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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G451790
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 113057956-113064601 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1326 bp · TkA05G451790|TK1151|cDNA

TTGGACAACGGGAGAGCGTTCCCTCAACGGCTTTATAAAACTCAAACCTTCTCTTCTTACTCTTCATTTGAAACCCTCTTTGATTCAGACAATTTTGAGAGAGAGAAAATGGAGTCCACGAAGACAGCAATGGAGGCTTTCGAGAAGCTAGAGAAGGTTGGAGAAGGAACCTATGGCAAAGTGTACAGAGCGAGAGACAGAGCCACCGGCAAAATCGTCGCTCTTAAGAAAACCAGGCTTCACGAAGACGAAGAAGGCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1038 bp · TkA05G451790|TK1151|CDS

TTGGACAACGGGAGAGCGTTCCCTCAACGGCTTTATAAAACTCAAACCTTCTCTTCTTACTCTTCATTTGAAACCCTCTTTGATTCAGACAATTTTGAGAGAGAGAAAATGGAGTCCACGAAGACAGCAATGGAGGCTTTCGAGAAGCTAGAGAAGGTTGGAGAAGGAACCTATGGCAAAGTGTACAGAGCGAGAGACAGAGCCACCGGCAAAATCGTCGCTCTTAAGAAAACCAGGCTTCACGAAGACGAAGAAGGCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

345 aa · TkA05G451790|TK1151|PROTEIN

LDNGRAFPQRLYKTQTFSSYSSFETLFDSDNFEREKMESTKTAMEAFEKLEKVGEGTYGKVYRARDRATGKIVALKKTRLHEDEEGVPPTTLREISILRMLSRDPHVVKLMDVKQGINKSGNTVLYLVFEYMETDLKKFIRSYRQSGENIPPQVVKSLMYQLCKGVAFCHAHGVLHRDLKPHNLLMDKKSLMLKIADLGLARAFTLPIKKYTHEILTLWYRAPEVLLGATHYSTAVDIWSVGCIFAELVMKTAIFAGDSE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G451790
TK1151 IDTkA05G451790
OH-1004 IDLXL04_010696
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)52.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 86.087 / OH-1004 89.231
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G451790
位置Chr05:113057956-113064601 (+)
描述Similar to CDC2A: Cell division control protein 2 homolog A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g20930 细胞周期蛋白dependent kinase B2-2。 暂无已核实直接文献
At1g76540 细胞周期蛋白dependent kinase B2-1。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0512600 与 CYCB2-1 或 CYCB2-2 形成复合物，在烟草 BY2 细胞 G2/M（有丝分裂）阶段激活 CDK 激酶。 暂无已核实直接文献
Os01g0897000 细胞周期蛋白dependent kinase B1-1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010696 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000082 G1/S transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010389 regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051445 regulation of meiotic cell cycle 生物过程
GO:0000307 cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008353 RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.629
排名 1 · TkA05G451790 · TK1151
细胞质0.534
排名 2 · TkA05G451790 · TK1151
细胞膜0.051
排名 3 · TkA05G451790 · TK1151
线粒体0.041
排名 4 · TkA05G451790 · TK1151
内质网0.030
排名 5 · TkA05G451790 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase11-204 aa
PF25986Kazrin27-51 aa
PF03109ABC138-79 aa
PF18618HP026839-53 aa
PF00069Pkinase47-337 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr49-254 aa
PF01636APH53-132 aa
PF06293Kdo89-190 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G451790PF12330Haspin_kinase112040.0001122.1
TkA05G451790PF25986Kazrin27510.0414.2
TkA05G451790PF03109ABC138790.0001721.6
TkA05G451790PF18618HP026839530.05614.5
TkA05G451790PF00069Pkinase473372.1e-69234.6
TkA05G451790PF07714PK_Tyr_Ser-Thr492548.8e-30104.6
TkA05G451790PF01636APH531320.1412.6
TkA05G451790PF06293Kdo891900.00417.4
TkA05G451790PF18618HP02681011550.05614.5
TkA05G451790PF25986Kazrin1251460.0414.2
TkA05G451790PF03109ABC11472170.0001721.6
TkA05G451790PF01636APH1721880.1412.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LG64拟南芥sp|Q8LG64|CKB22_ARATH Cyclin-dependent kinase B2-285.900%Swiss-Prot高置信
Q8LF80拟南芥sp|Q8LF80|CKB21_ARATH Cyclin-dependent kinase B2-182.900%Swiss-Prot高置信
Q0J4I1水稻sp|Q0J4I1|CKB21_ORYSJ Cyclin-dependent kinase B2-177.300%Swiss-Prot高置信
Q8L4P8水稻sp|Q8L4P8|CKB11_ORYSJ Cyclin-dependent kinase B1-169.800%Swiss-Prot高置信

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