TkA06G083830 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G083830

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 22405185-22409034 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1987 bp · TkA06G083830|TK1151|cDNA

GTCGGGGTTTCCAACTACAAACAGGCGAGTGCGTATAAATAACAGAGCGGCGGAGAACTACGAGATCCGGCGGTGGTGGAAATGCGTAATCGCGATTTCGTGGATGGCGTTCGTCAACTCTCCCAAATTCAACGCCCTTTGCGTATATTAAACAAGAACCAGTCCGTAGTCAACGTATCCGTACTTTTCATGATTGGTGGTTCTTCTTCTGTTCTTCTCTCTGTAGCTAATGTTTTCTGCAAAAGAAGACTCGTGTTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

837 bp · TkA06G083830|TK1151|CDS

ATGCTTGGCAAGGAATTTTTCACCGAGTACGGTGAAGCAAGTCTGTATGAGATTCAAGAAGTTGTTGGAAAAGGAAGTTACGGCGTTGTTGCAGCTGCAGTCGACACGCACACCGGTGAAAAAGTAGCCATTAAAAAAATCAACGATGTTTTCGAGCATGTTTCCGATGCGACCCGTATTCTTAGAGAAATCAAACTTCTCCGACTTCTTAAACACCCAGATATCGTAGAAATTAAGCATATCATGCTTCCTCCTTGCAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

278 aa · TkA06G083830|TK1151|PROTEIN

MLGKEFFTEYGEASLYEIQEVVGKGSYGVVAAAVDTHTGEKVAIKKINDVFEHVSDATRILREIKLLRLLKHPDIVEIKHIMLPPCRREFKDIYVVFELMESDLDEVIKVNDDLTPEHHQFFLYQLLRALKYIHTAHVFHRDLKPKNILANADCKLKICDFGLARASFDDTPSAIFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEMLTGKPLFPGRNVVHQLDLVTDLLGSPSPEIISRIRNDKARRYLNG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G083830`
TK1151 ID	TkA06G083830
OH-1004 ID	LXL04_014939
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	84.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 98.201 / OH-1004 56.639 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G083830

位置 Chr06:22405185-22409034 (+)

描述 Similar to MPK9: Mitogen-activated protein kinase 9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g18040`	丝裂原活化蛋白激酶9。	暂无已核实直接文献
`At1g18150`	MKK3-MPK8 和 CAMs-MPK8 模块通过控制受伤期间 RBOHD 基因的表达来负向调节 ROS 积累。	Calmodulin-dependent activation of MAP kinase for ROS homeostasis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1016/j.molcel.2011.02.029

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0643800`	丝裂原活化蛋白激酶16。	暂无已核实直接文献
`Os05g0143500`	线粒体活化蛋白激酶14。	暂无已核实直接文献
`Os11g0271100`	丝裂原活化蛋白激酶 15。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014939 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G18150

ath:AT1G73670

ath:AT3G18040

dosa:Os05g0576800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.606

排名 1 · TkA06G083830 · TK1151

细胞核0.558

排名 2 · TkA06G083830 · TK1151

细胞膜0.050

排名 3 · TkA06G083830 · TK1151

线粒体0.045

排名 4 · TkA06G083830 · TK1151

内质网0.030

排名 5 · TkA06G083830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase16-229 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr17-228 aa

PF03109ABC121-47 aa

PF06293Kdo49-159 aa

PF01163RIO188-162 aa

PF12330Haspin_kinase93-179 aa

PF14531Kinase-like102-210 aa

PF03109ABC1130-166 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G083830	`PF00069`	Pkinase	16	229	3.8e-59	200.9
TkA06G083830	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	17	228	4.5e-31	108.8
TkA06G083830	`PF03109`	ABC1	21	47	0.00061	19.7
TkA06G083830	`PF06293`	Kdo	49	159	4.4e-06	27.0
TkA06G083830	`PF01163`	RIO1	88	162	0.024	15.0
TkA06G083830	`PF12330`	Haspin_kinase	93	179	0.00012	22.0
TkA06G083830	`PF14531`	Kinase-like	102	210	0.0072	16.3
TkA06G083830	`PF03109`	ABC1	130	166	0.00061	19.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LV37`	拟南芥	sp\|Q9LV37\|MPK9_ARATH Mitogen-activated protein kinase 9	84.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LM33`	拟南芥	sp\|Q9LM33\|MPK8_ARATH Mitogen-activated protein kinase 8	84.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q5VP69`	水稻	sp\|Q5VP69\|MPK16_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 16	85.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q75KK8`	水稻	sp\|Q75KK8\|MPK14_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 14	84.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q53N72`	水稻	sp\|Q53N72\|MPK15_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 15	84.100%	Swiss-Prot	高置信

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