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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G008840
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 2256600-2262889 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3462 bp · TkA06G008840|TK1151|cDNA

ACGGGTATTGCTTTAAAAAAAACTATAAAATTTCCTGGTTCCAGGAATCTGCTTTTGAATATACGAGTCAAACAGAACTGTATTTATGTTAACAACTAAAATGATATAAACAATGTAACGTTGTGAAAGAAGCAACACAAAGTTAAGTGGCGGTCATCGTTTATAACTCAAACACCCTCTTCTTCAGGCAACTTCTCAAACATCAACTTATGAATCAAAACACCATATTTCACATCAAAGCATGACTTCACCTTGTATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

2838 bp · TkA06G008840|TK1151|CDS

ATGACTTCACCTTGTATCAAAGAAGTCTCTCGAGCCTGTTTCCGACGTTGCTGCCCGACTCCATTACTCCGGCTGCCCGATAAAGAGAGTCCCGAACAAACGATTTCACCTTCCAGGTACGATTTCATAGCTGCAACCGCCTCTTCGCTTCCTCCAAACGCCCAATTCACTAACCATGAGTCGTTGCCGGACCTTGAGCGATCGTTTTCCGCCATGAAAAAAGCTTACCCGTATTACCCGGAAACTGACCGAGCTGACCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

945 aa · TkA06G008840|TK1151|PROTEIN

MTSPCIKEVSRACFRRCCPTPLLRLPDKESPEQTISPSRYDFIAATASSLPPNAQFTNHESLPDLERSFSAMKKAYPYYPETDRADRIRSHEYYHLSNHVCLDYIGNGLFSYSQQLHSNAPFFNIIYKSVNLYTQITHGGQEQDFESLIKERIFRFMNISSDDYALVFTANQSSAFKVLADNYPFHTNRNLLTVYDHENEAVETMIESCKKRSGRVDSALFAWPNMRVHSKRLRKSVVDKNKKKKKRKGLFVFPLQSKVT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G008840
TK1151 IDTkA06G008840
OH-1004 IDLXL04_026493
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 65.608 / OH-1004 44.427
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G008840
位置Chr06:2256600-2262889 (-)
描述Similar to HTH: Protein HOTHEAD
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16540 对钼辅因子进行硫化。
The Arabidopsis LOS5/ABA3 locus encodes a molybdenum cofactor sulfurase and modulates cold stress- and osmotic stress-responsive gene expression.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010101
ABA3 is a molybdenum cofactor sulfurase required for activation of aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1074/jbc.c100472200
Tandem orientation of duplicated xanthine dehydrogenase genes from Arabidopsis thaliana: differential gene expression and enzyme activities.2004 · DOI: 10.1074/jbc.m312929200
Characterization of the NifS-like domain of ABA3 from Arabidopsis thaliana provides insight into the mechanism of molybdenum cofactor sulfuration.2005 · DOI: 10.1074/jbc.m411195200
Binding of sulfurated molybdenum cofactor to the C-terminal domain of ABA3 from Arabidopsis thaliana provides insight into the mechanism of molybdenum cofactor sulfuration.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m708549200

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0670000 对钼辅因子进行硫化。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0010430 fatty acid omega-oxidation 生物过程
GO:0046202 cyanide biosynthetic process 生物过程
GO:0050898 nitrile metabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0033095 aleurone grain 细胞组分
GO:0016614 oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors 分子功能
GO:0046593 mandelonitrile lyase activity 分子功能
GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G72970
ath:AT1G73050
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.635
排名 1 · TkA06G008840 · TK1151
细胞质0.247
排名 2 · TkA06G008840 · TK1151
细胞膜0.068
排名 3 · TkA06G008840 · TK1151
内质网0.054
排名 4 · TkA06G008840 · TK1151
线粒体0.046
排名 5 · TkA06G008840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04367DUF502104-148 aa
PF03486HI0933_like346-447 aa
PF27346PcoE369-439 aa
PF08731AFT387-408 aa
PF01134GIDA519-560 aa
PF07992Pyr_redox_2765-804 aa
PF01266DAO766-796 aa
PF05834Lycopene_cycl766-795 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G008840PF04367DUF5021041480.2512.0
TkA06G008840PF03486HI0933_like3464470.2311.6
TkA06G008840PF27346PcoE3694390.06614.0
TkA06G008840PF08731AFT3874080.1313.3
TkA06G008840PF01134GIDA5195600.2711.0
TkA06G008840PF07992Pyr_redox_27658040.05213.7
TkA06G008840PF01266DAO7667960.0215.2
TkA06G008840PF05834Lycopene_cycl7667950.0812.7
TkA06G008840PF03486HI0933_like7668010.2311.6
TkA06G008840PF01134GIDA7668010.2711.0
TkA06G008840PF13450NAD_binding_87697970.001819.3
TkA06G008840PF08731AFT7998600.1313.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C5X8拟南芥sp|Q9C5X8|MOCOS_ARATH Molybdenum cofactor sulfurase25.100%Swiss-Prot低置信
Q655R6水稻sp|Q655R6|MOCOS_ORYSJ Molybdenum cofactor sulfurase25.100%Swiss-Prot低置信

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