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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G450450
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 112639680-112640699 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

899 bp · TkA05G450450|TK1151|cDNA

GTATAAGTAACCTTCCGATTCTAATCCCCACTATATTGGACACACTCAAACCCACACAAACATTTCTTCAAACACCTTGTAAACACTTTGCGACTTTAGAGTTTAGATATGAATTCAGGTGACGATGCTTCAGTTACAAGTTCTTCGGTTTCTTCCTTCGGTAAATTCTTCAAGCAATTAGCATCCCCCACTAGGAAACCCCCGATTCCTGGCGGTTCCGATGACATCCATCAGGTGTTTAATTACTTTGACGAGAACGG...

CDS

下载 CDS FASTA

528 bp · TkA05G450450|TK1151|CDS

ATGAATTCAGGTGACGATGCTTCAGTTACAAGTTCTTCGGTTTCTTCCTTCGGTAAATTCTTCAAGCAATTAGCATCCCCCACTAGGAAACCCCCGATTCCTGGCGGTTCCGATGACATCCATCAGGTGTTTAATTACTTTGACGAGAACGGAGACGGGAAGATATCTCCCGAGGAGCTGAAGAACAGGTTTAGGAAGGTAGGCGGGGAGGAGAGTCAGTTATCGGACGAGGAGGCGGAGATGGTAGTGCGGTTGTCGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

175 aa · TkA05G450450|TK1151|PROTEIN

MNSGDDASVTSSSVSSFGKFFKQLASPTRKPPIPGGSDDIHQVFNYFDENGDGKISPEELKNRFRKVGGEESQLSDEEAEMVVRLSDADGDGVLGLDDFTKMMKEGEDGELREAFVMYSGKSSREEGVITPKSLKKMLTRLGQSPTVNECTAMIGKFDVNGDGVLDFEEFRAMMN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G450450
TK1151 IDTkA05G450450
OH-1004 IDLXL04_022206
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G450450
位置Chr05:112639680-112640699 (+)
描述Similar to CML38: Calcium-binding protein CML38
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g76650 潜在的钙感受器，能够体外结合钙。
Developmental and stimulus-induced expression patterns of Arabidopsis calmodulin-like genes CML37, CML38 and CML39.2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9189-0
At1g76640 潜在的钙感受器，能够体外结合钙。
Developmental and stimulus-induced expression patterns of Arabidopsis calmodulin-like genes CML37, CML38 and CML39.2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9189-0
At3g50770 潜在的钙感受器。 暂无已核实直接文献
At5g42380 潜在的钙感受器，能够体外结合钙。
Developmental and stimulus-induced expression patterns of Arabidopsis calmodulin-like genes CML37, CML38 and CML39.2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9189-0

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0955400 潜在的钙感受器。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022206 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
GO:0033198 response to ATP 生物过程
GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G76640
ath:AT1G76650
ath:AT3G50770
ath:AT5G42380
dosa:Os01g0955100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.326
排名 1 · TkA05G450450 · TK1151
细胞核0.260
排名 2 · TkA05G450450 · TK1151
内质网0.138
排名 3 · TkA05G450450 · TK1151
细胞膜0.136
排名 4 · TkA05G450450 · TK1151
质体0.135
排名 5 · TkA05G450450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF30551CFAP251_C32-70 aa
PF13517FG-GAP_333-54 aa
PF10591SPARC_Ca_bdg37-62 aa
PF12174RST37-71 aa
PF13499EF-hand_738-104 aa
PF13833EF-hand_838-64 aa
PF12763EH38-60 aa
PF00036EF-hand_139-66 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G450450PF30551CFAP251_C32700.09513.1
TkA05G450450PF13517FG-GAP_333540.02316.0
TkA05G450450PF10591SPARC_Ca_bdg37620.1712.9
TkA05G450450PF12174RST37710.3211.6
TkA05G450450PF13499EF-hand_7381044.6e-2691.7
TkA05G450450PF13833EF-hand_838641.4e-2176.7
TkA05G450450PF12763EH38603.1e-0524.6
TkA05G450450PF00036EF-hand_139661.1e-2072.3
TkA05G450450PF13405EF-hand_639681.6e-1865.3
TkA05G450450PF23564EF-hand_FSTL1391051.7e-0629.1
TkA05G450450PF30624EF_SSP12040590.0814.3
TkA05G450450PF13202EF-hand_541622.2e-1762.4
TkA05G450450PF05042Caleosin41680.0215.5
TkA05G450450PF21008AIF-1421261.5e-0629.2
TkA05G450450PF14658EF-hand_9431044.6e-0524.5
TkA05G450450PF00404Dockerin_145560.01915.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SRE6拟南芥sp|Q9SRE6|CML38_ARATH Calcium-binding protein CML3848.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SRE7拟南芥sp|Q9SRE7|CML39_ARATH Calcium-binding protein CML3947.600%Swiss-Prot中等置信
Q8L3R2拟南芥sp|Q8L3R2|CML41_ARATH Probable calcium-binding protein CML4145.200%Swiss-Prot中等置信
Q9FIH9拟南芥sp|Q9FIH9|CML37_ARATH Calcium-binding protein CML3748.300%Swiss-Prot中等置信
Q8RYJ9水稻sp|Q8RYJ9|CML23_ORYSJ Putative calcium-binding protein CML2345.000%Swiss-Prot中等置信

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