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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G047270
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 12461739-12471425 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1501 bp · TkA05G047270|TK1151|cDNA

ATTTAAAAGCTACATCTCTTTTCTTTCCTGTAAAATGAAATCAAGACCACTGCACATACATCTTTCATGTCCTATAAATAGGCATAAAAACTGATATCCGATCAAACGGTCTCAACAGATTTGTATGCCTCGTAAGGCCCAAATTCAAGAAAGTTAAATCCCGAACTGAATCATCGGAAAATAAGTTCAAACATGACCGCTGGACCGATATTCTTGACGGAGTCTCCCCTCGCCGGAGATCTTTGTGCCTTGGTTTTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

750 bp · TkA05G047270|TK1151|CDS

ATGACCGCTGGACCGATATTCTTGACGGAGTCTCCCCTCGCCGGAGATCTTTGTGCCTTGGTTTTCTCCACTTGTATCGCACTCTCTCTGCTTCGATGCTTTGAAGAAACTGCAAAAAGAGGGATTTTCGATCAGAAACTAAACAGGAAGCTCGTGCATATAACAATTGGACTGGCATTCATGTTATGCTGGCCGCTCTTCAGTTCAGGCAGTCAAGGAGCATTCATTGCAGCTATTGTTCCCGGAGTGAACATAGTGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

249 aa · TkA05G047270|TK1151|PROTEIN

MTAGPIFLTESPLAGDLCALVFSTCIALSLLRCFEETAKRGIFDQKLNRKLVHITIGLAFMLCWPLFSSGSQGAFIAAIVPGVNIVKMLLIGNGIVKDEATVKSMSRFGDYRELLTGPLYYACTITLCCTVYWRTSPIAIAAMCNLCAGDGFADIIGRRFGKKKIPYNTDKSYAGTIAMASAGFIASVGYMYYFSIFGFVENSFEMVVGFLVASLTSALVESHPISTTLDDNLTVPLASLLAGILRNKS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G047270
TK1151 IDTkA05G047270
OH-1004 IDLXL04_019370
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.394 / OH-1004 98.790
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G047270
位置Chr05:12461739-12471425 (-)
描述Similar to Probable phytol kinase 3, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58560 激酶，参与脱落酸（ABA）信号的负调控。
Farnesol kinase is involved in farnesol metabolism, ABA signaling and flower development in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04572.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0832000 参与植物代谢中叶绿素降解产生的植醇的活化和再利用，包括生育酚的生物合成。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019370 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006720 isoprenoid metabolic process 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010189 vitamin E biosynthetic process 生物过程
GO:0016487 farnesol metabolic process 生物过程
GO:0048440 carpel development 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0010276 phytol kinase activity 分子功能
GO:0016301 kinase activity 分子功能
GO:0052673 prenol kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G58560
gmx:100788252
gmx:100793696
zma:732748
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.722
排名 1 · TkA05G047270 · TK1151
线粒体0.108
排名 2 · TkA05G047270 · TK1151
细胞质0.106
排名 3 · TkA05G047270 · TK1151
细胞核0.103
排名 4 · TkA05G047270 · TK1151
高尔基体0.078
排名 5 · TkA05G047270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14126DUF429353-107 aa
PF02313Fumarate_red_D63-108 aa
PF02313Fumarate_red_D178-220 aa
PF23858DUF7220199-246 aa
PF14126DUF4293203-203 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G047270PF14126DUF4293531070.01815.9
TkA05G047270PF02313Fumarate_red_D631080.1313.2
TkA05G047270PF02313Fumarate_red_D1782200.1313.2
TkA05G047270PF23858DUF72201992460.1213.4
TkA05G047270PF14126DUF42932032030.01815.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q67ZM7拟南芥sp|Q67ZM7|FOLK_ARATH Farnesol kinase, chloroplastic62.400%Swiss-Prot高置信
Q5N9J9水稻sp|Q5N9J9|PHYK2_ORYSJ Probable phytol kinase 2, chloroplastic67.500%Swiss-Prot高置信

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