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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G447890
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 111996422-111998760 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1289 bp · TkA05G447890|TK1151|cDNA

AAGAGAAATAAATAATAATATGGAACCTGCTTTGGGCCACCCGTCCATATAAAGCCGTAGGTAAAAGCATTTCTTCTACTACGTGCCATTGTCGACTCACTACCACCACCACCACCGCCACCACGAGGCAGCTTCTGCAGTCACTCAAGGAGTTATGACTACCATGGCTGCTGCTGATGTAACAGTTGCACCGATGACAATGGCGGATGAGCAGCAACAGCTCAAGAAAGGAATAGCCGAATTCTACGACGAGTCTTCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

927 bp · TkA05G447890|TK1151|CDS

ATGACTACCATGGCTGCTGCTGATGTAACAGTTGCACCGATGACAATGGCGGATGAGCAGCAACAGCTCAAGAAAGGAATAGCCGAATTCTACGACGAGTCTTCGGAGATGTGGGAGAATATATGGGGAGAACACATGCATCACGGATTCTACGACAACGACGCCGTCGTTGAACTCTCCGACCACCGCGCTGCTCAGATCCGAATGATCGAACAAAGCCTACTTTTCGCCTCTCTTCCTGATGATTCAGTGAAGAAACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

308 aa · TkA05G447890|TK1151|PROTEIN

MTTMAAADVTVAPMTMADEQQQLKKGIAEFYDESSEMWENIWGEHMHHGFYDNDAVVELSDHRAAQIRMIEQSLLFASLPDDSVKKPKTIVDVGCGIGGSSRYLAKKYGAECHGITLSPVQAERAQALAASQGLADKVSFQVADALNQPFPDGKFDLVWSMESGEHMPDKLKFVSELARVAAPGATIIIVTWCHRDLLPTEKSLRPEEEKILNKICSGFYLPAWCSTADYIKLLESLSLQDIKAADWSGNVAPFWPAVIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G447890
TK1151 IDTkA05G447890
OH-1004 IDLXL04_012833
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)81.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.779 / OH-1004 86.217
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G447890
位置Chr05:111996422-111998760 (-)
描述Similar to VTE4: Probable tocopherol O-methyltransferase, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g64970 参与生育酚的合成。
Characterization of an Arabidopsis mutant deficient in gamma-tocopherol methyltransferase.2003 · DOI: 10.1023/b:plan.0000004307.62398.91

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0701600 参与生育酚（维生素E）的合成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012833 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009820 alkaloid metabolic process 生物过程
GO:0009821 alkaloid biosynthetic process 生物过程
GO:0010189 vitamin E biosynthetic process 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:1900985 vindoline biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0009706 chloroplast inner membrane 细胞组分
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008170 N-methyltransferase activity 分子功能
GO:0008757 S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G64970
dosa:Os02g0701600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.372
排名 1 · TkA05G447890 · TK1151
细胞质0.353
排名 2 · TkA05G447890 · TK1151
过氧化物酶体0.171
排名 3 · TkA05G447890 · TK1151
细胞核0.134
排名 4 · TkA05G447890 · TK1151
细胞膜0.081
排名 5 · TkA05G447890 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02353CMAS4-29 aa
PF02353CMAS23-188 aa
PF00891Methyltransf_233-154 aa
PF09445Methyltransf_1547-80 aa
PF13489Methyltransf_2374-198 aa
PF05175MTS74-158 aa
PF13679Methyltransf_3282-145 aa
PF01209Ubie_methyltran83-197 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G447890PF02353CMAS4291.9e-1351.1
TkA05G447890PF02353CMAS231881.9e-1351.1
TkA05G447890PF00891Methyltransf_2331540.02814.5
TkA05G447890PF09445Methyltransf_1547800.08113.2
TkA05G447890PF13489Methyltransf_23741982.9e-1453.8
TkA05G447890PF05175MTS741580.009916.2
TkA05G447890PF13679Methyltransf_32821450.003118.2
TkA05G447890PF01209Ubie_methyltran831971.7e-0628.3
TkA05G447890PF01728FtsJ841580.009316.6
TkA05G447890PF07021MetW841620.1512.4
TkA05G447890PF13847Methyltransf_31862092.1e-1660.7
TkA05G447890PF09445Methyltransf_15881470.08113.2
TkA05G447890PF13649Methyltransf_25901841.4e-2074.5
TkA05G447890PF08241Methyltransf_11911898.5e-2278.3
TkA05G447890PF08242Methyltransf_12911861.4e-1248.9
TkA05G447890PF29244Methyltransf_ANTKMT921892.5e-0628.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZSK1拟南芥sp|Q9ZSK1|GTOMC_ARATH Tocopherol O-methyltransferase, chloroplastic71.000%Swiss-Prot高置信
Q6ZIK0水稻sp|Q6ZIK0|GTOMC_ORYSJ Probable tocopherol O-methyltransferase, chloroplastic76.200%Swiss-Prot高置信

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