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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G084780
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 22637431-22638564 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

495 bp · TkA06G084780|TK1151|cDNA

TATAACTTACTTTCCAAGCTAGCAAAAGAAGAAAGTCTAGGCAAAAGTCCAACAAAAATAAGGCCCTTGAACCCATGCATAGCGAGAGAAGTAATTGATGAAGAAGGATGGCTTCATACTGGAGACATAGGGTTGTGGGCACCTGGAGGCCGATTAAAGATTATTGATATGAAAAAAAATATTTTTAAGTTGGCACAAGGAGAGTACATTGCTCCTGAGAAAATTGAGAATGTATATGTTAAGAGCAAATACGTGGCGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

495 bp · TkA06G084780|TK1151|CDS

TATAACTTACTTTCCAAGCTAGCAAAAGAAGAAAGTCTAGGCAAAAGTCCAACAAAAATAAGGCCCTTGAACCCATGCATAGCGAGAGAAGTAATTGATGAAGAAGGATGGCTTCATACTGGAGACATAGGGTTGTGGGCACCTGGAGGCCGATTAAAGATTATTGATATGAAAAAAAATATTTTTAAGTTGGCACAAGGAGAGTACATTGCTCCTGAGAAAATTGAGAATGTATATGTTAAGAGCAAATACGTGGCGCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

164 aa · TkA06G084780|TK1151|PROTEIN

YNLLSKLAKEESLGKSPTKIRPLNPCIAREVIDEEGWLHTGDIGLWAPGGRLKIIDMKKNIFKLAQGEYIAPEKIENVYVKSKYVAQCFVYGDSFNSSLVVVVSVDPDMLKAFAAKEGIKNNCAMTQGQGLQFLLTWMPLEKSSGNLLFFFLFLINPHLLILSN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G084780
TK1151 IDTkA06G084780
OH-1004 IDLXL04_023084
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.293 / OH-1004 85.185
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G084780
位置Chr06:22637431-22638564 (+)
描述Similar to LACS6: Long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05970 活化长链脂肪酸，用于细胞脂质的合成以及通过β-氧化进行降解（可能）。
Two long-chain acyl-CoA synthetases from Arabidopsis thaliana involved in peroxisomal fatty acid beta-oxidation.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01405.x
Molecular characterization of an Arabidopsis acyl-coenzyme a synthetase localized on glyoxysomal membranes.2002 · DOI: 10.1104/pp.012955
Peroxisomal Acyl-CoA synthetase activity is essential for seedling development in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019646
Analysis of the role of COMATOSE and peroxisomal beta-oxidation in the determination of germination potential in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl045
At5g27600 活化长链脂肪酸，用于细胞脂质的合成以及通过β-氧化进行降解（可能）。
Two long-chain acyl-CoA synthetases from Arabidopsis thaliana involved in peroxisomal fatty acid beta-oxidation.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01405.x
Peroxisomal Acyl-CoA synthetase activity is essential for seedling development in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019646
Analysis of the role of COMATOSE and peroxisomal beta-oxidation in the determination of germination potential in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl045

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023084 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001676 long-chain fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程
GO:0007584 response to nutrient 生物过程
GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0010747 positive regulation of long-chain fatty acid import across plasma membrane 生物过程
GO:0010867 positive regulation of triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0015908 fatty acid transport 生物过程
GO:0032000 positive regulation of fatty acid beta-oxidation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G05970
ath:AT5G27600
hsa:51703
mmu:433256
rno:94340
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.301
排名 1 · TkA06G084780 · TK1151
内质网0.250
排名 2 · TkA06G084780 · TK1151
细胞质0.202
排名 3 · TkA06G084780 · TK1151
线粒体0.147
排名 4 · TkA06G084780 · TK1151
细胞核0.087
排名 5 · TkA06G084780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23562AMP-binding_C_363-104 aa
PF13193AMP-binding_C74-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G084780PF23562AMP-binding_C_3631040.1812.9
TkA06G084780PF13193AMP-binding_C741090.0002422.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LPS1拟南芥sp|Q8LPS1|LACS6_ARATH Long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal84.800%Swiss-Prot中等置信
Q8LKS5拟南芥sp|Q8LKS5|LACS7_ARATH Long chain acyl-CoA synthetase 7, peroxisomal77.200%Swiss-Prot中等置信

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