LXL04_021794 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_021794

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 137032007-137034477 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

948 bp · LXL04_021794|LXL04_021794|OH1004|cDNA

ATGTACTCAACGTCTCAACCTCATAAGCTGGACTCAGTTATAACTTATAAGCGGCAAATCGATAAAAAAATTCCTTCTTCGTCAGAACAACTTTTCTTCTACAGCGAATCCCATCGGCGATCTATCCTCAGAATCATTTCTCGCTGTGAGGATTTTATTTCCATTTTTTCTTTTCGATGTACAGTGTATCGTAAATTATCGATATGTTATTTGCGTGAAATTACATTGAAGAATTTCGACATAGAATTAGTGATCGATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

948 bp · LXL04_021794|LXL04_021794|OH1004|CDS

ATGTACTCAACGTCTCAACCTCATAAGCTGGACTCAGTTATAACTTATAAGCGGCAAATCGATAAAAAAATTCCTTCTTCGTCAGAACAACTTTTCTTCTACAGCGAATCCCATCGGCGATCTATCCTCAGAATCATTTCTCGCTGTGAGGATTTTATTTCCATTTTTTCTTTTCGATGTACAGTGTATCGTAAATTATCGATATGTTATTTGCGTGAAATTACATTGAAGAATTTCGACATAGAATTAGTGATCGATGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

315 aa · LXL04_021794|LXL04_021794|OH1004|PROTEIN

MYSTSQPHKLDSVITYKRQIDKKIPSSSEQLFFYSESHRRSILRIISRCEDFISIFSFRCTVYRKLSICYLREITLKNFDIELVIDVNWLNCMIFMISTSIGTSSVSCKAGNKNNFPFWILICLFSRFSGSTPFFTVDHVDFDFDFSDVFGPPPSPQQPSVTNTNELLVYDEPEVLCSRSHSLVGPTTFINQSLKLSIMALQELEESPFVDVVDDDNDDGSLDYTLASMLLRPGPICALLNAQFPEVNEDVENVPRVYIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_021794`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_021794

位置 Chr04:137032007-137034477 (-)

描述 Similar to MES17: Methylesterase 17

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g10870`	甲酯酶，可高效且特异性地将吲哚-3-乙酸甲酯（MeIAA）水解为生长素吲哚-3-乙酸（IAA）。	Inactive methyl indole-3-acetic acid ester can be hydrolyzed and activated by several esterases belonging to the AtMES esterase family of Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.118224
`At5g58310`	甲酯酶，在体外显示具有甲基吲哚-3-乙酸（MeIAA）酯酶活性。	暂无已核实直接文献
`At4g16690`	通过在荧光叶绿素分解产物（FCCs）脱甲基中的作用，参与叶绿素的分解。	MES16, a member of the methylesterase protein family, specifically demethylates fluorescent chlorophyll catabolites during chlorophyll breakdown in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188870 Crystal structure of methylesterase family member 16 (MES16) from Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.04.115
`At3g08720`	TOR 信号通路的下游效应器。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021794 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程

GO:0009696 salicylic acid metabolic process 生物过程

GO:0010150 leaf senescence 生物过程

GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程

GO:0031408 oxylipin biosynthetic process 生物过程

GO:0033310 chlorophyll a catabolic process 生物过程

GO:0033473 indoleacetic acid conjugate metabolic process 生物过程

GO:0045727 positive regulation of translation 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ag:BAE54383

ath:AT3G08720

ath:AT3G10870

ath:AT4G16690

ath:AT5G58310

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.442

排名 1 · LXL04_021794 · OH-1004

细胞质0.421

排名 2 · LXL04_021794 · OH-1004

内质网0.095

排名 3 · LXL04_021794 · OH-1004

细胞膜0.090

排名 4 · LXL04_021794 · OH-1004

线粒体0.088

排名 5 · LXL04_021794 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SG92`	拟南芥	Methylesterase 17	59.783%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9LVL9`	拟南芥	Methylesterase 18	38.281%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`O23512`	拟南芥	pFDCC methylesterase MES16	44.944%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q39030`	拟南芥	Serine/threonine-protein kinase AtPK2/AtPK19	37.500%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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