TkA06G049660 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G049660

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 13514358-13516654 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1798 bp · TkA06G049660|TK1151|cDNA

GGAAAAAAGAGGGAAAAAAAAGAAAAAACGATTAAAATATCTCTAACTCCCTCACGGCTCAACTACAAAATATCTTTACCCCCAGCGTCTCCTCTGCCCCCACCTCCACTCCCATCTGATCGGAGCTCAGCAGCTCACCATGCATTCCATGATCGTTTCACCATCCACCTTAACGCCATCAAGTTCATCGATCATACCACTAACACCTCTCAAATCAAAAGCATTCATCACCGCATCTCCAAATTTTTGGAGAAAGTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1452 bp · TkA06G049660|TK1151|CDS

ATGCATTCCATGATCGTTTCACCATCCACCTTAACGCCATCAAGTTCATCGATCATACCACTAACACCTCTCAAATCAAAAGCATTCATCACCGCATCTCCAAATTTTTGGAGAAAGTCTCGTTCTGATTCTGCCTCGCTGCAATGTAAAGCTTCAGCATCTTCATCTTCTTCTATCACTGATTTCGATCTGTATGATCTGCTCGGTGTCGATAGTTCCTCCGACCAGTCTGCCATCAAACAGGCGTACAGGTCACTTCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

483 aa · TkA06G049660|TK1151|PROTEIN

MHSMIVSPSTLTPSSSSIIPLTPLKSKAFITASPNFWRKSRSDSASLQCKASASSSSSITDFDLYDLLGVDSSSDQSAIKQAYRSLQKKCHPDIAGLAGHDMAIILNEAYAVLSDPLSRFSYDKEQAKVADFKGYTGKPIYSVWYGSESEQRAIFVDEVKCIGCLKCALLAEKTFAVESVYGRARVIAQWADSENKIQEAIEACPVDCISMVERSKLAALEFLMSKQPRGSVRIGAGNTAGTRVSNIFVDVDKFQDQYLA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G049660`
TK1151 ID	TkA06G049660
OH-1004 ID	LXL04_025600
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 90.683 / OH-1004 98.206 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G049660

位置 Chr06:13514358-13516654 (-)

描述 Similar to DJC76: Chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g23240`	可能与HSC70分子伴侣一起作用，在盐胁迫期间帮助蛋白折叠并防止叶绿体内蛋白聚集（可能）。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025600 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006260 DNA replication 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0042026 protein refolding 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009295 nucleoid 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0003681 bent DNA binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0008270 zinc ion binding 分子功能

GO:0031072 heat shock protein binding 分子功能

GO:0051082 unfolded protein binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G23240

cyn:Cyan7425_4692

dth:DICTH_1724

pen:PSEEN4896

tte:TTE0956

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.973

排名 1 · TkA06G049660 · TK1151

细胞核0.034

排名 2 · TkA06G049660 · TK1151

线粒体0.025

排名 3 · TkA06G049660 · TK1151

细胞质0.020

排名 4 · TkA06G049660 · TK1151

过氧化物酶体0.014

排名 5 · TkA06G049660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00226DnaJ63-123 aa

PF30912TIM141_C67-114 aa

PF12838Fer4_7147-168 aa

PF13459Fer4_15154-211 aa

PF14697Fer4_21155-211 aa

PF00037Fer4155-168 aa

PF12837Fer4_6155-168 aa

PF13370Fer4_13156-210 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G049660	`PF00226`	DnaJ	63	123	8.6e-14	52.1
TkA06G049660	`PF30912`	TIM141_C	67	114	0.0077	16.9
TkA06G049660	`PF12838`	Fer4_7	147	168	0.06	14.5
TkA06G049660	`PF13459`	Fer4_15	154	211	4.1e-07	31.3
TkA06G049660	`PF14697`	Fer4_21	155	211	0.00055	20.7
TkA06G049660	`PF00037`	Fer4	155	168	0.12	12.9
TkA06G049660	`PF12837`	Fer4_6	155	168	3.3	8.5
TkA06G049660	`PF13370`	Fer4_13	156	210	3.4e-14	54.0
TkA06G049660	`PF00037`	Fer4	201	210	0.12	12.9
TkA06G049660	`PF12838`	Fer4_7	202	216	0.06	14.5
TkA06G049660	`PF12837`	Fer4_6	202	209	3.3	8.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FMX6`	拟南芥	sp\|Q9FMX6\|DJC76_ARATH Chaperone protein dnaJ C76, chloroplastic	55.700%	Swiss-Prot	高置信

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