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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G088290
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 23570867-23576537 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2395 bp · TkA06G088290|TK1151|cDNA

AAAAAAGTTTGTTCAAAGGTCTTTATTCTAACATAAACTTACAAAAGTGATGGCATTGCTATCCTTTTGTCATGCACATTGGAGAAACAATCTTAAAACCTTATTAAATTCTCATCCCATAAGACCTACAAAATATATATTTAAAGGAGTCTCAGGAACACAGGTAACATATAGTAAGCATCTAACCTTTTCCTGTTGGGACTTTTTGAAATGATTATCGTCTTCTTTTTGGCCTCTCTTCTTCTCTCTTGTCTACCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1872 bp · TkA06G088290|TK1151|CDS

ATGATTATCGTCTTCTTTTTGGCCTCTCTTCTTCTCTCTTGTCTACCTTTCCTTCATTCTACTACAGACTTCAACACTTCTATGTCTACCTGCCCAAACGGTTTCAGTTGCCCAAAACTTTCCCCTTTTGAGTACCCGTTTTATAATACCACCGACAGCCGGTGTGGTTTGATCAAGGTCAACTGTAGTTCGACTGGTAGCAAAATTAAATTTGGAGAAGAGTCATTTGAGATTGTTTCCAAGTTCGTGCCTGGTCCTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

623 aa · TkA06G088290|TK1151|PROTEIN

MIIVFFLASLLLSCLPFLHSTTDFNTSMSTCPNGFSCPKLSPFEYPFYNTTDSRCGLIKVNCSSTGSKIKFGEESFEIVSKFVPGPSVVIRNKTFEKLVNETDCDALRDNFTSPSPLLYSIRILPFITLYKCKTNGNDAATMEAYFEQPDYNRYTRCRDHNFYYQYIVSESTIPSDLPSTCEVIRLPVKAQWSNGATQRLNETNIFSLLNSEFSVTFNLSPSCRDCRMREGECHAQDGRFQCLNARKYVAAEKQRFGRTR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G088290
TK1151 IDTkA06G088290
OH-1004 IDLXL04_024998
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.666 / OH-1004 46.677
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G088290
位置Chr06:23570867-23576537 (+)
描述Similar to LRK10L-1.1: LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 1.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g38280 在体外具备激酶活性。
The PR5K receptor protein kinase from Arabidopsis thaliana is structurally related to a family of plant defense proteins.1996 · DOI: 10.1073/pnas.93.6.2598
At1g66910 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 2.5。 暂无已核实直接文献
At1g67000 叶锈病10号抗病位点受体样蛋白激酶样2.8。 暂无已核实直接文献
At1g66920 叶锈病10抗病位点受体样蛋白激酶样 2.4。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024998 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042631 cellular response to water deprivation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030247 polysaccharide binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18390
ath:AT1G25390
ath:AT5G38210
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.866
排名 1 · TkA06G088290 · TK1151
细胞质0.083
排名 2 · TkA06G088290 · TK1151
内质网0.080
排名 3 · TkA06G088290 · TK1151
细胞核0.056
排名 4 · TkA06G088290 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA06G088290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13947GUB_WAK_bind31-67 aa
PF14380WAK_assoc167-244 aa
PF14531Kinase-like288-324 aa
PF03109ABC1319-352 aa
PF00069Pkinase325-593 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr325-592 aa
PF03109ABC1435-471 aa
PF10140YukC441-470 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G088290PF13947GUB_WAK_bind31670.2412.5
TkA06G088290PF14380WAK_assoc1672448.1e-0627.2
TkA06G088290PF14531Kinase-like2883240.2511.3
TkA06G088290PF03109ABC13193520.001418.6
TkA06G088290PF00069Pkinase3255939.4e-45153.8
TkA06G088290PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3255924.1e-42145.0
TkA06G088290PF03109ABC14354710.001418.6
TkA06G088290PF10140YukC4414700.1411.8
TkA06G088290PF14531Kinase-like4415210.2511.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FF29拟南芥sp|Q9FF29|PR5K_ARATH PR5-like receptor kinase56.600%Swiss-Prot中等置信
F4HQ20拟南芥sp|F4HQ20|LRL25_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.536.300%Swiss-Prot中等置信
Q3ECH2拟南芥sp|Q3ECH2|LRL28_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.838.100%Swiss-Prot中等置信
F4HQ22拟南芥sp|F4HQ22|LRL24_ARATH LEAF RUST 10 DISEASE-RESISTANCE LOCUS RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE-like 2.456.900%Swiss-Prot低置信

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