TkA05G429100 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G429100

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 107027592-107036042 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3758 bp · TkA05G429100|TK1151|cDNA

CGGCCACCGTCGATCTGTGACGCGATACACGACATACTTCCCCCAACCACTTTGGATTAACCGTAAAATCGTAAATGATCAATTGACCAAACGCATATCTCCAAGGACATGCACACACGCAAGGCGCCATTAAAGAGAAAAACAGGAAGAATTATGAAGCAATAGGAACGACGGAGCTCGTGAAGCTTCAAATCTTACGCTATGTTTGCTAAATTATTTCACAAAACTCCGCAGCAACAATCATCACCGGAGGATGATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3336 bp · TkA05G429100|TK1151|CDS

ATGTTTGCTAAATTATTTCACAAAACTCCGCAGCAACAATCATCACCGGAGGATGATGATCCAAAATTGAAAGACTTTGAACCCCGCATTGTTGTTCATTATGGTATCCCAACTACTTCATCAATCCTGGCCTTTGATCCTCTTCAGCATTTACTAGCTATAGGCACACTGGATGGAAGAATAAAGGTGATTGGTGGTGATAACATTGAATGCATTTTAATATCTCCAAAACCAATACCCCTGAAAAACCTAGAGTTTTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1111 aa · TkA05G429100|TK1151|PROTEIN

MFAKLFHKTPQQQSSPEDDDPKLKDFEPRIVVHYGIPTTSSILAFDPLQHLLAIGTLDGRIKVIGGDNIECILISPKPIPLKNLEFFQNQGFLVSVSNENDIQVWDLEKRRLAANLQWGSNISAFSVVCGTNYMYVGDEYGYLSVLKYDFEEGSIQPMPYQIPPDLISDEGGVQIPDHQSVVGLLAQPCSSGKRVLIAYQNGLMFLWDVSEDKAILIRGPKDLQLKDEIVIRSTGEIKRETINNKPDEEQQTEKEISALC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G429100`
TK1151 ID	TkA05G429100
OH-1004 ID	LXL04_021845
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA05G429100`
位置	Chr05:107027592-107036042 (+)
描述	Similar to STXBP5L: Syntaxin-binding protein 5-like
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_021845` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006887 exocytosis 生物过程 GO:0006893 Golgi to plasma membrane transport 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0017157 regulation of exocytosis 生物过程 GO:0042593 glucose homeostasis 生物过程 GO:0045921 positive regulation of exocytosis 生物过程 GO:0050714 positive regulation of protein secretion 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0005892 acetylcholine-gated channel complex 细胞组分 GO:0030141 secretory granule 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	hsa:134957 hsa:9515 mmu:207227 rno:81022 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.568

排名 1 · TkA05G429100 · TK1151

细胞核0.233

排名 2 · TkA05G429100 · TK1151

高尔基体0.161

排名 3 · TkA05G429100 · TK1151

细胞膜0.146

排名 4 · TkA05G429100 · TK1151

溶酶体／液泡0.144

排名 5 · TkA05G429100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23414Beta-prop_EML_237-69 aa

PF24807WD40_CDC20-Fz40-64 aa

PF25173Beta-prop_WDR3_1st41-128 aa

PF25174Beta-prop_THOC341-122 aa

PF23341PEP5_VPS11_N41-111 aa

PF23775Beta-prop_RIG_2nd41-147 aa

PF23381Beta-prop_IFT122_1st42-147 aa

PF24817WD40_WDHD1_1st43-126 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G429100	`PF23414`	Beta-prop_EML_2	37	69	1.1e-13	52.0
TkA05G429100	`PF24807`	WD40_CDC20-Fz	40	64	1.1e-10	42.1
TkA05G429100	`PF25173`	Beta-prop_WDR3_1st	41	128	1e-15	58.6
TkA05G429100	`PF25174`	Beta-prop_THOC3	41	122	6.5e-10	39.2
TkA05G429100	`PF23341`	PEP5_VPS11_N	41	111	4.1e-05	23.6
TkA05G429100	`PF23775`	Beta-prop_RIG_2nd	41	147	0.00023	21.4
TkA05G429100	`PF23381`	Beta-prop_IFT122_1st	42	147	6.2e-17	62.6
TkA05G429100	`PF24817`	WD40_WDHD1_1st	43	126	1.9e-12	47.7
TkA05G429100	`PF12894`	ANAPC4_WD40	43	71	3.3e-11	44.0
TkA05G429100	`PF00400`	WD40	43	63	6.1e-10	39.9
TkA05G429100	`PF24796`	WDR55	43	145	3.5e-09	36.9
TkA05G429100	`PF24814`	WD40_Prp19	43	124	1.1e-06	28.6
TkA05G429100	`PF25175`	Beta-prop_WDR5	44	113	5.9e-06	26.5
TkA05G429100	`PF23756`	Beta-prop_HPS5	45	151	9.4e-09	35.7
TkA05G429100	`PF25171`	Beta-prop_WDR36-Utp21_1st	46	117	8.7e-11	42.5
TkA05G429100	`PF25168`	Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd	46	128	0.2	11.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

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