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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G058050
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 15649788-15653263 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2537 bp · TkA06G058050|TK1151|cDNA

ATTGTGGTTCCTTTTGTAAGATATTTTTTCCCGATCGAACAGTAATTTTATTAAAATCCTAAAAATTGCTTTTTTCGTATCACACTCCATGTATGGCCATTCAGTGAATATCGGTGTTTGCTTTTTTCGTATCACACTCCATGTATCTAAACATATCAAAGAAAATTTTCTTTTCCTTTTTGATGGAAATAGTTGTCATCAACTATGGTTACCCGGAAAGCTCCCGTTCATCTTTTCTACATTTAAATTGTTTTTAAGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1365 bp · TkA06G058050|TK1151|CDS

ATGAGTGGAGCAATCATATTTATCCAGGAAGATCTAAAAATCACCGAATTTCAAGAAGAAATTCTCGTGGGAATCTTGAGTGTCATCTCCCTATTGGGCAGTCTAGGCGGCGGCCGTGCCTCCGATGCACTTGGCCGGAAATGGACAATGGGTATAGCTGCAGTTATATTTCAAATCGGTGCACTTATAATGACATTAGCTCCTACTTTCCAAGTTCTGATGATCGGCCGCCTCCTCGCCGGAATTGGAATCGGATTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

454 aa · TkA06G058050|TK1151|PROTEIN

MSGAIIFIQEDLKITEFQEEILVGILSVISLLGSLGGGRASDALGRKWTMGIAAVIFQIGALIMTLAPTFQVLMIGRLLAGIGIGFGVMIAPVYIAEISPTISRGSFTSFPEIFINIGILLGYVSNYAFSGLPSHINWRIMLAVGILPSVFIAFALCIIPESPRWLVMQNRVDEARSVLMKTNEIESEVEERLSEILKAAGIGTGSGVNPEEKAVWRELLSPSPSLRRMLITGFGIQCFQQITGIDATVYYSPEILQTAG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G058050
TK1151 IDTkA06G058050
OH-1004 IDLXL04_025465
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 85.178
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G058050
位置Chr06:15649788-15653263 (+)
描述Similar to PLT4: Probable polyol transporter 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g20780 质膜糖／质子同向转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g18830 质膜广谱糖质子同向转运蛋白。
Analysis of transport activity of Arabidopsis sugar alcohol permease homolog AtPLT5.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m410831200
Arabidopsis POLYOL TRANSPORTER5, a new member of the monosaccharide transporter-like superfamily, mediates H+-Symport of numerous substrates, including myo-inositol, glycerol, and ribose.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.026641
At2g16120 质膜糖／质子同向转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g16130 质膜糖／质子同向转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g18480 质膜糖／质子同向转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025465 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0005351 carbohydrate:proton symporter activity 分子功能
GO:0005354 galactose transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0005365 myo-inositol transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015145 monosaccharide transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015148 D-xylose transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015168 glycerol transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015575 mannitol transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16120
ath:AT2G16130
ath:AT2G18480
ath:AT2G20780
ath:AT3G18830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.347
排名 1 · TkA06G058050 · TK1151
细胞膜0.291
排名 2 · TkA06G058050 · TK1151
细胞质0.179
排名 3 · TkA06G058050 · TK1151
内质网0.116
排名 4 · TkA06G058050 · TK1151
高尔基体0.113
排名 5 · TkA06G058050 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690MFS_14-377 aa
PF00083Sugar_tr19-429 aa
PF10981DUF278853-88 aa
PF26083TM_Tm6sf2265-317 aa
PF07690MFS_1343-425 aa
PF26083TM_Tm6sf2363-407 aa
PF10981DUF2788394-414 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G058050PF07690MFS_143773.6e-32112.4
TkA06G058050PF00083Sugar_tr194292.4e-105353.8
TkA06G058050PF10981DUF278853880.0514.4
TkA06G058050PF26083TM_Tm6sf22653170.511.1
TkA06G058050PF07690MFS_13434253.6e-32112.4
TkA06G058050PF26083TM_Tm6sf23634070.511.1
TkA06G058050PF10981DUF27883944140.0514.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WUU6拟南芥sp|Q0WUU6|PLT4_ARATH Probable polyol transporter 472.300%Swiss-Prot高置信
Q8VZ80拟南芥sp|Q8VZ80|PLT5_ARATH Polyol transporter 549.500%Swiss-Prot中等置信
Q9XIH7拟南芥sp|Q9XIH7|PLT1_ARATH Putative polyol transporter 149.700%Swiss-Prot中等置信
Q9XIH6拟南芥sp|Q9XIH6|PLT2_ARATH Putative polyol transporter 249.400%Swiss-Prot中等置信
Q9ZNS0拟南芥sp|Q9ZNS0|PLT3_ARATH Probable polyol transporter 346.700%Swiss-Prot中等置信

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