TkA05G410840 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA05G410840

当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 102203493-102205057 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1062 bp · TkA05G410840|TK1151|cDNA

GTCTTTAATCCTTCTCTACCTTTAATCTTCTCTTCTGAGGATCACCAAAACAAATCCAACAAGAAAACATGATTGCCATTTTGCATTTGGCTGTAGGATTAATGGGAAATGCTGCTTCATTTCTACTTTATATTGCTCCCATGTGGACTTTTGCTAGGGTCATAAGGAGAAAGAGCACGGAAGAATTCTCATATGTGCCTTACACGATTACCTTGTTGAATTGTCTTTTCTATACTTGGTACGGTTTGCCCGTTGTAAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

777 bp · TkA05G410840|TK1151|CDS

ATGATTGCCATTTTGCATTTGGCTGTAGGATTAATGGGAAATGCTGCTTCATTTCTACTTTATATTGCTCCCATGTGGACTTTTGCTAGGGTCATAAGGAGAAAGAGCACGGAAGAATTCTCATATGTGCCTTACACGATTACCTTGTTGAATTGTCTTTTCTATACTTGGTACGGTTTGCCCGTTGTAAGCTATGGATGGGAGAACTTCCCCATGATTACCATTAATGGCATTGGTATCCTTTTTGAGCTCTCATTCAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

258 aa · TkA05G410840|TK1151|PROTEIN

MIAILHLAVGLMGNAASFLLYIAPMWTFARVIRRKSTEEFSYVPYTITLLNCLFYTWYGLPVVSYGWENFPMITINGIGILFELSFIIIFIWFTSPKQKLKAVIMTTIVIIFFSTTALISTFLVHDHQARKRLVGSVGLIASVGMYASPLVVMKKVIETKSVEYMPFSLSLFSFVASALWLAYGLLGKDMLIAAPNLVGCPLGALQLALYCKYRNSVMEDPEEEWDVEKVDQKDSKQHLQIAVVTTEDHNIDGKMSQT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA05G410840`
TK1151 ID	TkA05G410840
OH-1004 ID	LXL04_021612
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA05G410840

位置 Chr05:102203493-102205057 (-)

描述 Similar to SWEET3: Bidirectional sugar transporter SWEET3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g53190`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献
`At1g21460`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0220700`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献
`Os05g0214300`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献
`UniProt: B8AYH1`	介导糖类穿越质膜的转运。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021612 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0008643 carbohydrate transport 生物过程

GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0051119 sugar transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G21460

ath:AT5G53190

dosa:Os01g0220700

dosa:Os01g0881300

dosa:Os05g0214300

osa:4324648

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.697

排名 1 · TkA05G410840 · TK1151

内质网0.116

排名 2 · TkA05G410840 · TK1151

细胞质0.102

排名 3 · TkA05G410840 · TK1151

溶酶体／液泡0.099

排名 4 · TkA05G410840 · TK1151

高尔基体0.058

排名 5 · TkA05G410840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17178MASE54-50 aa

PF08733PalH8-124 aa

PF03083MtN3_slv9-97 aa

PF14150YesK22-68 aa

PF26453DUF813258-90 aa

PF17178MASE575-118 aa

PF14150YesK78-124 aa

PF17370DUF539281-89 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA05G410840	`PF17178`	MASE5	4	50	6.1	7.2
TkA05G410840	`PF08733`	PalH	8	124	0.85	9.3
TkA05G410840	`PF03083`	MtN3_slv	9	97	2.7e-40	137.0
TkA05G410840	`PF14150`	YesK	22	68	0.2	12.6
TkA05G410840	`PF26453`	DUF8132	58	90	0.048	14.7
TkA05G410840	`PF17178`	MASE5	75	118	6.1	7.2
TkA05G410840	`PF14150`	YesK	78	124	0.2	12.6
TkA05G410840	`PF17370`	DUF5392	81	89	2.4	9.0
TkA05G410840	`PF17370`	DUF5392	99	165	2.4	9.0
TkA05G410840	`PF08733`	PalH	105	179	0.85	9.3
TkA05G410840	`PF17178`	MASE5	106	184	6.1	7.2
TkA05G410840	`PF03083`	MtN3_slv	133	215	2.7e-40	137.0
TkA05G410840	`PF26453`	DUF8132	133	184	0.048	14.7
TkA05G410840	`PF14150`	YesK	140	184	0.2	12.6
TkA05G410840	`PF17370`	DUF5392	159	212	2.4	9.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q6NQN5`	拟南芥	sp\|Q6NQN5\|SWET3_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET3	61.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q8L9J7`	拟南芥	sp\|Q8L9J7\|SWET1_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1	46.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5NAZ9`	水稻	sp\|Q5NAZ9\|SWT3B_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET3b	60.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q0DJY3`	水稻	sp\|Q0DJY3\|SWT3A_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET3a	44.900%	Swiss-Prot	中等置信
`B8AYH1`	水稻	sp\|B8AYH1\|SWT1B_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET1b	47.100%	Swiss-Prot	中等置信

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