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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G421080
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 104918552-104921945 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1294 bp · TkA05G421080|TK1151|cDNA

TGGAACCCCTGCTTATTTTATCAAACCCCTCTTCTTCCACCTCCGGCTTCCAAAAGGATCGCCAATGGCTCTACTCCACCGATTTGGATGCTGTTCTCCTCCTTCTCCTCTTCCTCCTCTCTCATTCCAAAAGTCAACCTCCGGTTCCGACTCATACATCGTCTCTGCTTTTCAGCGCCGTGTCCTTTATCCGCGGAGATTTTCGTCGTTTAGATTAACCGCAACCCTCGCCGCTGAATCACCGGCCGGCTCTGTGTCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

972 bp · TkA05G421080|TK1151|CDS

ATGGCTCTACTCCACCGATTTGGATGCTGTTCTCCTCCTTCTCCTCTTCCTCCTCTCTCATTCCAAAAGTCAACCTCCGGTTCCGACTCATACATCGTCTCTGCTTTTCAGCGCCGTGTCCTTTATCCGCGGAGATTTTCGTCGTTTAGATTAACCGCAACCCTCGCCGCTGAATCACCGGCCGGCTCTGTGTCAGATGGCGGAGGTGGACCGCCGAAGCTGCTTATGGAAGTCAAGGACCTCACCGCCGTCATCGCTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

323 aa · TkA05G421080|TK1151|PROTEIN

MALLHRFGCCSPPSPLPPLSFQKSTSGSDSYIVSAFQRRVLYPRRFSSFRLTATLAAESPAGSVSDGGGGPPKLLMEVKDLTAVIAESGQKILNGVNLSIYEGEIHAIMGKNGSGKSTFAKVLVGHRDYEVTGGSVVFKGENLLEMEPEDRSLAGLFLSFQSPVEIPGVSNNDFLHMAYNARQRKLGQTELQPLEFYGHIRPILEMVNIKPDFLNRNVNEGFSGGEKKRNEILQLAVLGADLAILDEIDSGLDVDALRDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G421080
TK1151 IDTkA05G421080
OH-1004 IDLXL04_021787
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G421080
位置Chr05:104918552-104921945 (-)
描述Similar to ABCI6: ABC transporter I family member 6, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g10670 必需蛋白质。
AtNAP7 is a plastidic SufC-like ATP-binding cassette/ATPase essential for Arabidopsis embryogenesis.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0400799101

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021787 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:1990229 iron-sulfur cluster assembly complex 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0042626 ATPase-coupled transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G10670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.975
排名 1 · TkA05G421080 · TK1151
线粒体0.038
排名 2 · TkA05G421080 · TK1151
细胞核0.016
排名 3 · TkA05G421080 · TK1151
细胞质0.015
排名 4 · TkA05G421080 · TK1151
细胞膜0.011
排名 5 · TkA05G421080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00005ABC_tran93-247 aa
PF13555AAA_29100-120 aa
PF13481AAA_25100-124 aa
PF03193RsgA_GTPase102-132 aa
PF02463SMC_N103-120 aa
PF13304AAA_21105-155 aa
PF13401AAA_22105-265 aa
PF13175AAA_15105-123 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G421080PF00005ABC_tran932472.4e-2074.2
TkA05G421080PF13555AAA_291001200.005517.2
TkA05G421080PF13481AAA_251001240.3411.2
TkA05G421080PF03193RsgA_GTPase1021320.1312.8
TkA05G421080PF02463SMC_N1031209.4e-0729.2
TkA05G421080PF13304AAA_211051551.3e-0629.3
TkA05G421080PF13401AAA_221052650.06314.3
TkA05G421080PF13175AAA_151051230.1612.2
TkA05G421080PF01935DUF871071240.009416.8
TkA05G421080PF13671AAA_331071320.07614.0
TkA05G421080PF13238AAA_181081520.01716.3
TkA05G421080PF03266NTPase_11081230.05614.0
TkA05G421080PF02463SMC_N2042949.4e-0729.2
TkA05G421080PF03266NTPase_12302880.05614.0
TkA05G421080PF13304AAA_212412791.3e-0629.3
TkA05G421080PF13481AAA_252412660.3411.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CAF5拟南芥sp|Q9CAF5|AB6I_ARATH ABC transporter I family member 6, chloroplastic79.400%Swiss-Prot高置信

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