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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G009020
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 2310434-2313062 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1680 bp · TkA06G009020|TK1151|cDNA

TTCTGTGATAACATAGGGACTTTTGTGCTATTTACCCTCTATTAAAAGACTTGTATACGCACACACTGATACCTCCATGTTTACCCGTCGCCAAACTCTTCCATTTCCTATTTCCTTATTTCAAGCCATCACCCTTCCATGTTACTTAACATAGATACGATGGAGGTGCAATGTAGGAATACAGCGAACCAATTTGGGTTTTTTCTTCAGTCTCTTATCTCTGTTTTCCAAGATTGAACATAAAAATTAAAACTTGGATA...

792 bp · TkA06G009020|TK1151|CDS

ATGGACGATATATGTCAAGCTATCAGCTGTTCTTATGGGTTCTCAAGGATTAACCAAAGGCTCTTTGGCTTTCCTCAATTATCCTGCACAACTCATGTTCAAATCCACAAAGGTTCTACCTGTTATGATAATGGGTGCCTTCATTCCTGGTTAAAAAGGAAGTACCCACCACATGAATATCTTTCTGCCGTTCTTTTAGTTGTTGGTTTGATACTCTTCACTTTAGCCGATGCAAATTCTTCTCCTGATTTTAGCTTAAT...

263 aa · TkA06G009020|TK1151|PROTEIN

MDDICQAISCSYGFSRINQRLFGFPQLSCTTHVQIHKGSTCYDNGCLHSWLKRKYPPHEYLSAVLLVVGLILFTLADANSSPDFSLIGVVMVCGSLIMDSFLGNLQEAIFTINPNTSQMEMLFCSTVVGLPFLVPPMVLTGEVFKAWHSCYEHPYVYGVLVFEAVATFVGQVSVLTLVALFGAATTAMVTTARKAVTLLLSYMIFTKPLTDQHGSGLILIAMGVILKMLPNYKVQRLDTTVKQAKLHRKDHKSVNIEENR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G009020
TK1151 IDTkA06G009020
OH-1004 IDLXL04_026774
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)74.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 80.989 / OH-1004 61.891
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G009020
位置Chr06:2310434-2313062 (-)
描述Similar to UTR2: UDP-galactose/UDP-glucose transporter 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12600 糖转运蛋白,参与从细胞质向高尔基体和/或内质网转运核苷酸-糖。 暂无已核实直接文献
At4g23010 参与将 UDP-半乳糖从细胞质运输到高尔基体的糖转运蛋白。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_026774 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006478 peptidyl-tyrosine sulfation 生物过程
GO:0046963 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate transport 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0072334 UDP-galactose transmembrane transport 生物过程
GO:1902558 5'-adenylyl sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0005459 UDP-galactose transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12600
ath:AT4G23010
hsa:51000
mmu:108652
pon:100173180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

高尔基体0.593
排名 1 · TkA06G009020 · TK1151
内质网0.283
排名 2 · TkA06G009020 · TK1151
细胞质0.171
排名 3 · TkA06G009020 · TK1151
细胞膜0.074
排名 4 · TkA06G009020 · TK1151
溶酶体/液泡0.049
排名 5 · TkA06G009020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08449UAA49-229 aa
PF00892EamA50-74 aa
PF03151TPT51-226 aa
PF11239DUF304055-97 aa
PF04123DUF37359-201 aa
PF20059DUF645861-93 aa
PF00892EamA90-226 aa
PF11239DUF3040167-185 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G009020PF08449UAA492293.7e-48165.0
TkA06G009020PF00892EamA50742.9e-0628.3
TkA06G009020PF03151TPT512261.9e-0731.5
TkA06G009020PF11239DUF304055971.69.8
TkA06G009020PF04123DUF373592010.1711.9
TkA06G009020PF20059DUF645861938.57.4
TkA06G009020PF00892EamA902262.9e-0628.3
TkA06G009020PF11239DUF30401671851.69.8
TkA06G009020PF20059DUF64581721848.57.4
TkA06G009020PF04123DUF3732012320.1711.9
TkA06G009020PF20059DUF64582142378.57.4
TkA06G009020PF11239DUF30402162261.69.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDX3拟南芥sp|Q9LDX3|UTR4_ARATH UDP-galactose/UDP-glucose transporter 471.200%Swiss-Prot高置信
Q29Q28拟南芥sp|Q29Q28|UTR2_ARATH UDP-galactose/UDP-glucose transporter 278.900%Swiss-Prot中等置信

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