TkA06G036990 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G036990

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 9913673-9920743 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1867 bp · TkA06G036990|TK1151|cDNA

AATACTTGGCTAAAAGTCCCAAAACAGCGCCACGTGTTTTGCTACAGGCGACGAGGACCACGATTTCGAACATTGAGACACAGACTTTTAGATTCACTCAACGCCTTCCTTTCAAGTCTCAACTACTCCCTCTTTGCTCCCCTAAAATTTCCAACTATTCTCACCCCAAAAGTCAAATCAGCTGAAGAACTCCACTCAATTTACACGGCTCTGGTCTCGGTGGCTAGCTTTACATCTATGGCGGCCTCGAAATTCCATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1587 bp · TkA06G036990|TK1151|CDS

AATACTTGGCTAAAAGTCCCAAAACAGCGCCACGTGTTTTGCTACAGGCGACGAGGACCACGATTTCGAACATTGAGACACAGACTTTTAGATTCACTCAACGCCTTCCTTTCAAGTCTCAACTACTCCCTCTTTGCTCCCCTAAAATTTCCAACTATTCTCACCCCAAAAGTCAAATCAGCTGAAGAACTCCACTCAATTTACACGGCTCTGGTCTCGGTGGCTAGCTTTACATCTATGGCGGCCTCGAAATTCCATAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

528 aa · TkA06G036990|TK1151|PROTEIN

NTWLKVPKQRHVFCYRRRGPRFRTLRHRLLDSLNAFLSSLNYSLFAPLKFPTILTPKVKSAEELHSIYTALVSVASFTSMAASKFHIFLVVSLFFALIFTLSEADSGVEEVVVESDNSEAFRIEVDKLTSKIQSLESSIEKRNQELKSKDDTIAEKEKAITEIEKTIKEKSDSITSLKNEVAKLEVKVSLDSNEKVKKAHTKAHELEKQVEKLQMEIEYKNNLREAMEARTKELEKKVHDLNPKLQDLQHIVDEQNTQLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G036990`
TK1151 ID	TkA06G036990
OH-1004 ID	LXL04_023420
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	85.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 28.409 / OH-1004 57.471 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G036990`
位置	Chr06:9913673-9920743 (-)
描述	Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_023420` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	暂无功能描述
KEGG 基因交叉引用	暂无功能描述

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.563

排名 1 · TkA06G036990 · TK1151

细胞质0.162

排名 2 · TkA06G036990 · TK1151

细胞核0.158

排名 3 · TkA06G036990 · TK1151

高尔基体0.118

排名 4 · TkA06G036990 · TK1151

细胞膜0.081

排名 5 · TkA06G036990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06785UPF024270-248 aa

PF28006HpsJ87-210 aa

PF07009NusG_II88-177 aa

PF09969DUF220398-184 aa

PF04513Baculo_PEP_C100-192 aa

PF25762HAUS1105-217 aa

PF30378CEP135_TSGA10_CC108-274 aa

PF30964At4g38062_N109-205 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G036990	`PF06785`	UPF0242	70	248	0.0046	17.8
TkA06G036990	`PF28006`	HpsJ	87	210	3.9	7.8
TkA06G036990	`PF07009`	NusG_II	88	177	0.1	13.5
TkA06G036990	`PF09969`	DUF2203	98	184	9.3	7.7
TkA06G036990	`PF04513`	Baculo_PEP_C	100	192	0.87	10.4
TkA06G036990	`PF25762`	HAUS1	105	217	4.8	7.6
TkA06G036990	`PF30378`	CEP135_TSGA10_CC	108	274	0.0091	15.1
TkA06G036990	`PF30964`	At4g38062_N	109	205	0.00024	20.7
TkA06G036990	`PF00038`	Filament	110	183	0.0072	16.7
TkA06G036990	`PF06818`	Fez1	111	229	0.11	13.6
TkA06G036990	`PF05531`	NPV_P10	111	141	0.37	12.0
TkA06G036990	`PF08702`	Fib_alpha	113	172	0.03	15.2
TkA06G036990	`PF27720`	SSNA1	113	163	3.9	8.4
TkA06G036990	`PF19220`	Rod_CreS	114	282	0.00032	20.7
TkA06G036990	`PF11932`	DUF3450	114	179	5.9	6.8
TkA06G036990	`PF00261`	Tropomyosin	115	168	7.1e-06	26.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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