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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G325770
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 80262970-80265263 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1444 bp · TkA05G325770|TK1151|cDNA

CAGCAGTCTAAGCACACACGTCCTTTTCAAAGCCTGCAAATATTCCCTCTTTCTTTCTGTTACTCCTCTGTTTTGATCGGTTCCAACAGTCCATTTCCACAATGTACGATAATTTGCAGGTTAAACACTGAAACAACGATCTAAAATGAAGGTTTTATTGAAGACATTGGAGTCCCTAAGACCCCTTGCAGTAACCAAGGCATGGGACTATTGCGTTGTTTGGAAGTTCGACGATGATCCTTCAGGGTATATCGAGTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

654 bp · TkA05G325770|TK1151|CDS

ATGAATCCATATCATTACCATCAAATTGTTCCTAAACTAGCGCATGGTAAAGAAATCATCAAGACTGAGCACAAGAACAAGATATGTAAAGAAGAATACAATTCAAAAAATCTTGTAACCGAAAGAAACCGAAGAAAGCGAATCAAAGATGGTCTCTACACTTTACGCGCTCTAGTCCCTCGAATCTCCAAGATGGATAAAGCTTCGATAGTTGGAGATGCGGTTGAGTACATAAAAGAGTTGGAAAAAAATGTTAAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

217 aa · TkA05G325770|TK1151|PROTEIN

MNPYHYHQIVPKLAHGKEIIKTEHKNKICKEEYNSKNLVTERNRRKRIKDGLYTLRALVPRISKMDKASIVGDAVEYIKELEKNVKQLQQELKELEQQDSKANDADVEVCKPKRAYSQTYSKPNSRVSNVSDLKKTEVQVEVHEIGARNFILKLIATINVMGFVRIMEIIDSLGVQVIDINVTTCNGCVLNVLNLEAKDKEDVAKSLKELLLTSWSS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G325770
TK1151 IDTkA05G325770
OH-1004 IDLXL04_020884
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 55.703
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G325770
位置Chr05:80262970-80265263 (+)
描述Similar to BHLH90: Transcription factor bHLH90
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g10610 转录因子 bHLH90。 暂无已核实直接文献
At2g16910 转录因子。 暂无已核实直接文献
At5g57150 转录因子 bHLH35。 暂无已核实直接文献
At1g12860 可能通过控制 SPCH、MUTE 和 FAMA 的连续作用在表皮中介导气孔分化。
SCREAM/ICE1 and SCREAM2 specify three cell-state transitional steps leading to arabidopsis stomatal differentiation.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.060848

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0120500 参与调控雄性生殖发育过程中绒毡层程序性细胞死亡（PCD）及降解的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020884 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0048653 anther development 生物过程
GO:0048654 anther morphogenesis 生物过程
GO:0048657 anther wall tapetum cell differentiation 生物过程
GO:0048658 anther wall tapetum development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003682 chromatin binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10610
ath:AT2G16910
dosa:Os02g0120500
osa:4328113
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.931
排名 1 · TkA05G325770 · TK1151
细胞质0.151
排名 2 · TkA05G325770 · TK1151
细胞膜0.029
排名 3 · TkA05G325770 · TK1151
内质网0.017
排名 4 · TkA05G325770 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA05G325770 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03462PCRF12-97 aa
PF26768YtrI_N14-39 aa
PF26585STX17_N24-55 aa
PF05549Allexi_40kDa31-122 aa
PF00010HLH39-82 aa
PF23177bHLH_IRO339-98 aa
PF23173bHLH_SAC5141-84 aa
PF26585STX17_N53-108 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G325770PF03462PCRF12970.969.9
TkA05G325770PF26768YtrI_N14390.2711.8
TkA05G325770PF26585STX17_N24550.2912.0
TkA05G325770PF05549Allexi_40kDa311220.2911.3
TkA05G325770PF00010HLH39826.9e-1245.7
TkA05G325770PF23177bHLH_IRO339987.3e-0627.0
TkA05G325770PF23173bHLH_SAC5141840.0005520.5
TkA05G325770PF26585STX17_N531080.2912.0
TkA05G325770PF09228Prok-TraM541330.1313.6
TkA05G325770PF13739PdaC601240.4712.3
TkA05G325770PF03310Cauli_DNA-bind681293.48.6
TkA05G325770PF08336P4Ha_N751150.02215.3
TkA05G325770PF12097DUF3573751530.09112.3
TkA05G325770PF26768YtrI_N761020.2711.8
TkA05G325770PF10975DUF2802781020.08113.8
TkA05G325770PF00010HLH881076.9e-1245.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WNR2拟南芥sp|Q0WNR2|BH090_ARATH Transcription factor bHLH9035.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZVX2拟南芥sp|Q9ZVX2|AMS_ARATH Transcription factor ABORTED MICROSPORES39.900%Swiss-Prot中等置信
Q2HIV9拟南芥sp|Q2HIV9|BH035_ARATH Transcription factor bHLH3530.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LPW3拟南芥sp|Q9LPW3|SCRM2_ARATH Transcription factor SCREAM263.800%Swiss-Prot低置信
Q6YUS3水稻sp|Q6YUS3|TDR_ORYSJ Transcription factor TDR28.300%Swiss-Prot低置信

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