TkA06G086710 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G086710

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 23179526-23179837 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

312 bp · TkA06G086710|TK1151|cDNA

ATGAAAGCACTGGGATCCGACATCTCTGCCGAAGAGGTGAAGGAAGTGATGACGAAAATTGACACAGACTGCGACGGCTTCATTAACCTTGAGGAGTTCGCCGGATTCTGTAAAGAAAACGCCGGTAACCAAGACGAAGGGTTGAACGAGCTCCATGAAGCGTTCGAGCTCTACGATTTGAACAAGAACGGGTTGATCTCGTCAACGGAGCTGCATCAGATCTTGACTCGGCTGGGTGAGAGATGTACAGTTGAAGATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

312 bp · TkA06G086710|TK1151|CDS

ATGAAAGCACTGGGATCCGACATCTCTGCCGAAGAGGTGAAGGAAGTGATGACGAAAATTGACACAGACTGCGACGGCTTCATTAACCTTGAGGAGTTCGCCGGATTCTGTAAAGAAAACGCCGGTAACCAAGACGAAGGGTTGAACGAGCTCCATGAAGCGTTCGAGCTCTACGATTTGAACAAGAACGGGTTGATCTCGTCAACGGAGCTGCATCAGATCTTGACTCGGCTGGGTGAGAGATGTACAGTTGAAGATTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

103 aa · TkA06G086710|TK1151|PROTEIN

MKALGSDISAEEVKEVMTKIDTDCDGFINLEEFAGFCKENAGNQDEGLNELHEAFELYDLNKNGLISSTELHQILTRLGERCTVEDCVKMISRWTPTAMVRRF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G086710`
TK1151 ID	TkA06G086710
OH-1004 ID	LXL04_025028
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	75.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.350 / OH-1004 58.710 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G086710

位置 Chr06:23179526-23179837 (-)

描述 Similar to Calcium-binding allergen Ole e 8

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g18210`	潜在的钙感受器。	暂无已核实直接文献
`At1g24620`	潜在的钙感受器。	暂无已核实直接文献
`At3g03400`	潜在的钙感受器。	暂无已核实直接文献
`At1g73630`	潜在的钙感受器。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025028 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009612 response to mechanical stimulus 生物过程

GO:0009646 response to absence of light 生物过程

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0009909 regulation of flower development 生物过程

GO:0010038 response to metal ion 生物过程

GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程

GO:0051592 response to calcium ion 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G18210

ath:AT1G66400

ath:AT1G73630

ath:AT5G37770

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.614

排名 1 · TkA06G086710 · TK1151

细胞核0.279

排名 2 · TkA06G086710 · TK1151

线粒体0.093

排名 3 · TkA06G086710 · TK1151

内质网0.092

排名 4 · TkA06G086710 · TK1151

细胞膜0.080

排名 5 · TkA06G086710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13833EF-hand_82-38 aa

PF03484B52-24 aa

PF13499EF-hand_74-37 aa

PF21008AIF-14-33 aa

PF13405EF-hand_68-19 aa

PF13202EF-hand_58-17 aa

PF25578EF-hand_STIM18-72 aa

PF23564EF-hand_FSTL110-41 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G086710	`PF13833`	EF-hand_8	2	38	8.9e-09	35.7
TkA06G086710	`PF03484`	B5	2	24	0.076	13.9
TkA06G086710	`PF13499`	EF-hand_7	4	37	1.3e-14	55.0
TkA06G086710	`PF21008`	AIF-1	4	33	0.012	16.5
TkA06G086710	`PF13405`	EF-hand_6	8	19	5.2e-14	51.3
TkA06G086710	`PF13202`	EF-hand_5	8	17	2.7e-10	39.9
TkA06G086710	`PF25578`	EF-hand_STIM1	8	72	0.0021	18.8
TkA06G086710	`PF23564`	EF-hand_FSTL1	10	41	0.00059	20.9
TkA06G086710	`PF30624`	EF_SSP120	10	33	0.0033	18.8
TkA06G086710	`PF10208`	ARMET_C	11	35	0.17	12.1
TkA06G086710	`PF00036`	EF-hand_1	12	38	4.5e-16	57.8
TkA06G086710	`PF13405`	EF-hand_6	13	38	5.2e-14	51.3
TkA06G086710	`PF10591`	SPARC_Ca_bdg	14	34	0.057	14.4
TkA06G086710	`PF13202`	EF-hand_5	15	34	2.7e-10	39.9
TkA06G086710	`PF29176`	Allatotropin-like_C	20	33	0.0025	18.1
TkA06G086710	`PF30551`	CFAP251_C	27	92	0.029	14.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LE22`	拟南芥	sp\|Q9LE22\|CML27_ARATH Probable calcium-binding protein CML27	47.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FYK2`	拟南芥	sp\|Q9FYK2\|CML25_ARATH Probable calcium-binding protein CML25	40.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SRP4`	拟南芥	sp\|Q9SRP4\|CML33_ARATH Probable calcium-binding protein CML33	42.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9C9U8`	拟南芥	sp\|Q9C9U8\|CML26_ARATH Probable calcium-binding protein CML26	69.000%	Swiss-Prot	低置信

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