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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G112080
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 29396065-29400959 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

637 bp · TkA06G112080|TK1151|cDNA

TTATGCACCATTTTAAACATGTACAGCATATAGCTGCATCATTAGGGAGCACGAAGATGACCCGCATATTGATCGAAGAAAAAGGGGCAAACATTAATGCTCGTGATGATGATGGAAATACGCCTTTATATCTAGCTTTGACTGAAAAACACGATGAAGTGATTGAGTTGCTTATTGGAAAAGGCGCCACATTAATGATAGAGGATGAAGAGGACATCGGTGAATTTATGTGTGTAGCAGCAGCAACTGATAATGTTGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1998 bp · TkA06G112080|TK1151|CDS

ATGAGTTTACCATTGGCTAACAACCGGAGAGATCGCTTCGTCTCACCTAACTTGGGCAGGATTACGTATGGAACTTCTATCCCTCATTCAGCTGTCATTGCTCGCACTGCTGCCTCTCTCGCTGTATGGTATCAGCAGTGGTGGGAACCTGTTTGTGCCGTGGTGGCATTACTATCTACGTTGATAACAGCACTACAGTTTTCGTTTTTCGAGGTGTCACCTAAAACGCTGACATACTTGGAAGGAGTTGAGGGTTTTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

665 aa · TkA06G112080|TK1151|PROTEIN

MSLPLANNRRDRFVSPNLGRITYGTSIPHSAVIARTAASLAVWYQQWWEPVCAVVALLSTLITALQFSFFEVSPKTLTYLEGVEGFILLHTCLHSILVYINLPREKRRRYILCYILPRCFMSLPWVFFYYITGRKIFRWILLLRMLRLEKVHRLFSVTEDSRVGFISTRYLKTLVVKLIAFHLGACIFFFSAITIPVGQEGKTWLGSLTLGEISYSNFRHVGFLRLYIICLYFSAITITTIGYGDIHPVTSFDMIIAIVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G112080
TK1151 IDTkA06G112080
OH-1004 IDLXL04_024755
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.106
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G112080
位置Chr06:29396065-29400959 (-)
描述Similar to GORK: Potassium channel GORK
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g37500 保卫细胞膜上的主要选择性向外整流钾通道。
The Arabidopsis outward K+ channel GORK is involved in regulation of stomatal movements and plant transpiration.2003 · DOI: 10.1073/pnas.0733970100
At3g02850 高选择性外向整流钾通道。
Identification and disruption of a plant shaker-like outward channel involved in K+ release into the xylem sap.1998 · DOI: 10.1016/s0092-8674(00)81606-2
At4g22200 高选择性弱内向整流钾通道。
Loss of the AKT2/3 potassium channel affects sugar loading into the phloem of Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1007/s00425-002-0895-1
Regulated expression of Arabidopsis shaker K+ channel genes involved in K+ uptake and distribution in the plant.2003 · DOI: 10.1023/a:1022597102282

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0250600 可能的向外整流钾通道。 暂无已核实直接文献
Os04g0445000 可能的向外整流钾通道。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024755 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:1902458 positive regulation of stomatal opening 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G02850
ath:AT5G37500
dosa:Os04g0445000
dosa:Os06g0250600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.419
排名 1 · TkA06G112080 · TK1151
内质网0.233
排名 2 · TkA06G112080 · TK1151
细胞质0.188
排名 3 · TkA06G112080 · TK1151
溶酶体／液泡0.161
排名 4 · TkA06G112080 · TK1151
高尔基体0.135
排名 5 · TkA06G112080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520Ion_trans46-259 aa
PF07885Ion_trans_2188-194 aa
PF07885Ion_trans_2227-261 aa
PF23745ANK_LRRK2259-277 aa
PF00027cNMP_binding355-442 aa
PF23745ANK_LRRK2465-495 aa
PF12796Ank_2493-569 aa
PF13857Ank_5497-547 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G112080PF00520Ion_trans462599.1e-1038.8
TkA06G112080PF07885Ion_trans_21881945.8e-0936.4
TkA06G112080PF07885Ion_trans_22272615.8e-0936.4
TkA06G112080PF23745ANK_LRRK22592770.009816.5
TkA06G112080PF00027cNMP_binding3554421.1e-1248.5
TkA06G112080PF23745ANK_LRRK24654950.009816.5
TkA06G112080PF12796Ank_24935695.1e-2588.6
TkA06G112080PF13857Ank_54975471.5e-1764.2
TkA06G112080PF13637Ank_44985265.3e-2071.8
TkA06G112080PF00023Ank5055381.8e-2485.1
TkA06G112080PF13606Ank_35055358.7e-1863.1
TkA06G112080PF24521Ank_KRIT15065620.01915.4
TkA06G112080PF13637Ank_45105605.3e-2071.8
TkA06G112080PF23745ANK_LRRK25116030.009816.5
TkA06G112080PF00023Ank5395701.8e-2485.1
TkA06G112080PF13606Ank_35395668.7e-1863.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94A76拟南芥sp|Q94A76|GORK_ARATH Potassium channel GORK32.000%Swiss-Prot中等置信
Q9M8S6拟南芥sp|Q9M8S6|SKOR_ARATH Potassium channel SKOR31.400%Swiss-Prot中等置信
Q38898拟南芥sp|Q38898|AKT2_ARATH Potassium channel AKT2/325.600%Swiss-Prot低置信
Q653P0水稻sp|Q653P0|KOR1_ORYSJ Potassium channel KOR130.500%Swiss-Prot中等置信
Q7XUW4水稻sp|Q7XUW4|KOR2_ORYSJ Potassium channel KOR229.800%Swiss-Prot低置信

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