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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G125400
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 32810432-32810980 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

549 bp · TkA06G125400|TK1151|cDNA

ATGGAAGAAATCACAAATCTACTCTTCGATCTTCAAACTCTTAATGAAGAGGCCAAATCCACTCACAGCCGCAAAGTCCTTCGCGGATTACGAGACCGAATGGAATCCGACATGGTTTCCGTTCTCAGAAAAGCAACCGTCGTCAAAACACGTCTCGAATGTCTCGACAATTCCAACGAATTGAACAAAAAATCTTCATACAAAGAAAACAGTGCTGTCGATCGAACATGGGTTTCCGTCACCAACGGACTTAGATCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

549 bp · TkA06G125400|TK1151|CDS

ATGGAAGAAATCACAAATCTACTCTTCGATCTTCAAACTCTTAATGAAGAGGCCAAATCCACTCACAGCCGCAAAGTCCTTCGCGGATTACGAGACCGAATGGAATCCGACATGGTTTCCGTTCTCAGAAAAGCAACCGTCGTCAAAACACGTCTCGAATGTCTCGACAATTCCAACGAATTGAACAAAAAATCTTCATACAAAGAAAACAGTGCTGTCGATCGAACATGGGTTTCCGTCACCAACGGACTTAGATCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

182 aa · TkA06G125400|TK1151|PROTEIN

MEEITNLLFDLQTLNEEAKSTHSRKVLRGLRDRMESDMVSVLRKATVVKTRLECLDNSNELNKKSSYKENSAVDRTWVSVTNGLRSKLKEMMNDFQDLRDKIVSDHKDYLKKRYYNETGEYPSDGIMETMVSGNGKVFEGKKDVVMENKERHEAVMDIKRSLNRLHQVFLDMAILVEEQGRI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G125400
TK1151 IDTkA06G125400
OH-1004 IDLXL04_024598
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.901 / OH-1004 59.801
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G125400
位置Chr06:32810432-32810980 (+)
描述Similar to SYP112: Syntaxin-112
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g18260 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g52400 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g03330 囊泡运输蛋白，在分泌途径中发挥作用（可能）。
Syntaxin of plant proteins SYP123 and SYP132 mediate root hair tip growth in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1093/pcp/pcu048
At3g11820 参与分泌途径的小泡转运蛋白（根据相似性推测）。
Arabidopsis SNAREs SYP61 and SYP121 coordinate the trafficking of plasma membrane aquaporin PIP2;7 to modulate the cell membrane water permeability.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127159

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0736500 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024598 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006906 vesicle fusion 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0048278 vesicle docking 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0061025 membrane fusion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009504 cell plate 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08560
ath:AT1G61290
ath:AT2G18260
ath:AT4G03330
osa:107276918
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.599
排名 1 · TkA06G125400 · TK1151
细胞核0.219
排名 2 · TkA06G125400 · TK1151
细胞膜0.157
排名 3 · TkA06G125400 · TK1151
溶酶体／液泡0.106
排名 4 · TkA06G125400 · TK1151
高尔基体0.068
排名 5 · TkA06G125400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00804Syntaxin1-138 aa
PF30799DUF499_4th5-49 aa
PF05757PsbQ8-42 aa
PF13339AATF-Che116-24 aa
PF05919Mitovir_RNA_pol22-162 aa
PF30563DUF863028-63 aa
PF05739SNARE32-55 aa
PF08698Fcf248-71 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G125400PF00804Syntaxin11384e-33115.2
TkA06G125400PF30799DUF499_4th5490.05513.9
TkA06G125400PF05757PsbQ8420.001319.5
TkA06G125400PF13339AATF-Che116240.06214.6
TkA06G125400PF05919Mitovir_RNA_pol221620.1212.1
TkA06G125400PF30563DUF863028630.009316.4
TkA06G125400PF05739SNARE32558.8e-0935.8
TkA06G125400PF08698Fcf248710.07714.0
TkA06G125400PF13339AATF-Che1541320.06214.6
TkA06G125400PF14362DUF4407591550.09612.7
TkA06G125400PF30799DUF499_4th691460.05513.9
TkA06G125400PF05757PsbQ741110.001319.5
TkA06G125400PF05739SNARE87978.8e-0935.8
TkA06G125400PF08698Fcf2871550.07714.0
TkA06G125400PF30563DUF8630881060.009316.4
TkA06G125400PF30563DUF86301421670.009316.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZPV9拟南芥sp|Q9ZPV9|SY112_ARATH Syntaxin-11258.100%Swiss-Prot高置信
Q9SVC2拟南芥sp|Q9SVC2|SY122_ARATH Syntaxin-12237.400%Swiss-Prot中等置信
Q9ZQZ8拟南芥sp|Q9ZQZ8|SY123_ARATH Syntaxin-12339.900%Swiss-Prot中等置信
Q9ZSD4拟南芥sp|Q9ZSD4|SY121_ARATH Syntaxin-12137.200%Swiss-Prot中等置信
Q84R43水稻sp|Q84R43|SY111_ORYSJ Syntaxin-11140.900%Swiss-Prot中等置信

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