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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G117970
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 30877314-30882040 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3596 bp · TkA06G117970|TK1151|cDNA

GATTTATGTAAGTGGATGACTTCACAAGAAGCGTCTTAAGACTAGTGATCTCGTATGATTAGAAAGATCTTTTTTTATAATATTAAAAATAACATGCCACATACAAAACGCCAACCCAACTATATCATCACATAATGTCACCACTTCAAACTAAACAAAAATGGCATCCGCTCCAAAAACTATTTTCAACAAAATCTCTGCAACCTTAACTTCATCAACAATAAACCACTCACCTGGCAGAAGAAGTCCACGTGGCAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

3135 bp · TkA06G117970|TK1151|CDS

ATGGCATCCGCTCCAAAAACTATTTTCAACAAAATCTCTGCAACCTTAACTTCATCAACAATAAACCACTCACCTGGCAGAAGAAGTCCACGTGGCAACATCAATCAAGAAGAAATCCGATGCTACAGCGTCTGCGTTGCCCGCCTTGCCATCATGGCTATGCTGGCGATTCTTATTGGTCTATTAACACTTCTCACATGGCATTTCACAAAAGTTTACACAAGAACATCATTAAACGCTTTAGCATACGGCCTTCGATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1044 aa · TkA06G117970|TK1151|PROTEIN

MASAPKTIFNKISATLTSSTINHSPGRRSPRGNINQEEIRCYSVCVARLAIMAMLAILIGLLTLLTWHFTKVYTRTSLNALAYGLRFELLQRPMLRMWKILNSTVEITTSQVKLSEYVIRKYSKAENQAQQVELYAVMRDLTWALFASHKALDSMSIKYRNGFVQAFHRDLRDKNTYYIYSNLYNYTMAEPLDTNQSLPHQGWNDQTIHGNISAIWYREPLDPDTGIKTGKQMEIPPDELLNIAGISQVPDGAASWHVSV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G117970
TK1151 IDTkA06G117970
OH-1004 IDLXL04_024673
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G117970
位置Chr06:30877314-30882040 (-)
描述Similar to AHK1: Histidine kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g17820 用作渗透传感器组氨酸激酶，检测水分胁迫并将胁迫信号传输至下游 MAPK 级联。
Functional analysis of AHK1/ATHK1 and cytokinin receptor histidine kinases in response to abscisic acid, drought, and salt stress in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706547105
At2g47430 必需蛋白质。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YA15 与细菌双组分调控器相关的细胞分裂素受体。 暂无已核实直接文献
Os06g0183200 与细菌双组分调控器相关的细胞分裂素受体。 暂无已核实直接文献
Os02g0738400 与细菌双组分调控器相关的细胞分裂素受体。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024673 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010375 stomatal complex patterning 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0000155 phosphorelay sensor kinase activity 分子功能
GO:0004673 protein histidine kinase activity 分子功能
GO:0005034 osmosensor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17820
osa:107275680
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.314
排名 1 · TkA06G117970 · TK1151
细胞膜0.256
排名 2 · TkA06G117970 · TK1151
高尔基体0.189
排名 3 · TkA06G117970 · TK1151
细胞质0.148
排名 4 · TkA06G117970 · TK1151
溶酶体／液泡0.130
排名 5 · TkA06G117970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02743dCache_1252-326 aa
PF02518HATPase_c299-318 aa
PF00512HisKA473-538 aa
PF02518HATPase_c585-734 aa
PF00072Response_reg919-1030 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G117970PF02743dCache_12523260.004718.0
TkA06G117970PF02518HATPase_c2993185.1e-2072.7
TkA06G117970PF00512HisKA4735381.2e-1764.4
TkA06G117970PF02518HATPase_c5857345.1e-2072.7
TkA06G117970PF00072Response_reg91910307.5e-2484.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SXL4拟南芥sp|Q9SXL4|AHK1_ARATH Histidine kinase 159.100%Swiss-Prot高置信
O22267拟南芥sp|O22267|CKI1_ARATH Histidine kinase CKI135.500%Swiss-Prot低置信
A2YA15水稻sp|A2YA15|OHK2_ORYSI Probable histidine kinase 227.500%Swiss-Prot低置信
Q5SML4水稻sp|Q5SML4|OHK2_ORYSJ Probable histidine kinase 227.500%Swiss-Prot低置信
A1A699水稻sp|A1A699|OHK6_ORYSJ Probable histidine kinase 630.400%Swiss-Prot中等置信

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