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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G014920
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 3990841-3992718 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1321 bp · TkA06G014920|TK1151|cDNA

ATGGATCCTGAAATGGCAAAGAAGATTAAGGAAACGGTGCTGGACGTGTTGAAAAATTCAGACATGGAGTCTACGACCGAATTCCAGGTTCGGAAATTAGCATCCGAGAAGCTCGGAGAGGATTTATCGGTGCCTGAACGGAAGAAGCTCGTGCGGAGTGTCGTCCAGACGTACCTTGAGGAACAACAGGCAAAAGCTACAACAACCCTAACATCTATGGATGATAAAAGAAGAGTGACTCTCACTGAATTCAAAGGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

417 bp · TkA06G014920|TK1151|CDS

ATGGATCCTGAAATGGCAAAGAAGATTAAGGAAACGGTGCTGGACGTGTTGAAAAATTCAGACATGGAGTCTACGACCGAATTCCAGGTTCGGAAATTAGCATCCGAGAAGCTCGGAGAGGATTTATCGGTGCCTGAACGGAAGAAGCTCGTGCGGAGTGTCGTCCAGACGTACCTTGAGGAACAACAGGCAAAAGCTACAACAACCCTAACATCTATGGATGATAAAAGAAGAGTGACTCTCACTGAATTCAAAGGAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

138 aa · TkA06G014920|TK1151|PROTEIN

MDPEMAKKIKETVLDVLKNSDMESTTEFQVRKLASEKLGEDLSVPERKKLVRSVVQTYLEEQQAKATTTLTSMDDKRRVTLTEFKGKSLVSIREYYKKDGKELPSSKGISLTSEQWSTFSKNVPGIEQAIKKMEARFN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G014920
TK1151 IDTkA06G014920
OH-1004 IDLXL04_026313
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)73.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G014920
位置Chr06:3990841-3992718 (+)
描述Similar to KELP: RNA polymerase II transcriptional coactivator KELP
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g10920 一般共激活因子，与TAFs协同作用，介导上游激活因子与一般转录机器之间的功能性相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026313 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009561 megagametogenesis 生物过程
GO:0045899 positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly 生物过程
GO:0060261 positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005667 transcription regulator complex 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003690 double-stranded DNA binding 分子功能
GO:0003697 single-stranded DNA binding 分子功能
GO:0003713 transcription coactivator activity 分子功能
GO:0046982 protein heterodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G10920
ath:AT5G09250
mcf:101926874
pon:100173565
spo:2542309
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.653
排名 1 · TkA06G014920 · TK1151
细胞质0.440
排名 2 · TkA06G014920 · TK1151
线粒体0.067
排名 3 · TkA06G014920 · TK1151
细胞膜0.043
排名 4 · TkA06G014920 · TK1151
内质网0.039
排名 5 · TkA06G014920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08766DEK_C7-59 aa
PF19064DUF57607-80 aa
PF16235DUF48949-68 aa
PF24810RBD_LARS111-68 aa
PF18080Gal_mutarotas_314-97 aa
PF02229PC474-121 aa
PF24810RBD_LARS189-114 aa
PF16235DUF4894102-136 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G014920PF08766DEK_C7591.9e-1247.6
TkA06G014920PF19064DUF57607800.1113.4
TkA06G014920PF16235DUF48949680.02315.8
TkA06G014920PF24810RBD_LARS111680.1113.2
TkA06G014920PF18080Gal_mutarotas_314970.01615.9
TkA06G014920PF02229PC4741217.4e-2277.3
TkA06G014920PF24810RBD_LARS1891140.1113.2
TkA06G014920PF16235DUF48941021360.02315.8
TkA06G014920PF08766DEK_C1281371.9e-1247.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65155拟南芥sp|O65155|KELP_ARATH RNA polymerase II transcriptional coactivator KELP52.400%Swiss-Prot高置信

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