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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G421730
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 105116064-105120147 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1260 bp · TkA05G421730|TK1151|cDNA

ACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAATGGGGGAGAGAGAGGAGACTCCATCGAAGCCACCACACTTTGTGCTCATCCATGGTATAAGTGGAGGAAGTTGGTGTTGGTACAAGCTAAAAAGCATGATGTACAACTCAGGATACATGGTGACTTGCATAGACCTCAAAGGGGCAGGCATACATCCTTCTGACCCTAACACAATCC...

CDS

下载 CDS FASTA

801 bp · TkA05G421730|TK1151|CDS

ATGGGGGAGAGAGAGGAGACTCCATCGAAGCCACCACACTTTGTGCTCATCCATGGTATAAGTGGAGGAAGTTGGTGTTGGTACAAGCTAAAAAGCATGATGTACAACTCAGGATACATGGTGACTTGCATAGACCTCAAAGGGGCAGGCATACATCCTTCTGACCCTAACACAATCCTCTCCTTCGATGAATACAATGAACCTCTCCTTCATTTCTTATCTTCCTTGCCTCCTCATCAAAAGGTGATCTTAGTGGGGCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

266 aa · TkA05G421730|TK1151|PROTEIN

MGEREETPSKPPHFVLIHGISGGSWCWYKLKSMMYNSGYMVTCIDLKGAGIHPSDPNTILSFDEYNEPLLHFLSSLPPHQKVILVGHSAGGLSVTQATHKFSNKISLAVYVAGTMLKNGLLTEEDIKDGVPDLSEYGDAYDLKFGLGPNQPPTSATIKKDLQRKILYHTSSPEDYTLASMLLRPGPICALLNAQFPEVNEDVENVPRVYIKTLYDRVVKPEQQEKMIAKWPPSHVYSLESDHSPNFSSPFALFGLLVKVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G421730
TK1151 IDTkA05G421730
OH-1004 IDLXL04_021794
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 34.962 / OH-1004 29.524
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G421730
位置Chr05:105116064-105120147 (-)
描述Similar to MES17: Methylesterase 17
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g10870 甲酯酶，可高效且特异性地将吲哚-3-乙酸甲酯（MeIAA）水解为生长素吲哚-3-乙酸（IAA）。
Inactive methyl indole-3-acetic acid ester can be hydrolyzed and activated by several esterases belonging to the AtMES esterase family of Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.118224
At5g58310 甲酯酶，在体外显示具有甲基吲哚-3-乙酸（MeIAA）酯酶活性。 暂无已核实直接文献
At4g16690 通过在荧光叶绿素分解产物（FCCs）脱甲基中的作用，参与叶绿素的分解。
MES16, a member of the methylesterase protein family, specifically demethylates fluorescent chlorophyll catabolites during chlorophyll breakdown in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188870
Crystal structure of methylesterase family member 16 (MES16) from Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.04.115
At1g33990 推定甲基酯酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021794 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程
GO:0009696 salicylic acid metabolic process 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程
GO:0031408 oxylipin biosynthetic process 生物过程
GO:0033310 chlorophyll a catabolic process 生物过程
GO:0033473 indoleacetic acid conjugate metabolic process 生物过程
GO:0045727 positive regulation of translation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ag:BAE54383
ath:AT3G08720
ath:AT3G10870
ath:AT4G16690
ath:AT5G58310
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.751
排名 1 · TkA05G421730 · TK1151
细胞核0.335
排名 2 · TkA05G421730 · TK1151
内质网0.055
排名 3 · TkA05G421730 · TK1151
溶酶体／液泡0.049
排名 4 · TkA05G421730 · TK1151
细胞膜0.048
排名 5 · TkA05G421730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00561Abhydrolase_112-163 aa
PF12697Abhydrolase_614-251 aa
PF12146Hydrolase_414-118 aa
PF00975Thioesterase15-92 aa
PF00326Peptidase_S933-49 aa
PF10230LIDHydrolase38-116 aa
PF07819PGAP174-103 aa
PF03283PAE78-112 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G421730PF00561Abhydrolase_1121632.9e-1763.9
TkA05G421730PF12697Abhydrolase_6142511.2e-1559.4
TkA05G421730PF12146Hydrolase_4141183.5e-1143.6
TkA05G421730PF00975Thioesterase15920.212.5
TkA05G421730PF00326Peptidase_S933490.3311.1
TkA05G421730PF10230LIDHydrolase381160.04214.3
TkA05G421730PF07819PGAP1741030.04114.3
TkA05G421730PF03283PAE781120.1411.9
TkA05G421730PF06821Ser_hydrolase791170.05314.2
TkA05G421730PF00326Peptidase_S9801260.3311.1
TkA05G421730PF06821Ser_hydrolase1942340.05314.2
TkA05G421730PF00326Peptidase_S92092280.3311.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SG92拟南芥sp|Q9SG92|MES17_ARATH Methylesterase 1762.000%Swiss-Prot高置信
Q9LVL9拟南芥sp|Q9LVL9|MES18_ARATH Methylesterase 1847.100%Swiss-Prot中等置信
O23512拟南芥sp|O23512|MES16_ARATH pFDCC methylesterase MES1643.900%Swiss-Prot中等置信
Q9FVW3拟南芥sp|Q9FVW3|MES14_ARATH Putative methylesterase 14, chloroplastic34.100%Swiss-Prot中等置信

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