TkA06G041430 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G041430

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 11208599-11213352 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3522 bp · TkA06G041430|TK1151|cDNA

CTGCATGAGCTGGTATCACACCCTCCTTATATTCTTCTCCAAAGCAAGAAGAAAAAGGCGAACCTGAGATTCTGTTCATAAAGAAAAGCAAGATTTGAAAAATCAGGAAAAACAGACAGAATGTGAATCAACGCTGCACACAAACTCATCAATCAATCAAAAAAAGCTGAGTTCAAGTGGAGTCCAGACTCCGAGAGATGTCGATCCAAGAACTAATTCACTGAAATGCAGCCATTTCCTCACAATCTTCAACCCTTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2805 bp · TkA06G041430|TK1151|CDS

ATGGGTTTAGTTCTTCAATTTGTCTTACTCTTCCTCACCTGCTTAATCCCTTCCCTTCTCTGTCAAGTTACAGAATTTGTGAGTATCGATTGTGGAGGAACAAGTAATCACACCGACGTTGATACTGGTCTAGTATGGGTTTCGGATTCTGGAATCGTTCACCATGGAACATCAATTGAGCTCGAAAACCCCAACGGGAACTCAGTTCAGTATCAAAGGCGCAGAGATTTCCCCATAGACAACAAAAAGTATTGTTATAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

934 aa · TkA06G041430|TK1151|PROTEIN

MGLVLQFVLLFLTCLIPSLLCQVTEFVSIDCGGTSNHTDVDTGLVWVSDSGIVHHGTSIELENPNGNSVQYQRRRDFPIDNKKYCYTLNTTERRRYIVRTTFLYGSSENENTYPKFQLYLDATRWATVSVLDASTVYIKEMIIRAPSSSIDVCVCCATTGSPFLSTLELRPLNLSMYATDFEDNFFLKVAARVNFGASSTDAVRFPDDPYDRIWDSDLAKRQNFLVGVAPGTVRINTTKEINTNTREYPPVKVMQTAVVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G041430`
TK1151 ID	TkA06G041430
OH-1004 ID	LXL04_025785
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	97.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G041430

位置 Chr06:11208599-11213352 (-)

描述 Similar to At1g67720: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67720

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g67720`	可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g67720。	暂无已核实直接文献
`At3g21340`	可能的受体，具有双特异性激酶活性，可作用于含丝氨酸/苏氨酸和酪氨酸的底物。	暂无已核实直接文献
`At1g51860`	可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g51860。	暂无已核实直接文献
`At1g51880`	可能的LRR样受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g51880。	暂无已核实直接文献
`At5g48740`	可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g48740。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025785 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G67720

ath:AT2G14510

ath:AT2G19230

ath:AT3G21340

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.863

排名 1 · TkA06G041430 · TK1151

内质网0.079

排名 2 · TkA06G041430 · TK1151

细胞质0.077

排名 3 · TkA06G041430 · TK1151

细胞核0.045

排名 4 · TkA06G041430 · TK1151

溶酶体／液泡0.031

排名 5 · TkA06G041430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12819Malectin_like29-362 aa

PF24141LRR_ComC255-311 aa

PF13855LRR_8414-451 aa

PF12799LRR_4415-451 aa

PF00560LRR_1416-436 aa

PF24141LRR_ComC424-502 aa

PF23598LRR_14428-491 aa

PF25019LRR_R13L1-DRL21435-493 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G041430	`PF12819`	Malectin_like	29	362	3.2e-83	280.5
TkA06G041430	`PF24141`	LRR_ComC	255	311	0.001	19.6
TkA06G041430	`PF13855`	LRR_8	414	451	7.8e-07	29.5
TkA06G041430	`PF12799`	LRR_4	415	451	1.8e-09	38.2
TkA06G041430	`PF00560`	LRR_1	416	436	3.7e-09	35.6
TkA06G041430	`PF24141`	LRR_ComC	424	502	0.001	19.6
TkA06G041430	`PF23598`	LRR_14	428	491	0.0016	18.0
TkA06G041430	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	435	493	0.031	14.9
TkA06G041430	`PF13855`	LRR_8	438	496	7.8e-07	29.5
TkA06G041430	`PF00560`	LRR_1	439	455	3.7e-09	35.6
TkA06G041430	`PF12799`	LRR_4	461	500	1.8e-09	38.2
TkA06G041430	`PF00560`	LRR_1	461	483	3.7e-09	35.6
TkA06G041430	`PF00560`	LRR_1	485	504	3.7e-09	35.6
TkA06G041430	`PF16492`	Cadherin_C_2	531	569	0.28	12.6
TkA06G041430	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	616	882	1.8e-52	178.9
TkA06G041430	`PF00069`	Pkinase	617	825	1.7e-46	159.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`C0LGI2`	拟南芥	sp\|C0LGI2\|Y1677_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g67720	68.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LIG2`	拟南芥	sp\|Q9LIG2\|RLK6_ARATH Receptor-like protein kinase At3g21340	32.600%	Swiss-Prot	中等置信
`C0LGG4`	拟南芥	sp\|C0LGG4\|Y1518_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51860	32.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FZB1`	拟南芥	sp\|Q9FZB1\|Y5188_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g51880	31.000%	Swiss-Prot	中等置信
`C0LGV0`	拟南芥	sp\|C0LGV0\|Y5487_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g48740	42.100%	Swiss-Prot	中等置信

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