cycle 生物过程
GO:0006121 mitochondrial electron transport, succinate to ubiquinone 生物过程
GO:0006909 phagocytosis 生物过程
GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程
GO:0046956 positive phototaxis 生物过程
GO:0050829 defense response to Gram-negative bacterium 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0045273 respiratory chain complex II (succinate dehydrogenase) 细胞组分
GO:0045335 phagocytic vesicle 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G18450
ath:AT5G66760
ddi:DDB_G0280535
dosa:Os07g0134800
spo:2541690
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.926
排名 1 · TkA06G131440 · TK1151
细胞质0.069
排名 2 · TkA06G131440 · TK1151
细胞核0.048
排名 3 · TkA06G131440 · TK1151
质体0.020
排名 4 · TkA06G131440 · TK1151
细胞膜0.019
排名 5 · TkA06G131440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17283Zn_ribbon_SprT2-17 aa
PF07992Pyr_redox_245-84 aa
PF01946Thi445-74 aa
PF01494FAD_binding_345-81 aa
PF00890FAD_binding_246-442 aa
PF01266DAO46-152 aa
PF01134GIDA46-76 aa
PF03486HI0933_like46-91 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G131440PF17283Zn_ribbon_SprT2170.8510.4
TkA06G131440PF07992Pyr_redox_245840.0003121.0
TkA06G131440PF01946Thi445740.0009819.1
TkA06G131440PF01494FAD_binding_345810.008816.0
TkA06G131440PF00890FAD_binding_2464425.1e-125418.6
TkA06G131440PF01266DAO461523.2e-0524.4
TkA06G131440PF01134GIDA46760.001118.8
TkA06G131440PF03486HI0933_like46910.01116.0
TkA06G131440PF13738Pyr_redox_348731.29.0
TkA06G131440PF17283Zn_ribbon_SprT1691760.8510.4
TkA06G131440PF01134GIDA1932530.001118.8
TkA06G131440PF01946Thi41952160.0009819.1
TkA06G131440PF07992Pyr_redox_22222450.0003121.0
TkA06G131440PF03486HI0933_like2272480.01116.0
TkA06G131440PF13738Pyr_redox_32312471.29.0
TkA06G131440PF01494FAD_binding_33083410.008816.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O82663拟南芥sp|O82663|SDHA1_ARATH Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 1, mitochondrial92.900%Swiss-Prot高置信
Q9ZPX5拟南芥sp|Q9ZPX5|SDHA2_ARATH Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 2, mitochondrial88.500%Swiss-Prot高置信
Q6ZDY8水稻sp|Q6ZDY8|SDHA_ORYSJ Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial90.200%Swiss-Prot高置信

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