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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G058550
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 15821509-15824890 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

858 bp · TkA06G058550|TK1151|cDNA

ATGTTAAATGGGGAAGCTAGCGATGAAGAAGTCACAAAAGTTTGCAAAATTGCATGTCGGTGTATCCAATATGAGGAAGAGAGTAGACCCTCAATGAGTCAGGTGGAACAAATGCTTGAAGGGGTTTTGGATGTGAACAGGCCTCCCATACCCAATATGAGGAAGAGAGTAGATCCTGTTGTTTTCTCCACGGAGTCACCATCCAACGAGAGCTCACAGATAAAGGAGTCTCTTGACAATTTGAGGCAAATTTATTACCG...

CDS

下载 CDS FASTA

858 bp · TkA06G058550|TK1151|CDS

ATGTTAAATGGGGAAGCTAGCGATGAAGAAGTCACAAAAGTTTGCAAAATTGCATGTCGGTGTATCCAATATGAGGAAGAGAGTAGACCCTCAATGAGTCAGGTGGAACAAATGCTTGAAGGGGTTTTGGATGTGAACAGGCCTCCCATACCCAATATGAGGAAGAGAGTAGATCCTGTTGTTTTCTCCACGGAGTCACCATCCAACGAGAGCTCACAGATAAAGGAGTCTCTTGACAATTTGAGGCAAATTTATTACCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

285 aa · TkA06G058550|TK1151|PROTEIN

MLNGEASDEEVTKVCKIACRCIQYEEESRPSMSQVEQMLEGVLDVNRPPIPNMRKRVDPVVFSTESPSNESSQIKESLDNLRQIYYRNIPYHDHTSSSSWSNTTTATLSPNTSETTTHESKLESSRPLQGGFGWLSGNSLVVEKNSNDPYVDFRESMLQMIMENEIYGKDELRELLNCFLQLNSPYYHGVIVGAFTSEGFNCSTISSQLYNVNLSLNSLTGYVPVSLSQSNSLMFLSLQFNNFSGVLPDSWGGGKNDDKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G058550
TK1151 IDTkA06G058550
OH-1004 IDLXL04_025449
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 39.365
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G058550
位置Chr06:15821509-15824890 (-)
描述Similar to SD22: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g52525 转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。 暂无已核实直接文献
At4g18830 转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。
A central role of Arabidopsis thaliana ovate family proteins in networking and subcellular localization of 3-aa loop extension homeodomain proteins.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0501181102
Cell-fate switch of synergid to egg cell in Arabidopsis eostre mutant embryo sacs arises from misexpression of the BEL1-like homeodomain gene BLH1.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.054890
Arabidopsis ovate family proteins, a novel transcriptional repressor family, control multiple aspects of plant growth and development.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0023896
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献
At5g19650 转录阻遏蛋白，通过调节 BEL1-LIKE (BLH) 和 KNOX TALE (KNAT) 同源域转录因子来调节植物生长和发育的多个方面。
Arabidopsis ovate family proteins, a novel transcriptional repressor family, control multiple aspects of plant growth and development.2011 · DOI: 10.1371/journal.pone.0023896

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0864000 可能的转录抑制因子，部分通过油菜素甾醇（BR）信号通路调控植物生长发育的多个方面。
OVATE Family Protein 8 Positively Mediates Brassinosteroid Signaling through Interacting with the GSK3-like Kinase in Rice.2016 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1006118
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025449 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G19130
ath:AT4G00340
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.358
排名 1 · TkA06G058550 · TK1151
细胞核0.306
排名 2 · TkA06G058550 · TK1151
细胞质0.236
排名 3 · TkA06G058550 · TK1151
内质网0.144
排名 4 · TkA06G058550 · TK1151
溶酶体／液泡0.076
排名 5 · TkA06G058550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04844Ovate32-47 aa
PF00560LRR_1135-141 aa
PF04844Ovate146-196 aa
PF00560LRR_1209-228 aa
PF13855LRR_8211-243 aa
PF00560LRR_1232-252 aa
PF00560LRR_1263-277 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G058550PF04844Ovate32471.6e-2280.0
TkA06G058550PF00560LRR_11351410.00716.9
TkA06G058550PF04844Ovate1461961.6e-2280.0
TkA06G058550PF00560LRR_12092280.00716.9
TkA06G058550PF13855LRR_82112430.009316.4
TkA06G058550PF00560LRR_12322520.00716.9
TkA06G058550PF00560LRR_12632770.00716.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3EAL1拟南芥sp|Q3EAL1|OFP6_ARATH Transcription repressor OFP669.400%Swiss-Prot低置信
Q8VZN1拟南芥sp|Q8VZN1|OFP5_ARATH Transcription repressor OFP545.600%Swiss-Prot低置信
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913056.900%Swiss-Prot低置信
Q3E9B4拟南芥sp|Q3E9B4|OFP8_ARATH Transcription repressor OFP854.400%Swiss-Prot低置信
Q94CV1水稻sp|Q94CV1|OFP8_ORYSJ Transcription repressor OFP847.800%Swiss-Prot低置信

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