TkA06G013510 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G013510

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 3526096-3529964 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2015 bp · TkA06G013510|TK1151|cDNA

GAAAAGAAATAACCCTTTATAAGTTATTCAATTTTAAAGAGATATTGAAAATTTGATGTAGTCTGTTTAGTTATTGAAACAGTATGGACTTATAACAGGTTATCAAGAGTCAAGCCCACAACAACTCTGAGCCCTGCCTGAAAAGAGACAACCATACCCTTTTCCCGCCATTTCCTCTCTCATCTGTCACCAGTCACCGCCGATTATATATTTTCGGTTGAACTCCACCGGAGGGAAAAGCCAAGGTATCGATCTCGCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

924 bp · TkA06G013510|TK1151|CDS

ATGTATCGAGCACGAATTAATGTTCTCAAAATGGCATCATTTGATGACAATTCTCAATTCATGATTGCCATGTTGCGAGAATGTGGATTAGCACACAAGACAGTAATTTTCATATTGGACGAGTTTGACCTTTTTGCTCAGGGTAAACAAAGGTTACTATATAGCTTGTTAGATGCAATGCAGTCTGTAACTTCCCAAGCTGTTGTAATTGGTGTGAGTTGTCGATTGGATGCTGATCAGTTACTGGAAAAAAGAGTAAG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

307 aa · TkA06G013510|TK1151|PROTEIN

MYRARINVLKMASFDDNSQFMIAMLRECGLAHKTVIFILDEFDLFAQGKQRLLYSLLDAMQSVTSQAVVIGVSCRLDADQLLEKRVRSRFSHRKLLFHPPSKDDIQRLLKHILQLPTDSTLPHDYVTKFNSKISSILADKRFMEVVDKLSDSDSTFSNLIRFLFCAVNLIDLKSGFITLENFKSALSTLHRQTKLDCLNDCSNLEFYIMVCMRRLEAKEQESYNFNSLMSEYNKVHDTFRLQNFDYYSRSVCLRAFEHLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G013510`
TK1151 ID	TkA06G013510
OH-1004 ID	LXL04_026320
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.068 / OH-1004 71.981 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G013510

位置 Chr06:3526096-3529964 (-)

描述 Similar to ORC4: Origin of replication complex subunit 4

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g01120`	起始识别复合体（ORC）的组成部分，结合复制起点。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0683400`	起始识别复合体（ORC）的组成部分，结合复制起点。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026320 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006260 DNA replication 生物过程

GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程

GO:0009744 response to sucrose 生物过程

GO:0040038 polar body extrusion after meiotic divisions 生物过程

GO:0051258 protein polymerization 生物过程

GO:0000781 chromosome, telomeric region 细胞组分

GO:0000808 origin recognition complex 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005664 nuclear origin of replication recognition complex 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G01120

bta:529245

cge:100689043

dosa:Os01g0683400

hsa:5000

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.717

排名 1 · TkA06G013510 · TK1151

细胞质0.297

排名 2 · TkA06G013510 · TK1151

线粒体0.027

排名 3 · TkA06G013510 · TK1151

细胞膜0.019

排名 4 · TkA06G013510 · TK1151

高尔基体0.018

排名 5 · TkA06G013510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00004AAA14-93 aa

PF13401AAA_2216-71 aa

PF13191AAA_1619-64 aa

PF08578DUF176532-52 aa

PF13191AAA_1679-164 aa

PF13401AAA_2294-115 aa

PF14629ORC4_C108-293 aa

PF08578DUF1765129-170 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G013510	`PF00004`	AAA	14	93	0.00084	20.5
TkA06G013510	`PF13401`	AAA_22	16	71	0.15	13.1
TkA06G013510	`PF13191`	AAA_16	19	64	0.0011	20.3
TkA06G013510	`PF08578`	DUF1765	32	52	0.95	10.6
TkA06G013510	`PF13191`	AAA_16	79	164	0.0011	20.3
TkA06G013510	`PF13401`	AAA_22	94	115	0.15	13.1
TkA06G013510	`PF14629`	ORC4_C	108	293	3.2e-37	128.8
TkA06G013510	`PF08578`	DUF1765	129	170	0.95	10.6
TkA06G013510	`PF08578`	DUF1765	157	219	0.95	10.6
TkA06G013510	`PF13401`	AAA_22	194	215	0.15	13.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6EWX1`	拟南芥	sp\|Q6EWX1\|ORC4_ARATH Origin of replication complex subunit 4	60.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q5N8Q4`	水稻	sp\|Q5N8Q4\|ORC4_ORYSJ Origin of replication complex subunit 4	60.800%	Swiss-Prot	高置信

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