TkA06G059030 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G059030

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 15943855-15945268 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

975 bp · TkA06G059030|TK1151|cDNA

ATGGATGTTTCCGGTCAACTTAAGCAAGTAACATGGTTGGAAACGGAAACTACCAAAGGGTGGAATACACTTTGGTCTCAGCCTAGAATGCAGTGTGAGAGTGATTTCTCCGGTGGGTGTGTGAGAAAAACCGATTTGGAGTGTGGGAGAAACAGGTGCTTGGTTTGGGATGGAGATCTCTGGGATCTTTGGGAAGTGGATGATGGTGAGCAAACCATCCTTGTGAAAGTTGCGTCTAGAGATCTTCCACGTCATAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

975 bp · TkA06G059030|TK1151|CDS

ATGGATGTTTCCGGTCAACTTAAGCAAGTAACATGGTTGGAAACGGAAACTACCAAAGGGTGGAATACACTTTGGTCTCAGCCTAGAATGCAGTGTGAGAGTGATTTCTCCGGTGGGTGTGTGAGAAAAACCGATTTGGAGTGTGGGAGAAACAGGTGCTTGGTTTGGGATGGAGATCTCTGGGATCTTTGGGAAGTGGATGATGGTGAGCAAACCATCCTTGTGAAAGTTGCGTCTAGAGATCTTCCACGTCATAAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

324 aa · TkA06G059030|TK1151|PROTEIN

MDVSGQLKQVTWLETETTKGWNTLWSQPRMQCESDFSGGCVRKTDLECGRNRCLVWDGDLWDLWEVDDGEQTILVKVASRDLPRHKKNNWAIIGCGVAGVENKDIHCKDNNGGIVGGGVLCDTSIVAVKNLESISQGEKQFRSEVSTIGTIQHVNLVRLRGFCAQVLNWETRYQIALGTARGLVYLHDKCRECIIHCDIKPENILLDVDFSPKIADFGLAKLIGRDFSRTLTTTRGSIGYLAPEWLSGVAITAKADVYSY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G059030`
TK1151 ID	TkA06G059030
OH-1004 ID	LXL04_025439
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	71.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 40.353 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G059030

位置 Chr06:15943855-15945268 (-)

描述 Similar to At2g19130: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g19130`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。	暂无已核实直接文献
`At4g00340`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。	暂无已核实直接文献
`At4g32300`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。	暂无已核实直接文献
`At1g34300`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。	暂无已核实直接文献
`At5g24080`	G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025439 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006955 immune response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0048544 recognition of pollen 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G65800

ath:AT2G19130

ath:AT4G00340

ath:AT4G21380

ath:AT5G24080

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.376

排名 1 · TkA06G059030 · TK1151

细胞质0.366

排名 2 · TkA06G059030 · TK1151

细胞核0.284

排名 3 · TkA06G059030 · TK1151

内质网0.075

排名 4 · TkA06G059030 · TK1151

高尔基体0.048

排名 5 · TkA06G059030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00954S_locus_glycop1-34 aa

PF00069Pkinase123-165 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr123-165 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr167-277 aa

PF00069Pkinase173-273 aa

PF03109ABC1185-232 aa

PF05445Pox_ser-thr_kin187-206 aa

PF01636APH189-221 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G059030	`PF00954`	S_locus_glycop	1	34	0.015	16.5
TkA06G059030	`PF00069`	Pkinase	123	165	1.8e-28	100.4
TkA06G059030	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	123	165	4.1e-23	82.7
TkA06G059030	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	167	277	4.1e-23	82.7
TkA06G059030	`PF00069`	Pkinase	173	273	1.8e-28	100.4
TkA06G059030	`PF03109`	ABC1	185	232	0.026	14.4
TkA06G059030	`PF05445`	Pox_ser-thr_kin	187	206	0.37	10.4
TkA06G059030	`PF01636`	APH	189	221	0.05	14.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O64477`	拟南芥	sp\|O64477\|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g19130	61.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q39203`	拟南芥	sp\|Q39203\|SD22_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2	49.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8RWZ5`	拟南芥	sp\|Q8RWZ5\|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5	46.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9XID3`	拟南芥	sp\|Q9XID3\|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300	46.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FLV4`	拟南芥	sp\|Q9FLV4\|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080	40.200%	Swiss-Prot	中等置信

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