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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G081960
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 22193716-22196644 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2417 bp · TkA05G081960|TK1151|cDNA

GATGTGTAACAAAGAGATTCATTGCTCCATGATCTGCGGTGATGGAGGGAGAAATTGTTTTTTGGATAGCCTACTAGTCAAACATCGGTCGGAATGAAATTGAAATTCGTCCCAAACTCACATTCAATTTCCTATCAAAACCCTTATTAAATTCACGCGTAAATCACTACCATCTACAAGTAGTAGCAGTCATGAAATCCGTGTACAAGTCATCGTCATTGATATATACAACTTACAATTATTAACTTTAGTGTGAGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1728 bp · TkA05G081960|TK1151|CDS

ATGGGCGATACTGAGGAAGGAAACAGCGATATGATCCAAAGAGTACAATCTTCCTTCGGGACTTCATCATCATCGGTTCCTAAACAACAACCACCACAAAAGCCTGTTAATTTTAATCAACTCGATATACCTCAGTTGAACACAGCACAGTTTCGCGGCCAAACACGACAGTTTTCCCCAAATTACAACCTCGATAATAACAGTAAAAGAGTCGGAATCCCGCCATCTCACCCACAGTTTCCTCCGGTATCCCCTTACTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

575 aa · TkA05G081960|TK1151|PROTEIN

MGDTEEGNSDMIQRVQSSFGTSSSSVPKQQPPQKPVNFNQLDIPQLNTAQFRGQTRQFSPNYNLDNNSKRVGIPPSHPQFPPVSPYSQIPVTQSSGNTHKIGGSQSFNHTNQSPGPSHSRSLSQPSFFPLDSLPPLSPSPYRDSPSARSSDQVITDVPMEDRDTNSHSLLPPSSPSGRSNSGNFSRTENLPPRKAHRRSNSDIPFGFSTILQSSPPLIPLRTPNTLDRVTSSNNQSSKPIQLVKRESSWEKTGGEGNAEG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G081960
TK1151 IDTkA05G081960
OH-1004 IDLXL04_019733
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G081960
位置Chr05:22193716-22196644 (-)
描述Similar to POSF21: Probable transcription factor PosF21
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38900 转录因子，作为生殖发育、分生组织大小和植物生长的抑制因子。
Identification of novel transcriptional regulators of Zat12 using comprehensive yeast one-hybrid screens.2016 · DOI: 10.1111/ppl.12439
Functional characterization of the Arabidopsis transcription factor bZIP29 reveals its role in leaf and root development.2016 · DOI: 10.1093/jxb/erw347
At2g21230 转录因子，作为生殖发育、分生组织大小和植物生长的抑制因子。
Altered expression of the bZIP transcription factor DRINK ME affects growth and reproductive development in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1111/tpj.13264
At2g31370 推测具有激活作用的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0336200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。
RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100
Os09g0516200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。
Transcription factor RF2a alters expression of the rice tungro bacilliform virus promoter in transgenic tobacco plants.2001 · DOI: 10.1073/pnas.121186398
Functional analysis of RF2a, a rice transcription factor.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m304862200
RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100
RF2a, a bZIP transcriptional activator of the phloem-specific rice tungro bacilliform virus promoter, functions in vascular development.1997 · DOI: 10.1093/emboj/16.17.5247
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019733 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0090567 reproductive shoot system development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0048471 perinuclear region of cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21230
ath:AT2G31370
ath:AT2G40620
ath:AT4G38900
dosa:Os03g0336200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.963
排名 1 · TkA05G081960 · TK1151
细胞质0.132
排名 2 · TkA05G081960 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA05G081960 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA05G081960 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA05G081960 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28159CEP89248-549 aa
PF06005ZapB279-289 aa
PF03131bZIP_Maf405-485 aa
PF26095CC_Bre1420-495 aa
PF07716bZIP_2421-473 aa
PF00170bZIP_1424-482 aa
PF14662KASH_CCD431-521 aa
PF19579FtsL_2440-475 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G081960PF28159CEP892485490.01814.3
TkA05G081960PF06005ZapB2792891.89.8
TkA05G081960PF03131bZIP_Maf4054850.01117.0
TkA05G081960PF26095CC_Bre14204950.2812.2
TkA05G081960PF07716bZIP_24214737.5e-0833.0
TkA05G081960PF00170bZIP_14244821.1e-0938.9
TkA05G081960PF14662KASH_CCD4315210.009316.7
TkA05G081960PF19579FtsL_24404750.2512.0
TkA05G081960PF26666DUF82214414861.49.8
TkA05G081960PF06156YabA4464978.47.8
TkA05G081960PF07334IFP_35_N4474730.07113.9
TkA05G081960PF04102SlyX4474986.78.2
TkA05G081960PF06005ZapB4485071.89.8
TkA05G081960PF16559GIT_CC4514860.1612.4
TkA05G081960PF25014NET2A4525240.002118.7
TkA05G081960PF07889DUF16644575301.39.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H1F0拟南芥sp|Q8H1F0|BZP29_ARATH bZIP transcription factor 2958.200%Swiss-Prot高置信
Q9SIG8拟南芥sp|Q9SIG8|BZP30_ARATH bZIP transcription factor 3051.500%Swiss-Prot高置信
Q04088拟南芥sp|Q04088|POF21_ARATH Probable transcription factor PosF2143.700%Swiss-Prot低置信
Q6S4P4水稻sp|Q6S4P4|RF2B_ORYSJ Transcription factor RF2b71.800%Swiss-Prot低置信
Q69IL4水稻sp|Q69IL4|RF2A_ORYSJ Transcription factor RF2a70.200%Swiss-Prot低置信

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