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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G068580
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 18342621-18343703 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1083 bp · TkA06G068580|TK1151|cDNA

ATGGACTCCCTTACCCTCGTCTGCACCGTCTCCCTTCTCGCCGGCGGCCTTTACTGGTTCGTCTGCATCCTTGGGTCCGCCGAACAGAAAGGCAAGCACGCCGTTCAGCTCTCTGGAGGCTCAATCGAACGTGATAATGTTCAAGACAATTACAACGAGTACTGGTCTTTCTTCCGCCGCCCCAAAGAGATCGAGAAGGCTGAAAATGTCCCGGCTTTCGTCGACACCTTTTATAACCTCGTCACGGATATCTACGAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1083 bp · TkA06G068580|TK1151|CDS

ATGGACTCCCTTACCCTCGTCTGCACCGTCTCCCTTCTCGCCGGCGGCCTTTACTGGTTCGTCTGCATCCTTGGGTCCGCCGAACAGAAAGGCAAGCACGCCGTTCAGCTCTCTGGAGGCTCAATCGAACGTGATAATGTTCAAGACAATTACAACGAGTACTGGTCTTTCTTCCGCCGCCCCAAAGAGATCGAGAAGGCTGAAAATGTCCCGGCTTTCGTCGACACCTTTTATAACCTCGTCACGGATATCTACGAATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

360 aa · TkA06G068580|TK1151|PROTEIN

MDSLTLVCTVSLLAGGLYWFVCILGSAEQKGKHAVQLSGGSIERDNVQDNYNEYWSFFRRPKEIEKAENVPAFVDTFYNLVTDIYEWGWGQSFHFSPAIPGKSNLESTRIHEEMAVDLIGVKPGQKILDAGCGVGGPMRAIAAHSGCNVVGITINEYQVSRAKAHNKKAGLDKLCDVVCGNFLEMPFEDNSFDGAYSIEATCHAPNLEDVYGEIFRVLKPGSMYVSYEWVTTELYRGEDPEHVEVIQGIERGDALPGLRS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G068580
TK1151 IDTkA06G068580
OH-1004 IDLXL04_025310
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G068580
位置Chr06:18342621-18343703 (-)
描述Similar to SMT2: 24-methylenesterol C-methyltransferase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g20330 将S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移至24-亚甲基洛芬醇（24-methylene lophenol）的亚甲基，生成24-亚乙基洛芬醇（24-ethylidene lophenol）。 暂无已核实直接文献
At1g76090 将S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移至24-亚甲基洛芬醇（24-methylene lophenol）的亚甲基，生成24-亚乙基洛芬醇（24-ethylidene lophenol）。 暂无已核实直接文献
At5g13710 催化从 S-腺苷甲硫氨酸到环木菠萝烯醇 C-24 的甲基转移，形成 24-亚甲基环木菠萝烯醇。
Sterol methyltransferase 1 controls the level of cholesterol in plants.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.6.853

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0136200 将S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移至24-亚甲基洛芬醇（24-methylene lophenol）的亚甲基，生成24-亚乙基洛芬醇（24-ethylidene lophenol）。 暂无已核实直接文献
Os07g0206700 催化S-腺苷基甲硫氨酸向环化花生醇的C-24位置甲基转移，形成24-亚甲基环化花生醇。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025310 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0007389 pattern specification process 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0016126 sterol biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0032876 negative regulation of DNA endoreduplication 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G20330
ath:AT1G76090
ath:AT5G13710
ddi:DDB_G0288907
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.679
排名 1 · TkA06G068580 · TK1151
线粒体0.164
排名 2 · TkA06G068580 · TK1151
细胞质0.112
排名 3 · TkA06G068580 · TK1151
细胞膜0.079
排名 4 · TkA06G068580 · TK1151
细胞核0.076
排名 5 · TkA06G068580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02353CMAS74-281 aa
PF03848TehB105-174 aa
PF01209Ubie_methyltran108-230 aa
PF01135PCMT112-175 aa
PF08123DOT1116-194 aa
PF01728FtsJ120-165 aa
PF07021MetW121-165 aa
PF13847Methyltransf_31122-233 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G068580PF02353CMAS742814.1e-1453.3
TkA06G068580PF03848TehB1051740.1312.4
TkA06G068580PF01209Ubie_methyltran1082303.3e-1143.7
TkA06G068580PF01135PCMT1121750.01915.5
TkA06G068580PF08123DOT11161940.01116.0
TkA06G068580PF01728FtsJ1201650.001818.9
TkA06G068580PF07021MetW1211650.04714.0
TkA06G068580PF13847Methyltransf_311222333.3e-1763.3
TkA06G068580PF13489Methyltransf_231222772.6e-0937.7
TkA06G068580PF13679Methyltransf_321221760.05714.1
TkA06G068580PF05175MTS1221930.2711.5
TkA06G068580PF08003Methyltransf_91242030.02114.5
TkA06G068580PF09445Methyltransf_151251840.03214.5
TkA06G068580PF13649Methyltransf_251272214e-1969.8
TkA06G068580PF08241Methyltransf_111282246e-2382.0
TkA06G068580PF08242Methyltransf_121282231.2e-1042.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39227拟南芥sp|Q39227|SMT2_ARATH 24-methylenesterol C-methyltransferase 281.100%Swiss-Prot高置信
Q94JS4拟南芥sp|Q94JS4|SMT3B_ARATH 24-methylenesterol C-methyltransferase 379.100%Swiss-Prot高置信
Q9LM02拟南芥sp|Q9LM02|SMT1_ARATH Cycloartenol-C-24-methyltransferase40.700%Swiss-Prot中等置信
O82427水稻sp|O82427|SMT2_ORYSJ 24-methylenesterol C-methyltransferase 269.900%Swiss-Prot高置信
Q6ZIX2水稻sp|Q6ZIX2|SMT1_ORYSJ Cycloartenol-C-24-methyltransferase 141.300%Swiss-Prot中等置信

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