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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G464210
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 116277323-116279635 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1920 bp · TkA05G464210|TK1151|cDNA

ATGTACAGAGCTATTCTCCGAGAAGAAAACGATTCAATTTGTGGCTTCTTCTGCATTCATGGTGCCTCCAGCTGTACAACTTACCTCTTTGCCGTTCTTCTAAACCCATATGATCCAATTGTCATTTGGTCAGCCAATCGAGACTATCCGGTAAGTTATGGTGCAATACTGAATTTCACTGCGGCCGGAGAATTGGTGTTACAGGATGTCAATGGAAGCGTAGTTTGGACTACAAACACCAGAAGGAAATCTGTTGCTAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1920 bp · TkA05G464210|TK1151|CDS

ATGTACAGAGCTATTCTCCGAGAAGAAAACGATTCAATTTGTGGCTTCTTCTGCATTCATGGTGCCTCCAGCTGTACAACTTACCTCTTTGCCGTTCTTCTAAACCCATATGATCCAATTGTCATTTGGTCAGCCAATCGAGACTATCCGGTAAGTTATGGTGCAATACTGAATTTCACTGCGGCCGGAGAATTGGTGTTACAGGATGTCAATGGAAGCGTAGTTTGGACTACAAACACCAGAAGGAAATCTGTTGCTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

639 aa · TkA05G464210|TK1151|PROTEIN

MYRAILREENDSICGFFCIHGASSCTTYLFAVLLNPYDPIVIWSANRDYPVSYGAILNFTAAGELVLQDVNGSVVWTTNTRRKSVASMKVDNGNLVLYDIHNSIVWQSFDHPTDCLVPGQKLIQGQKLIPSVSPTNRNSICSGNQQCSCPRSIDSFRAVNDSDPVMGCSQVTPLTCNATQNHTFIELKNVKYFTYNVDIEDVDPGSCRQACLNKCSCKAALFEYGPSQSHGNCYLPSELFTMTKVNNGKSNPSSNIPQSH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G464210
TK1151 IDTkA05G464210
OH-1004 IDLXL04_022384
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)81.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 91.470
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G464210
位置Chr05:116277323-116279635 (-)
描述Similar to SD25: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g32300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SD2-5。 暂无已核实直接文献
At2g19130 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19130。 暂无已核实直接文献
At1g34300 G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。 暂无已核实直接文献
At5g24080 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。 暂无已核实直接文献
At4g00340 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022384 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0031625 ubiquitin protein ligase binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34300
ath:AT2G19130
ath:AT4G00340
ath:AT4G32300
ath:AT5G35370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.860
排名 1 · TkA05G464210 · TK1151
内质网0.082
排名 2 · TkA05G464210 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA05G464210 · TK1151
细胞核0.043
排名 4 · TkA05G464210 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA05G464210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08276PAN_29-29 aa
PF05445Pox_ser-thr_kin17-102 aa
PF01453B_lectin41-123 aa
PF14295PAN_4140-147 aa
PF08276PAN_2176-220 aa
PF00024PAN_1184-238 aa
PF14295PAN_4196-235 aa
PF07502MANEC205-235 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G464210PF08276PAN_29295e-0524.0
TkA05G464210PF05445Pox_ser-thr_kin171020.01914.7
TkA05G464210PF01453B_lectin411231e-1868.4
TkA05G464210PF14295PAN_41401470.008116.9
TkA05G464210PF08276PAN_21762205e-0524.0
TkA05G464210PF00024PAN_11842380.00218.7
TkA05G464210PF14295PAN_41962350.008116.9
TkA05G464210PF07502MANEC2052350.0215.8
TkA05G464210PF19770DUF62562712980.03814.8
TkA05G464210PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3305967.7e-43147.4
TkA05G464210PF00069Pkinase3325942.8e-51175.2
TkA05G464210PF03109ABC13353637e-0626.1
TkA05G464210PF01636APH3764780.0713.6
TkA05G464210PF03109ABC13964887e-0626.1
TkA05G464210PF06734UL974134750.1312.2
TkA05G464210PF14531Kinase-like4215450.008816.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWZ5拟南芥sp|Q8RWZ5|SD25_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-542.300%Swiss-Prot中等置信
O64477拟南芥sp|O64477|Y2913_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1913039.600%Swiss-Prot中等置信
Q9XID3拟南芥sp|Q9XID3|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g3430038.800%Swiss-Prot中等置信
Q9FLV4拟南芥sp|Q9FLV4|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g2408039.100%Swiss-Prot中等置信
Q39203拟南芥sp|Q39203|SD22_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-242.000%Swiss-Prot中等置信

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