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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G054510
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 14744926-14748499 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2053 bp · TkA06G054510|TK1151|cDNA

GCTCCATTGCCATATATACTCCCTACACAAACATACGCAATCACACACCTAGGGTTTGCAGCGACTCGATCCACGACAGGGAAACAACGAAGAACAATGAGAGGAGCTTACTATACGTTTTACCAGAGAGCTTCCCATGCATTTCGTGATCATCCTAATCTCTCTAAACTTGTCGTGGTCTGCACCATCAGTGGTGGTGGACTAGCAGCCTATTCTGATGTGAGGCCATTTGGAACCGCTTATGCTGATGCAGCCCAACC...

CDS

下载 CDS FASTA

1839 bp · TkA06G054510|TK1151|CDS

GCTCCATTGCCATATATACTCCCTACACAAACATACGCAATCACACACCTAGGGTTTGCAGCGACTCGATCCACGACAGGGAAACAACGAAGAACAATGAGAGGAGCTTACTATACGTTTTACCAGAGAGCTTCCCATGCATTTCGTGATCATCCTAATCTCTCTAAACTTGTCGTGGTCTGCACCATCAGTGGTGGTGGACTAGCAGCCTATTCTGATGTGAGGCCATTTGGAACCGCTTATGCTGATGCAGCCCAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

612 aa · TkA06G054510|TK1151|PROTEIN

APLPYILPTQTYAITHLGFAATRSTTGKQRRTMRGAYYTFYQRASHAFRDHPNLSKLVVVCTISGGGLAAYSDVRPFGTAYADAAQPTIKKKKVVVLGTGWAGTSFLKNLKDPSFDVEVVSPCNYFAFTPLLPSVTVGTVEARSVVEPIRNIVKKNNLDFSFKEAECFKIDTANKKVHCKSNNILGAKEEFTVDYDELVIAMGARANTFNTPGVVENAHFLKEVEDALRIRRSIIDCFERASLPSVSEDERKRILHFVVV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G054510
TK1151 IDTkA06G054510
OH-1004 IDLXL04_034616
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)70.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 93.137 / OH-1004 52.773
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G054510
位置Chr06:14744926-14748499 (-)
描述Similar to NDB2: External alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B2, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g05020 替代型 NADH-泛醌氧化还原酶，可催化线粒体 NADH 的氧化，但不在内线粒体膜上转运质子（通过相似性推测）。
Ca2+-binding and Ca2+-independent respiratory NADH and NADPH dehydrogenases of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m704674200
At4g21490 替代性NADH-泛醌氧化还原酶，催化线粒体NADH的氧化，但不将质子跨内线粒体膜转运。 暂无已核实直接文献
At2g20800 替代型 NADH-泛醌氧化还原酶，可催化线粒体 NADH 的氧化，但不在内线粒体膜上转运质子（通过相似性推测）。
Ca2+-binding and Ca2+-independent respiratory NADH and NADPH dehydrogenases of Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1074/jbc.m704674200
Alterations in the mitochondrial alternative NAD(P)H Dehydrogenase NDB4 lead to changes in mitochondrial electron transport chain composition, plant growth and response to oxidative stress.2011 · DOI: 10.1093/pcp/pcr073

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034616 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0005758 mitochondrial intermembrane space 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0031314 extrinsic component of mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0003954 NADH dehydrogenase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0009916 alternative oxidase activity 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0120555 NADH dehydrogenase (ubiquinone) (non-electrogenic) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G20800
ath:AT4G05020
ath:AT4G21490
sot:102591773
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.925
排名 1 · TkA06G054510 · TK1151
细胞质0.089
排名 2 · TkA06G054510 · TK1151
细胞核0.062
排名 3 · TkA06G054510 · TK1151
细胞膜0.049
排名 4 · TkA06G054510 · TK1151
内质网0.029
排名 5 · TkA06G054510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13241NAD_binding_789-124 aa
PF07991KARI_N89-119 aa
PF13738Pyr_redox_390-183 aa
PF07992Pyr_redox_292-410 aa
PF00070Pyr_redox93-121 aa
PF13454NAD_binding_995-113 aa
PF13450NAD_binding_896-120 aa
PF13454NAD_binding_9188-203 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G054510PF13241NAD_binding_7891240.03515.4
TkA06G054510PF07991KARI_N891190.1412.5
TkA06G054510PF13738Pyr_redox_3901830.09812.6
TkA06G054510PF07992Pyr_redox_2924103.5e-56191.5
TkA06G054510PF00070Pyr_redox931214.1e-1247.1
TkA06G054510PF13454NAD_binding_9951130.09113.5
TkA06G054510PF13450NAD_binding_8961200.001519.4
TkA06G054510PF13454NAD_binding_91882030.09113.5
TkA06G054510PF00036EF-hand_11922020.0001122.2
TkA06G054510PF00070Pyr_redox2563374.1e-1247.1
TkA06G054510PF13241NAD_binding_72562680.03515.4
TkA06G054510PF13454NAD_binding_92583160.09113.5
TkA06G054510PF13738Pyr_redox_32582790.09812.6
TkA06G054510PF13450NAD_binding_82593290.001519.4
TkA06G054510PF13450NAD_binding_83503760.001519.4
TkA06G054510PF05517p25-alpha4044480.1712.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94BV7拟南芥sp|Q94BV7|NDB2_ARATH External alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B2, mitochondrial68.700%Swiss-Prot高置信
F4JJJ3拟南芥sp|F4JJJ3|NDB3_ARATH External alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B3, mitochondrial67.800%Swiss-Prot高置信
Q9SKT7拟南芥sp|Q9SKT7|NDB4_ARATH External alternative NAD(P)H-ubiquinone oxidoreductase B4, mitochondrial66.500%Swiss-Prot高置信

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