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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G154670
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 40047747-40058229 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2458 bp · TkA05G154670|TK1151|cDNA

TATTAATTTGTGGTTGAGTAAAGATTTGAAAATGCATACAAGGAGAAGTGAAGATGTTTCGTTAGAAGAAGAAGAAGAACAAAACAACTCATTGCGATGCCGACAATCAGGCGATAGTGGCAGTGGTACCGTCACCGGTCGGTTTCTTATTCATCCACAAAATCGGTAATATTATTATCCACTTGTTTCAGTTTAAATTCACATGGTTATCCACATATATATTCAATTAATTAGTCACGGAAGATTTGAGATTTTGTTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1743 bp · TkA05G154670|TK1151|CDS

ATGGAGTTTTTTATCCATAAATGGCCGAGTAAAGATTTGAAAATGCATACAAGGAGAAGTGAAGATGTTTCGTTAGAAAAAGAAGAAGAACAAAACAACTCATTGCGATGTCGACAATCAGGCGATAGTGGCGATAGTGGCAGTGGTACCGTCACCGGTCGGTTTCTTATTCATCCACAAAATCGGTGGTATATAGCATGGAAGCAATTCATCTTGATATGGGCGATATACTCGTCGTTCTTCACACCCCTCGAGTTCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

580 aa · TkA05G154670|TK1151|PROTEIN

MEFFIHKWPSKDLKMHTRRSEDVSLEKEEEQNNSLRCRQSGDSGDSGSGTVTGRFLIHPQNRWYIAWKQFILIWAIYSSFFTPLEFGFCRGLPENLFLLDIAGQLAFFIDIVLHFFVTYKDSHSHLLVRSHNLIAIRYLKSRFLLDFMGCLPLDAIYKACNRLEPVRYLLWIRLSRALRVTEFFEELEKDIRINYLFTRIIKRFVVELYCTHTAACIFYYLATTLPPTKEGYTWIGSLKMGDYSYSQFREIDLWTRYITS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G154670
TK1151 IDTkA05G154670
OH-1004 IDLXL04_024848
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)64.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 88.793 / OH-1004 58.192
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G154670
位置Chr05:40047747-40058229 (+)
描述Similar to SKOR: Potassium channel SKOR
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g02850 高选择性外向整流钾通道。
Identification and disruption of a plant shaker-like outward channel involved in K+ release into the xylem sap.1998 · DOI: 10.1016/s0092-8674(00)81606-2
At5g37500 保卫细胞膜上的主要选择性向外整流钾通道。
The Arabidopsis outward K+ channel GORK is involved in regulation of stomatal movements and plant transpiration.2003 · DOI: 10.1073/pnas.0733970100
At2g26650 可能作为高选择性内向整流钾通道，介导低 K⁺ 条件下植物根部的钾吸收。
Regulated expression of Arabidopsis shaker K+ channel genes involved in K+ uptake and distribution in the plant.2003 · DOI: 10.1023/a:1022597102282
A protein kinase, interacting with two calcineurin B-like proteins, regulates K+ transporter AKT1 in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1016/j.cell.2006.06.011
A Ca(2)+ signaling pathway regulates a K(+) channel for low-K response in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0605129103
A protein phosphorylation/dephosphorylation network regulates a plant potassium channel.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0707912104
High-affinity K(+) transport in Arabidopsis: AtHAK5 and AKT1 are vital for seedling establishment and postgermination growth under low-potassium conditions.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.154369
A role for the AKT1 potassium channel in plant nutrition.1998 · DOI: 10.1126/science.280.5365.918
At4g32650 可能的入向整流钾通道调节（α）亚基。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0250600 可能的向外整流钾通道。 暂无已核实直接文献
Os04g0445000 可能的向外整流钾通道。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006811 monoatomic ion transport 生物过程
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0090333 regulation of stomatal closure 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26650
ath:AT3G02850
ath:AT5G37500
dosa:Os04g0445000
dosa:Os06g0250600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.710
排名 1 · TkA05G154670 · TK1151
细胞质0.162
排名 2 · TkA05G154670 · TK1151
内质网0.106
排名 3 · TkA05G154670 · TK1151
溶酶体／液泡0.072
排名 4 · TkA05G154670 · TK1151
高尔基体0.053
排名 5 · TkA05G154670 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520Ion_trans66-314 aa
PF07885Ion_trans_2254-310 aa
PF00027cNMP_binding406-489 aa
PF07292NID451-493 aa
PF13637Ank_4537-567 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G154670PF00520Ion_trans663144.4e-2795.5
TkA05G154670PF07885Ion_trans_22543105.1e-1039.8
TkA05G154670PF00027cNMP_binding4064892.5e-1247.3
TkA05G154670PF07292NID4514930.2212.8
TkA05G154670PF13637Ank_45375670.212.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M8S6拟南芥sp|Q9M8S6|SKOR_ARATH Potassium channel SKOR65.600%Swiss-Prot高置信
Q94A76拟南芥sp|Q94A76|GORK_ARATH Potassium channel GORK63.200%Swiss-Prot高置信
Q38998拟南芥sp|Q38998|AKT1_ARATH Potassium channel AKT133.700%Swiss-Prot中等置信
P92960拟南芥sp|P92960|KAT3_ARATH Potassium channel KAT339.900%Swiss-Prot中等置信
Q653P0水稻sp|Q653P0|KOR1_ORYSJ Potassium channel KOR165.400%Swiss-Prot高置信
Q7XUW4水稻sp|Q7XUW4|KOR2_ORYSJ Potassium channel KOR255.000%Swiss-Prot高置信

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